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植物の環境ストレスに応答した非AUG開始型uORFによる翻訳調節機構の研究

Research Project

Project/Area Number 22KJ0031
Project/Area Number (Other) 21J21981 (2021-2022)
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeMulti-year Fund (2023)
Single-year Grants (2021-2022)
Section国内
Review Section Basic Section 38060:Applied molecular and cellular biology-related
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

平郡 雄太  北海道大学, 農学院, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2023-03-08 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000)
Fiscal Year 2023: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2022: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2021: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Keywords非AUG開始コドン / 上流ORF / ポリアミン生合成 / 翻訳制御 / 上流オープンリーディングフレーム(uORF) / 非AUG開始型コドン / 環境ストレス応答 / 植物の環境応答
Outline of Research at the Start

近年,真核生物の上流ORF(uORF)は非AUG開始コドンから翻訳されるものが多いことが明らかになってきた.研究代表者の研究により,シロイヌナズナの特定の非AUG開始型uORFでは乾燥ストレスに応答して翻訳開始効率が変化しタンパク質発現を調節することが示唆された.本研究では,種々の環境ストレス条件に応答して翻訳開始効率が変化することにより特定のタンパク質の発現を調節する非AUG開始型uORFをゲノムワイドに同定する.また,シス配列・トランス因子の同定によりその詳細なメカニズムを明らかにする.

Outline of Annual Research Achievements

ポリアミンは植物のストレス応答において重要な生体分子である.本研究では,シロイヌナズナにおけるゲノムワイドな探索によって同定された,ポリアミン合成酵素遺伝子に存在する非AUG開始コドンから始まる上流オープンリーディングフレーム(uORF)による翻訳制御機構とその生理学的役割について解析した.
令和3年度から4年度にかけて,葉肉プロトプラストを用いた一過的発現解析を行い,ポリアミン合成酵素遺伝子の非AUG開始型uORFが細胞内のポリアミンの濃度に応答してポリアミン合成酵素の翻訳を抑制するという負のフィードバック制御に関わることを明らかにした.また,このフィードバック制御には,最初に注目した非AUG開始型uORFのほかにも別の2つの非AUG開始型uORFとRNA二次構造が必要であることを明らかにした.さらに,これらのシス配列は他の植物種のオルソログにも見出され,オルソログの配列を用いた一過的発現解析により,他のいくつかの植物でも同様のフィードバック制御が存在することを明らかにした.
令和5年度はこの非AUG開始型uORFとRNA二次構造を破壊したシロイヌナズナを作出し,HPLC分析により内在のポリアミン量の測定を行った.その結果,このポリアミン合成酵素が直接関わる特定のポリアミン種のみが変異株において野生型株の約3.5倍に増加した.また,寒天培地での生育解析の結果,変異株の主根長および地上部の新鮮重量は有意に小さかった.これらのことは,非AUG開始型uORFとRNA二次構造が関わるフィードバック制御が特定のポリアミンの恒常性維持と植物体の正常な生育に必要であることを示唆するものである.
本研究の成果は,植物における非AUG開始型uORFによる翻訳制御機構とその生理学的意義についての知見を拡張し,また植物のストレス応答に重要なポリアミンの恒常性維持機構を明らかにしたことである.

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Upstream open reading frame-mediated upregulation of ANAC082 expression in response to nucleolar stress in Arabidopsis2023

    • Author(s)
      Sasaki S, Murakami T, Yasumuro M, Makita A, Oi Y, Hiragori Y, Watanabe S, Kudo R, Hayashi N, Ohbayashi I, Sugiyama M, Yamashita Y, Naito S, Onouchi H
    • Journal Title

      Plant Biotechnology

      Volume: 40 Issue: 1 Pages: 21-30

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.22.1215a

    • ISSN
      1342-4580, 1347-6114
    • Year and Date
      2023-03-25
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Genome-wide identification of Arabidopsis non-AUG-initiated upstream ORFs with evolutionarily conserved regulatory sequences that control protein expression levels2022

    • Author(s)
      Hiragori Yuta、Takahashi Hiro、Karino Taihei、Kaido Atsushi、Hayashi Noriya、Sasaki Shun、Nakao Kodai、Motomura Taichiro、Yamashita Yui、Naito Satoshi、Onouchi Hitoshi
    • Journal Title

      Plant Molecular Biology

      Volume: 111 Issue: 1-2 Pages: 37-55

    • DOI

      10.1007/s11103-022-01309-1

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 非AUG開始型上流ORFとRNA二次構造による翻訳制御を介したシロイヌナズナにおけるポリアミン合成のフィードバック機構2024

    • Author(s)
      平郡雄太, 安室美陽, 狩野泰平, 海藤篤, 崎浜靖子, 後藤優弥, 山下由衣, 内藤哲, 尾之内均
    • Organizer
      第65回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 非AUG開始型上流ORFとRNA二次構造による翻訳制御を介したポリアミン合成のフィードバック機構2023

    • Author(s)
      平郡雄太, 安室美陽, 狩野泰平, 海藤篤, 山下由衣, 内藤哲, 尾之内均
    • Organizer
      日本植物学会第87回大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Genome-wide identification of Arabidopsis non-AUG-initiated upstream ORFs with evolutionarily conserved regulatory sequences that control protein expression levels2023

    • Author(s)
      Yuta Hiragori, Hiro Takahashi, Taihei Karino, Atsushi Kaido, Noriya Hayashi, Shun Sasaki, Kodai Nakao, Yui Yamashita, Satoshi Naito, Hitoshi Onouchi
    • Organizer
      The 33rd International Conference on Arabidopsis Research
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 非AUG開始型上流ORFとRNA二次構造による翻訳制御を介したポリアミン合成のフィードバック機構2023

    • Author(s)
      平郡雄太,安室美陽,海藤篤,狩野泰平,山下由衣,内藤哲,尾之内均
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] シロイヌナズナのポリアミン合成酵素遺伝子の非AUG開始型uORFを介した翻訳制御2022

    • Author(s)
      平郡雄太,安室美陽,林憲哉,佐々木駿,山下由衣,内藤哲,尾之内均
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

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Published: 2021-05-27   Modified: 2024-12-25  

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