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ペプチド環化酵素SurEを用いた短鎖環状ペプチドの効率的合成法の開発

Research Project

Project/Area Number 22KJ0097
Project/Area Number (Other) 22J13818 (2022)
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeMulti-year Fund (2023)
Single-year Grants (2022)
Section国内
Review Section Basic Section 47050:Environmental and natural pharmaceutical resources-related
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

小林 雅和  北海道大学, 生命科学院, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2023-03-08 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
Fiscal Year 2023: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2022: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Keywordsラリアット型環状ペプチド / 酵素 / 生合成 / 生体触媒 / 環状ペプチド
Outline of Research at the Start

ペプチドの大環状化は、代謝安定性・膜透過性・標的特異性を向上させる重要な化学修飾である。しかしながら、化学合成によるペプチド環化反応は制御が難しく、有機溶媒の大量消費やC末端残基のエピメリ化による大幅な収率低下など供給面に多くの課題を抱えている。
本研究では、我々が独自に見出した新規ペプチド環化酵素PBP型チオエステラーゼを生体触媒として開発し利用することで、環状ペプチドを高収率・高純度で迅速に供給できる合成手法を確立する。

Outline of Annual Research Achievements

環状ペプチドは、その特有な3次元構造から高い代謝安定性や標的特異性が期待できるため、中分子医薬品シーズの中心的存在として注目を集めている。しかし、環状ペプチドの化学合成は反応制御が難しく、鎖状ペプチドの大環状化の際には、C末端残基のエピメリ化や競合する分子間縮合により収率が大幅に低下する等、供給面に多くの課題を抱えている。一方で、我々はこれまでに、放線菌により生産される非リボソーム型環状ペプチドsurugamide類の生合成から新しいタイプのペプチド環化酵素SurEを同定し、詳細な機能解析により本酵素のペプチド環化触媒としての有用性を明らかにしてきた。今年度では、前年度にて確立したエチレングリコールを利用した鎖状ペプチド基質の合成法と寛容な基質選択性を有するペプチド環化酵素SurEを活用したhead-to-side chain型環状ペプチド(ラリアット型ペプチド)の効率的な化学―酵素合成法の確立を目指し、研究に着手した。本研究は概ね予定通りに進捗し、酵素反応に用いる分岐型基質を高純度かつ高収率で調製できる合成手法を確立することに成功している。また、得られた基質の粗精製物を直接SurEの酵素反応に供することで、所望のラリアットペプチドを高化学選択的に酵素合成することに成功した。これにより、合成初期から終盤にかけて精製作業を一度も行うことなく、所望のラリアット型ペプチドを効率的に調製できる化学―酵素ハイブリッド合成法を確立することに成功した。さらに、本手法にセリン/スレオニンライゲーションを組み合わせることで、ラリアットペプチドの合成と後続の誘導体化をシームレスに実施できる手法を確立した。本研究成果は、ラリアット型ペプチドの効率的合成法を提供するだけでなく、化合物ライブラリーの構築やシード化合物の効率的な創出に貢献できることが期待される。

Report

(2 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Chemoenzymatic tandem cyclization for the facile synthesis of bicyclic peptides2024

    • Author(s)
      Kobayashi Masakazu、Onozawa Naho、Matsuda Kenichi、Wakimoto Toshiyuki
    • Journal Title

      Communications Chemistry

      Volume: 7 Issue: 1 Pages: 67-67

    • DOI

      10.1038/s42004-024-01147-w

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Streamlined chemoenzymatic synthesis of cyclic peptides by non-ribosomal peptide cyclases2023

    • Author(s)
      Kobayashi, M., Fujita, K., Matsuda, K.*, Wakimoto, T.*
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 145 Issue: 6 Pages: 3270-3275

    • DOI

      10.1021/jacs.2c11082

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 非リボソームぺプチド環化酵素を用いたhead-to-side chain型環状ペプチドの化学ー酵素合成2024

    • Author(s)
      小林雅和、松田研一、脇本敏幸
    • Organizer
      日本農芸化学会2024年度大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 非リボソームぺプチド環化酵素を用いたラリアット型環状ペプチドの化学ー酵素合成2024

    • Author(s)
      小林雅和、松田研一、脇本敏幸
    • Organizer
      日本薬学会第144年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 二環性ペプチドの化学-酵素合成2024

    • Author(s)
      小野澤菜帆、小林雅和、松田研一、脇本敏幸
    • Organizer
      日本薬学会第144年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 非リボソームぺプチド環化酵素を利用した 環状ペプチドの効率的な化学ー酵素合成法の開発2023

    • Author(s)
      小林雅和、市原凜太郎、小野澤菜帆、藤田慧、松田研一、脇本敏幸
    • Organizer
      第65回天然有機化合物討論会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 非リボソームぺプチド環化酵素を利用した 環状ペプチドの効率的な化学ー酵素合成法の開発2023

    • Author(s)
      小林雅和、藤田慧、松田研一、脇本敏幸
    • Organizer
      予知生合成科学第二回公開シンポジウム
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Streamlined chemoenzymatic synthesis of cyclic peptides by non-ribosomal peptide cyclases2023

    • Author(s)
      Kobayashi, M., Fujita, K., Matsuda, K., Wakimoto, T.
    • Organizer
      4th International Conference on Natural Product Discovery and Development in the Genomic Era
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 非リボソームペプチド環化酵素を利用した環状ペプチドの効率的な化学-酵素合成法の開発2023

    • Author(s)
      小林雅和, 藤田慧, 松田研一, 脇本敏幸
    • Organizer
      日本薬学会 第143年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 非リボソームペプチド環化酵素WolJの基質選択性に関する研究2023

    • Author(s)
      市原凛太朗, 小林雅和, 藤田慧, 松田研一, 脇本敏幸
    • Organizer
      日本薬学会 第143年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 環状ペプチドの効率的な化学-酵素合成方法2022

    • Inventor(s)
      脇本敏幸、松田研一、小林雅和
    • Industrial Property Rights Holder
      脇本敏幸、松田研一、小林雅和
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2022
    • Related Report
      2022 Annual Research Report

URL: 

Published: 2022-04-28   Modified: 2024-12-25  

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