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計測と数理解析から探る生化学反応を伴う細胞内の力学解明と生きた構成則の構築

Research Project

Project/Area Number 22KJ0208
Project/Area Number (Other) 22J00060 (2022)
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeMulti-year Fund (2023)
Single-year Grants (2022)
Section国内
Review Section Basic Section 90110:Biomedical engineering-related
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

齋藤 匠  東北大学, 医工学研究科, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2023-03-08 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords生体医工学 / 分子生体計測 / バイオメカニクス / 生体分子計測 / 光褪色後蛍光回復法 / 分子張力センサー / 細胞力学 / グルコース代謝
Outline of Research at the Start

細胞と力学という一見関係の無いように見える両者が、実は密接にかかわっている。例えば、周囲の力学環境に適応できない細胞は、炎症・癌化の原因となる。また、細胞分裂時の未発達なcytokinetic ringは、細胞分裂異常を来たすのはもちろんのこと、核分裂に伴う遺伝子情報にまで影響する。さらには、腸内のグルコース代謝メカニズム解明は、糖毒性起因の病理(典型的なⅡ型糖尿病)への基礎研究として重要である。したがって本研究課題は、細胞力学を上述のように単一細胞から個体内の組織まで幅広く捉え、それらを新たな学問として前進させるものである。

Outline of Annual Research Achievements

研究課題名「計測と数理解析から探る生化学反応を伴う細胞内の力学解明と生きた構成則の構築」のもと、線虫および分裂酵母を用いた分子計測実験および解析を行ってきた。特に本年度は、2022年度に実施した実験(光褪色後蛍光回復法を用いた線虫腸壁における蛍光グルコースの拡散計測)のデータ解析を行い、グルコースの拡散係数が水中よりも二桁遅いことを発見した。また、線虫腸内腔と腸細胞間の粘性層(brash border)がグルコースの貯蔵に寄与することを示した。本内容を取りまとめ、「Glucose stockpile in the intestinal apical brush border in C. elegans」と題してBiochemical and Biophysical Research Communicationsに投稿した。
また、これまで開発してきた光褪色後蛍光回復法の最新の研究をまとめた総説論文をJournal of Biomechanical Science and Engineeringに投稿した。
研究留学先(Yale University)ではDr. Julien Berro指導の下、分子スケールの力センサーの開発に携わっている。2023年度は分裂酵母における細胞分裂時の力計測に成功した。その内容に関してBiophysical Society Annual Meating 2024(Pennsylvania)にて口頭およびポスター発表を行った。現在はこの分子張力センサーの哺乳細胞での試験を行っている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初の年次計画である実験・計測とその解析を遂行し、学術誌への報告を行ったため。

Strategy for Future Research Activity

研究留学先(Yale University)にて分子スケールの力センサーの開発を行う。昨年度は分裂酵母における細胞分裂時の力計測に成功した。その内容をまとめるとともに学会誌への投稿を行う。また本研究をさらに発展させるために、哺乳細胞での検証を行う。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2024 2023 2022 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 4 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Glucose stockpile in the intestinal apical brush border in C. elegans2024

    • Author(s)
      Saito Takumi、Kikuchi Kenji、Ishikawa Takuji
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 706 Pages: 149762-149762

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2024.149762

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Advancing FRAP for cell studies: Where there is a new method, there is a new field2023

    • Author(s)
      SAITO Takumi、DEGUCHI Shinji
    • Journal Title

      Journal of Biomechanical Science and Engineering

      Volume: 18 Issue: 4 Pages: 23-00028-23-00028

    • DOI

      10.1299/jbse.23-00028

    • ISSN
      1880-9863
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] CM‐FRAP?Continuum Mechanics‐Based Fluorescence Recovery After Photobleaching2023

    • Author(s)
      Saito Takumi、Deguchi Shinji
    • Journal Title

      Current Protocols

      Volume: 3 Issue: 1

    • DOI

      10.1002/cpz1.655

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Long-Term Fluorescence Recovery After Photobleaching (FRAP)2023

    • Author(s)
      Saito Takumi、Matsunaga Daiki、Deguchi Shinji
    • Journal Title

      Mechanobiology: Methods and Protocols

      Volume: 2600 Pages: 311-322

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2851-5_21

    • ISBN
      9781071628508, 9781071628515
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Analysis of chemomechanical behavior of stress fibers by continuum mechanics-based FRAP2022

    • Author(s)
      Saito, T., Matsunaga, D., Deguchi, S.
    • Journal Title

      Biophysical Journal

      Volume: 121 Issue: 15 Pages: 2921-2930

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2022.06.032

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Long-term molecular turnover of actin stress fibers revealed by advection-reaction analysis in fluorescence recovery after photobleaching2022

    • Author(s)
      Saito, T., Matsunaga, D., Matsui, T.S., Deguchi, S.
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 17 Issue: 11 Pages: 276909-276909

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0276909

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] In vivo force measurements on formin Cdc12 using coiled-coil force sensors2024

    • Author(s)
      Saito Takumi, Ren Yuan, & Berro Julien
    • Organizer
      Biophysical Society Annual Meeting 2024
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 光褪色後蛍光回復法から探る生細胞内の力学が関わる分子交換(Revealing the mechanism of molecular turnover in living cells by fluorescence recovery after photobleaching)2022

    • Author(s)
      齋藤匠, 松永大樹, 出口真次
    • Organizer
      第34回バイオエンジニアリング講演会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Simultaneous measurement of intracellular flow and molecular turnover in stress fibers2022

    • Author(s)
      Takumi Saito, Daiki Matsunaga, Shinji Deguchi
    • Organizer
      9th World Congress of Biomechanics
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] New strategies for analyzing the spatial distribution of mechanical and chemical properties of individual cells2022

    • Author(s)
      Takumi Saito, Daiki Matsunaga, Shinji Deguchi
    • Organizer
      9th World Congress of Biomechanics - JSME-BED Outstanding Young Researcher Presentation
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Continuum mechanics-based FRAP in actin stress fibers2022

    • Author(s)
      Takumi Saito
    • Organizer
      Mechanical Science and Bioengineering Seminar
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Remarks] Biophysical Society Blog

    • URL

      https://www.biophysics.org/blog/revealing-complex-intracellular-turnover-mechanisms-1

    • Related Report
      2022 Annual Research Report

URL: 

Published: 2022-04-28   Modified: 2024-12-25  

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