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淡水貝類における概潮汐時計の獲得と汽水域進出の進化的基盤の解明

Research Project

Project/Area Number 22KJ0463
Project/Area Number (Other) 21J20682 (2021-2022)
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeMulti-year Fund (2023)
Single-year Grants (2021-2022)
Section国内
Review Section Basic Section 45020:Evolutionary biology-related
Research InstitutionChiba University

Principal Investigator

横溝 匠  千葉大学, 理学研究院, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2023-03-08 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000)
Fiscal Year 2023: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2022: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2021: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Keywords潮汐環境適応 / 概潮汐リズム / 概日リズム / 表現型可塑性 / トランスクリプトーム / 塩ストレス耐性 / 感潮域適応
Outline of Research at the Start

生物の体内時計は環境リズムとの同調に大きな役割を果たしている。感潮域への適応には潮汐サイクルに同調した生物リズムである概潮汐リズムの獲得が重要であると考えられる。本研究では、河川性巻貝のチリメンカワニナの活動リズムや遺伝子発現リズムを解析し、汽水域進出に伴う概潮汐リズムの獲得を実証する。また、トランスクリプトーム解析やRNAiなどの分子生物学手法を用いて、概潮汐リズムの適応的意義の解明とリズム発振に関わる遺伝子の探索を試みる。本研究は新規内在リズムの獲得が新規環境への適応・分布拡大に与える影響の解明につながることが期待される。

Outline of Annual Research Achievements

最終年度は、RNAiによるノックダウン実験を行ない、チリメンカワニナにおける概潮汐リズムを制御する遺伝子を探索することを目的とした。候補遺伝子は、トランスクリプトーム解析によって約12時間周期の発現リズムがあることが明らかになった遺伝子の中から選定した。一方で、一部の概日時計遺伝子が概潮汐リズムに関与しているという報告がなされたため(Kwiatkowski et al., 2023, Lin et al., 2023)概日時計遺伝子も重要な候補として実験を進めた。
概日時計遺伝子は季節によって発現パターンが変化することが知られているが、潮汐環境のもとでどのような季節性を示すのかについてはほとんど知見がない。そこで、RNAiの準備と並行して、感潮域集団と非感潮域集団における概日時計遺伝子の季節ごとの発現パターンを解析した。その結果、両集団において時計遺伝子の発現量は冬に低下することが示された。また、period遺伝子はどちらの集団でも冬に概日リズムが弱くなり、cycle遺伝子は感潮域集団において概日リズムが不明瞭な傾向にあった。以上のように、それぞれの集団における概日時計遺伝子の季節ごとの発現パターンをつかむことができた。
このデータを踏まえ、とくに集団間で発現リズムに大きな差がみられたcycle遺伝子に着目し、冬以外の季節に実験を行なうことを計画した。dsRNAiの合成が難航したものの、現在は定量PCRによってインジェクションによる発現抑制を検証する段階まで至った。しかし、行動観察までは行えなかったため、今後の実験として計画している。
期間全体の研究成果により、チリメンカワニナの感潮域適応には概潮汐リズムとその可塑性が重要な役割を果たしていることが示唆された。その遺伝基盤については、RNAi実験も含め、今後の研究によって明らかにできると期待している。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] Plasticity of circadian and circatidal rhythms in activity and transcriptomic dynamics in a freshwater snail2024

    • Author(s)
      Takumi Yokomizo and Yuma Takahashi
    • Journal Title

      Heredity

      Volume: in press Issue: 5 Pages: 267-274

    • DOI

      10.1038/s41437-024-00680-7

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Endogenous rhythm variation and adaptation to the tidal environment in the freshwater snail, Semisulcospira reiniana2022

    • Author(s)
      Yokomizo Takumi、Takahashi Yuma
    • Journal Title

      Frontiers in Ecology and Evolution

      Volume: 10 Pages: 1078234-1078234

    • DOI

      10.3389/fevo.2022.1078234

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] チリメンカワニナの内在リズムにおける概日・概潮汐周期の季節変動2024

    • Author(s)
      横溝 匠、高橋佑磨
    • Organizer
      日本生態学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Environment-dependent endogenous rhythms and transcriptomic differentiation in a freshwater snail.2023

    • Author(s)
      Takumi Yokomizo and Yuma Takahashi
    • Organizer
      Society for Molecular Biology and Evolution
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] チリメンカワニナにおける概日-概潮汐リズムの可塑性と遺伝子発現リズムの網羅的解析2023

    • Author(s)
      横溝 匠、高橋佑磨
    • Organizer
      日本生態学会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] The plastic shift in the endogenous rhythm in tidal adaptation of the freshwater snail.2022

    • Author(s)
      Yokomizo Takumi and Takahashi Yuma
    • Organizer
      European Biological Rhythms Society
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] チリメンカワニナの感潮域適応における活動リズムとトランスクリプトーム動態の可塑的変化2022

    • Author(s)
      横溝 匠、高橋佑磨
    • Organizer
      日本時間生物学会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Is the circatidal rhythm in the freshwater snail resulted from the adaptive evolution?2022

    • Author(s)
      横溝 匠、高橋佑磨
    • Organizer
      日本生態学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] チリメンカワニナの感潮域集団における概潮汐リズムと時計被制御経路の探索2021

    • Author(s)
      横溝 匠、高橋佑磨
    • Organizer
      日本進化学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] チリメンカワニナの感潮域進出による時計システムの変化2021

    • Author(s)
      横溝 匠、高橋佑磨
    • Organizer
      日本時間生物学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

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Published: 2021-05-27   Modified: 2024-12-25  

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