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γ-アミノ酸やδ-アミノ酸を含有する特殊環状ペプチドスクリーニング法の開発

Research Project

Project/Area Number 22KJ0868
Project/Area Number (Other) 22J12466 (2022)
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeMulti-year Fund (2023)
Single-year Grants (2022)
Section国内
Review Section Basic Section 37030:Chemical biology-related
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

三浦 敬  東京大学, 理学系研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2023-03-08 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
Fiscal Year 2023: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2022: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Keywordsペプチド / 特殊環状ペプチド / 非天然アミノ酸 / 翻訳 / γ-アミノ酸 / 阻害剤 / リボソーム / δ-アミノ酸
Outline of Research at the Start

γ-アミノ酸およびδ-アミノ酸は、天然生理活性ペプチドの部分構造に含まれることや、ペプチドの二次構造安定化への寄与が知られている。これらの非天然アミノ酸を含有するペプチドライブラリを構築し、スクリーニングを行うことにより、新規薬剤候補ペプチドの取得が可能になると期待される。本研究では、既存の特殊ペプチド翻訳合成法を改良し、ペプチドライブラリへのγ-アミノ酸およびδ-アミノ酸の翻訳導入を目指す。さらに、RaPID display法による標的結合ペプチドのセレクションを実施する。

Outline of Annual Research Achievements

薬剤候補ペプチドの探索において、構造多様性に富むペプチドライブラリを構築し、ハイスループットスクリーニングへと適用することが有効である。ペプチド鎖に非天然アミノ酸のγ-アミノ酸等を導入することで、タンパク質性アミノ酸のみからなるペプチドには見られない特殊な二次構造を誘起させることが可能であり、薬剤として必要なペプチダーゼ耐性や細胞膜透過性への寄与が期待される。中でも、γ-アミノ酸に加えてD-アミノ酸やβ-アミノ酸といった非天然アミノ酸を複数導入したペプチド(L-α/D-α/β/γ-ハイブリッドペプチド)は、ペプチダーゼ耐性のさらなる向上が期待される。そのうえ、L-α/D-α/β/γ-ハイブリッドペプチドライブラリは従来までのペプチドライブラリには成しえない構造多様性を持つことから、さらなる標的結合能や標的特異性の向上が期待される。昨年度までに最適化した翻訳系を用いて、本年度はL-α/D-α/β/γ-ハイブリッドペプチドライブラリを新規に作成し、RaPIDディスプレイによるスクリーニングを遂行した。
細胞膜受容体IFNGR1に対するスクリーニングの結果、標的結合能がナノモーラーレベルのL-α/D-α/β/γ-ハイブリッドペプチドが複数得られた。また、これらのペプチドはin vitroでIFNGR1/IFN-γタンパク質間相互作用を阻害すること確認された。さらに、含まれるγ-アミノ酸、D-アミノ酸、およびβ-アミノ酸はペプチダーゼ耐性や阻害活性に大きく寄与することが示された。したがって、本研究はペプチドスクリーニングにおける探索可能なケミカルスペースの拡大に貢献したうえに、構築された本ライブラリは今後多くの標的への応用が期待される。

Report

(2 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2024 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] オックスフォード大学/ニューカッスル大学/ダイアモンドライトソース(英国)

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] オックスフォード大学/ニューカッスル大学/ダイアモンドライトソース(英国)

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Journal Article] Cyclic β2,3-amino acids improve the serum stability of macrocyclic peptide inhibitors targeting the SARS-CoV-2 main protease2024

    • Author(s)
      Miura Takashi、Malla Tika R、Brewitz Lennart、Tumber Anthony、Salah Eidarus、Lee Kang Ju、Terasaka Naohiro、Owen C David、Strain-Damerell Claire、Lukacik Petra、Walsh Martin A、Kawamura Akane、Schofield Christopher J、Katoh Takayuki、Suga Hiroaki
    • Journal Title

      Bulletin of the Chemical Society of Japan

      Volume: 未定 Issue: 5

    • DOI

      10.1093/bulcsj/uoae018

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] In vitro selection of macrocyclic peptide inhibitors containing cyclic γ2,4-amino acids targeting the SARS-CoV-2 main protease2023

    • Author(s)
      Takashi Miura, Tika Malla, David Owen, Anthony Tumber, Lennart Brewitz, Michael McDonough, Eidarus Salah, Naohiro Terasaka, Takayuki Katoh, Petra Lukacik, Claire Strain-Damerell, Halina Mikolajek, Martin Walsh, Akane Kawamura, Christopher Schofield, Hiroaki Suga
    • Journal Title

      Nature Chemistry

      Volume: 15 Issue: 7 Pages: 998-1005

    • DOI

      10.1038/s41557-023-01205-1

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Ribosomal synthesis of macrocyclic D/L-α/β/γ-hybrid peptide libraries for discovery of IFNGR1 inhibitors2023

    • Author(s)
      Takashi Miura, Takayuki Katoh, Hiroaki Suga
    • Organizer
      13th International Peptide Symposium
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 環状γ-アミノ酸含有ペプチドを用いたSARS-CoV-2メインプロテアーゼ阻害剤のスクリーニング2023

    • Author(s)
      三浦敬, Tika Malla, David Owen, Anthony Tumber, Lennart Brewitz, Michael McDonough, Eidarus Salah, 寺坂尚紘, 加藤敬行, Petra Lukacik, Claire Strain-Damerell, Halina Mikolajek, Martin Walsh, Akane Kawamura, Christopher Schofield, 菅裕明
    • Organizer
      日本薬学会第143年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 環状γ-アミノ酸含有ペプチドライブラリの構築およびSARS-CoV-2メインプロテアーゼ阻害剤のスクリーニング2022

    • Author(s)
      三浦敬, Tika Malla, David Owen, Anthony Tumber, Lennart Brewitz, Michael McDonough, Eidarus Salah, 寺坂尚紘, 加藤敬行, Petra Lukacik, Claire Strain-Damerell, Halina Mikolajek, Martin Walsh, Akane Kawamura, Christopher Schofield, 菅裕明
    • Organizer
      第21回東京大学生命科学シンポジウム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Ribosomal synthesis of a peptide library containing cyclic γ-amino acids for discovery of SARS-CoV-2 main protease inhibitors2022

    • Author(s)
      Takashi Miura, Tika Malla, David Owen, Anthony Tumber, Lennart Brewitz, Michael McDonough, Eidarus Salah, Naohiro Terasaka, Takayuki Katoh, Petra Lukacik, Claire Strain-Damerell, Halina Mikolajek, Martin Walsh, Akane Kawamura, Christopher Schofield, Hiroaki Suga
    • Organizer
      第59回ペプチド討論会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] De novo macrocyclic peptide inhibitors containing cyclic γ-amino acids targeting the SARS-CoV-2 main protease2022

    • Author(s)
      Takashi Miura, Tika Malla, David Owen, Anthony Tumber, Lennart Brewitz, Michael McDonough, Eidarus Salah, Naohiro Terasaka, Takayuki Katoh, Petra Lukacik, Claire Strain-Damerell, Halina Mikolajek, Martin Walsh, Akane Kawamura, Christopher Schofield, Hiroaki Suga
    • Organizer
      Boulder Peptide Symposium
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2022-04-28   Modified: 2024-12-25  

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