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神経活動依存的な核内構造変化と長期記憶制御機構の同定

Research Project

Project/Area Number 22KJ1166
Project/Area Number (Other) 22J23284 (2022)
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeMulti-year Fund (2023)
Single-year Grants (2022)
Section国内
Review Section Basic Section 46010:Neuroscience-general-related
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

北西 祐貴  東京大学, 薬学系研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2023-03-08 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥3,400,000 (Direct Cost: ¥3,400,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Keywordsニューロン / エピジェネティクス / ヘテロクロマチン / 遺伝子発現制御 / 記憶 / HP1 / 神経活動
Outline of Research at the Start

動物の高次機能を司る脳の神経細胞について、神経伝達の長期増強/抑圧によって可塑性が生じることが記憶の形成に大事である。長期的な神経伝達の変化には核内の遺伝子発現が重要であることは知られているが、そのメカニズムの研究は少ない。我々は遺伝子発現の制御と密接に関わる主要な核内構造が神経活動前後で変化する可能性を見出し、その変化を数理的に解析するアルゴリズムを確立した。今後は次世代シーケンサーを使用した網羅的な解析と合わせることで遺伝子発現制御機構を解明し、核内構造を人為的に操作することによって記憶にどのように影響が及ぼされるか評価を行っていく予定だ。

Outline of Annual Research Achievements

動物の高次機能を司る脳のニューロンについて、神経伝達の長期増強/抑圧によって神経可塑性が生じることが記憶の形成に大事である。神経伝達が変化するメカニズムには短期間のシナプス局所的な変化がこれまで多く研究されてきた。しかしながら、長期的な神経伝達の変化には核における遺伝子の転写が重要であることは知られているものの、その基盤メカニズムについては研究が遅れている。
本期間では昨年度に実施した初代培養ニューロンにおける網羅的な遺伝子発現解析に加え、各種ヒストン修飾、及びクロマチン因子の結合プロファイルをChIP-seqにより明らかにした。更にHi-Cを使用したゲノムワイドなクロマチン構造変化の解析も進んでいる。次世代シーケンサーを使用した以上のデータを統合的に解釈した結果、長期的な神経伝達の変化につながる核内構造の変化とその分子メカニズムに迫ることができている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

昨年度まで得られていた各種シーケンシング技術による解析結果に本期間中に得られた大規模なシーケンスデータを統合することで、長期的な神経伝達の変化の分子的メカニズムに大きく迫ることができている。さらに、AAVをマウス脳内の特定領域にインジェクションすることにより生体内ニューロンの核構造を制御できる系も整いつつあり、記憶の分子メカニズムの理解にも大幅な進展が生まれている。
以上より、当初の計画以上に進展していると考える。

Strategy for Future Research Activity

これまで初代培養ニューロンにおいて見られていた核内構造の変化が、実際に生体脳内のニューロンにおいて記憶形成過程においても見られるかどうかを検討していく。さらに、これらの変化に重要なクロマチン因子を同定できていることから、AAVインジェクションによる特定脳領域におけるクロマチン因子の操作により実際に記憶へ影響が見られるかを評価する。

Report

(2 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2023 2022

All Journal Article (1 results) (of which Open Access: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] Changes of chromosomal architecture before establishment of chromosome territories revealed by recurrence plot reconstruction2022

    • Author(s)
      Yuki Kitanishi, Hiroki Sugishita, Yukiko Gotoh and Yoshito Hirata
    • Journal Title

      BioRxiv

      Volume: -

    • DOI

      10.1101/2021.05.20.444916

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Open Access
  • [Presentation] Investigation of neuronal activity-dependent changes in heterochromatin by HP12023

    • Author(s)
      Yuki Kitanishi, Daichi Kawaguchi, Yukiko Gotoh
    • Organizer
      EMBL (Brain & Genome)
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Investigation of neuronal activity-dependent changes in heterochromatin2023

    • Author(s)
      Yuki Kitanishi, Sakurako Ishikawa, Hiroki Sugishita, Daichi Kawaguchi, Yukiko Gotoh
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Three-dimensional chromatin architecture of early-stage mouse embryos reconstructed via recurrence plots2022

    • Author(s)
      Yuki Kitanishi, Hiroki Sugishita, Yukiko Gotoh and Yoshito Hirata
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting (SYSTEMS BIOLOGY: GLOBAL REGULATION OF GENE EXPRESSION)
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2022-04-28   Modified: 2024-12-25  

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