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魚はどのように陸に上がったか? ~水陸両適応の古代魚を用いた器官可塑性の解析~

Research Project

Project/Area Number 22KJ1274
Project/Area Number (Other) 21J21544 (2021-2022)
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeMulti-year Fund (2023)
Single-year Grants (2021-2022)
Section国内
Review Section Basic Section 45020:Evolutionary biology-related
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

木村 優希  東京工業大学, 生命理工学院, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2023-03-08 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000)
Fiscal Year 2023: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2022: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2021: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Keywords進化生物学 / 両生類 / 魚類 / ポリプテルス / ハイギョ / 陸上適応 / 生理学 / 発現解析 / 繊毛 / 高CO2 / 古代魚
Outline of Research at the Start

今から3.5億年前、魚は陸上へと進出した。水中と陸上を行き来するような魚にどういった形質が備わっていたのかは未だ不明な点が多く残されている。本研究では肺呼吸可能な現生の魚類である「ポリプテルス」に着目し、 陸上で飼育した個体の器官の遺伝子発現の変化を解析した。その解析結果を元に実施した走査型電子顕微鏡によるエラ表面の観察では、ポリプテルスのエラに繊毛が存在し、陸上環境では消失することなどを明らかにした。また、血中のナトリウムやアンモニアといった恒常性の維持に関わる物質の濃度の変化と併せて遺伝子発現の変化を見ることで、水陸両生魚がいかにして陸上で生存しているかを明らかにする。

Outline of Annual Research Achievements

約3.5億年前、一部の魚が陸上へと進出した。水中から陸上へと大きく異なる環境への適応が起きたにもかかわらず、化石記録から得られる情報は限定的である。本研究では古くからの硬骨魚類の形質を残す現生魚類を用い、陸上適応の遺伝的基盤の理解を目的としている。
水中で呼吸する魚においてエラは必須であるが、陸上進出に伴って消失していった。本研究では肺呼吸とエラ呼吸が両方可能な現生種、ポリプテルスに着目した。中でも陸上環境における恒常性維持機構に着目した。陸上環境においてはエラを通じた塩類の摂取やアンモニアの排泄が制限される。そこで、陸上飼育したポリプテルスが体内の塩類などの恒常性維持をどのように行っているかをRNA-seq解析や血液成分分析などを用いて明らかにした。まずポリプテルスが陸上環境においても血中の浸透圧やアンモニア濃度を維持していることを明らかにした。次に腎臓、肝臓、エラのRNA-seq解析を行った。腎臓において、ナトリウムを再吸収する機能が知られる上皮性ナトリウムチャネルの発現量が有意に増加していた。またアンモニアを尿中へ排泄するトランスポータの遺伝子発現量が有意に増加していた。このことから、ポリプテルスは陸上でエラからアンモニアを排泄する代わりにアンモニアを尿中へと排泄する戦略を取っていると考えられる。
両生類に最も近い魚であるハイギョと、ハゼなどの陸上に二次的に適応した種のケラチン遺伝子の解析を実施した。ハイギョにおいては両生類のケラチン遺伝子数に匹敵するほどのケラチン遺伝子の重複が見られたが、両生類のケラチンとは独立に重複したものであることが明らかになった。また、陸生ハゼでは近縁種の水棲ハゼと比べても変化はなかった。ケラチン遺伝子の大幅な重複は四肢動物に近い魚において繰り返し独立に起きたものと推察される。研究成果はGenes & Genetic Systemsに掲載された。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 3 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Unveiling the expansion of keratin genes in lungfishes: a possible link to terrestrial adaptation2023

    • Author(s)
      Kimura Yuki、Nikaido Masato
    • Journal Title

      Genes & Genetic Systems

      Volume: 98 Issue: 5 Pages: 249-257

    • DOI

      10.1266/ggs.23-00188

    • ISSN
      1341-7568, 1880-5779
    • Year and Date
      2023-10-01
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Plastic loss of motile cilia in the gills of Polypterus in response to high CO2 or terrestrial environments2023

    • Author(s)
      Kimura Yuki、Nakamuta Nobuaki、Nikaido Masato
    • Journal Title

      Ecology and Evolution

      Volume: 13 Issue: 4

    • DOI

      10.1002/ece3.9964

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Plastic loss of motile cilia in the internal gills of <i>Polypterus</i> in response to high CO<sub>2</sub> or terrestrial environments2022

    • Author(s)
      Kimura Yuki、Nakamuta Nobuaki、Nikaido Masato
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: -

    • DOI

      10.1101/2022.04.06.487418

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Open Access
  • [Presentation] 水陸両生魚・ポリプテルスの陸上環境における恒常性維持機構 (Homeostatic mechanism in the terrestrial environment of Polypterus)2024

    • Author(s)
      木村優希, 神田真司, 兵藤晋, 二階堂雅人
    • Organizer
      日本動物学会第94回大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] ハイギョゲノムから明らかにする水陸両生魚のケラチン遺伝子クラスタの拡大2023

    • Author(s)
      木村優希, 二階堂雅人
    • Organizer
      第3回日本遺伝学会春の分科会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 肺呼吸する古代魚・ポリプテルスの陸上環境における恒常性維持機構2023

    • Author(s)
      木村優希, 神田真司, 兵藤晋, 二階堂雅人
    • Organizer
      日本動物学会関東支部第75回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ハイギョにおけるケラチン遺伝子クラスタの拡大2022

    • Author(s)
      木村優希, 二階堂雅人
    • Organizer
      第2回日本遺伝学会春の分科会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Changes in gene expression and morphology of amphibious fish in terrestrial environments2021

    • Author(s)
      Kimura, Y., Nakamuta, N., Kanda, S., Hyodo, S. and Nikaido, M.
    • Organizer
      The 2nd AsiaEvo Conference
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 水陸両生魚・ポリプテルスは陸上環境でどのような変化を示すのか2021

    • Author(s)
      木村優希, 中牟田信明, 神田真司, 兵藤晋, 二階堂雅人
    • Organizer
      日本進化学会第23回東京大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 水陸両生の古代魚・ポリプテルスの陸上飼育に伴う遺伝子発現および形態の変化 -エラの繊毛と浸透圧調節に着目して-2021

    • Author(s)
      木村優希, 中牟田信明, 神田真司, 兵藤晋, 二階堂雅人
    • Organizer
      日本動物学会第92回大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

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Published: 2021-05-27   Modified: 2024-12-25  

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