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染色体複製起点へのヘリカーゼ導入機構:開始複合体の機能構造とその分子動態の解明

Research Project

Project/Area Number 22KJ2423
Project/Area Number (Other) 22J11077 (2022)
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeMulti-year Fund (2023)
Single-year Grants (2022)
Section国内
Review Section Basic Section 43050:Genome biology-related
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

吉田 竜星  九州大学, 薬学府, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2023-03-08 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
Fiscal Year 2023: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2022: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Keywords染色体DNA複製 / DnaA / DnaB / 両方向性複製 / in vitro再構成系 / 細菌 / 大腸菌 / 分子生物学 / 複合体動態 / ヘリカーゼ装着
Outline of Research at the Start

染色体DNA複製は複製起点から両方向に開始される。この基本的な原理がどのような分子機構によって支えられているのかは未だ解明されていない。その原因としては複製開始複合体が高次で動的な動態をもつため解析が困難であったことが大きい。しかしながら大腸菌では近年、複製開始複合体の高次構造解明が大きく進歩したことで、複製開始複合体が機能の異なる左側と右側の二つのサブ複合体から構成されることが明らかになった。また、左側複合体が複製起点の二重鎖DNAを一本鎖化する分子機構までが解明された。本研究では、複製開始複合体が一本鎖化したDNA部位へと複製ヘリカーゼを両方向に装着するまでの分子動態を解析する。

Outline of Annual Research Achievements

細菌の染色体DNA複製は染色体上の複製起点oriCから二つ逆向きに複製ヘリカーゼが装着されることで両方向に開始される。この基本的な原理がどのような分子機構によって支えられているのかは未だ解明されていない。その原因としては、oriC領域に形成される開始因子DnaAを主とする複製開始複合体が高次で動的な動態をもつため分子メカニズムの解析が困難であったことが大きい。しかしながら大腸菌では近年、複製開始複合体の高次構造解明が大きく進歩したことにより、この複合体が機能の異なる左側と右側の二つのDnaAサブ複合体から構成されることが明らかになった。その上、左側DnaAサブ複合体が複製起点の二重鎖DNAを一本鎖化する分子機構までが解明された。本研究では、この新たな進展を大いに活用して、複製開始複合体が一本鎖化したDNA部位へと複製ヘリカーゼを両方向に装着するまでの分子動態の解明を目的とした。まず、大腸菌および始原生物に近縁な高度好熱菌Thermotoga maritimaを用いた解析から、両方向性複製ヘリカーゼ装着の基盤となる複製起点開裂機構が細菌種間で高度に保存されうることを明らかにした。また、右側DnaAサブ複合体のプロトマー特異的な解析から、右側DnaAサブ複合体の一本鎖DNA結合による開裂領域の拡張がヘリカーゼ装着を促進することも見出した。さらに、左側および右側DnaAサブ複合体を特異的に変異させたoriCプラスミドの生化学的解析から、複製ヘリカーゼ装着における左側・右側DnaAサブ複合体の特異的な機能が示唆された。本研究における成果は論文・学会等で発表した。

Report

(2 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2023 2022

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Single-stranded DNA recruitment mechanism in replication origin unwinding by DnaA initiator protein and HU, an evolutionary ubiquitous nucleoid protein2023

    • Author(s)
      Yoshida Ryusei、Ozaki Shogo、Kawakami Hironori、Katayama Tsutomu
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 51 Issue: 12 Pages: 6286-6306

    • DOI

      10.1093/nar/gkad389

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Thermotoga maritima oriC involves a DNA unwinding element with distinct modules and a DnaA-oligomerizing region with a novel directional binding mode2023

    • Author(s)
      Lu Chuyuan、Yoshida Ryusei、Katayama Tsutomu、Ozaki Shogo
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 299 Issue: 7 Pages: 104888-104888

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2023.104888

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Concerted actions of DnaA complexes with DNA-unwinding sequences within and flanking replication origin oriC promote DnaB helicase loading2022

    • Author(s)
      Sakiyama Yukari、Nagata Mariko、Yoshida Ryusei、Kasho Kazutoshi、Ozaki Shogo、Katayama Tsutomu
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 298 Issue: 6 Pages: 102051-102051

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2022.102051

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 細菌染色体の複製開始機構において複製起点が一本鎖へと開裂される普遍分子メカニズムの探究2023

    • Author(s)
      吉田竜星、尾崎省吾、川上広宣、片山勉
    • Organizer
      第27回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 大腸菌oriC-IHF-DnaA-DnaB-DnaC複合体の動態と新たな制御メカニズム2023

    • Author(s)
      片山勉、鶴田匠、呉沁霏、興梠和真、吉田竜星、加生和寿、尾崎省吾
    • Organizer
      第27回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 細菌染色体の複製開始の分子機構:多様性に潜む普遍性2023

    • Author(s)
      片山勉、吉田竜星、盧楚元、鶴田匠、若杉泰敬、加生和寿、尾崎省吾
    • Organizer
      日本遺伝学会第95回大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] A common insight into mechanisms of duplex unwinding at the origin DNA during eubacterial chromosome replication2023

    • Author(s)
      Shogo Ozaki, Chuyuan Lu, Ryusei Yoshida, Yasutaka Wakasugi, and Tsutomu Katayama
    • Organizer
      第96回日本生化学会大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 細菌の染色体DNA複製起点において複製ヘリカーゼを両方向に装着する分子機構の解析2023

    • Author(s)
      吉田竜星、尾崎省吾、加生和寿、片山勉
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] バクテリア界における染色体複製起点の開裂反応の共通原理:核様体タンパク 質 HU と DnaA に依存した複製起点開裂の分子機構2022

    • Author(s)
      吉田竜星、尾﨑省吾、川上広宣 、片山勉
    • Organizer
      第18回 21世紀大腸菌研究会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 細菌染色体の複製開始機構において複製起点が一本鎖へと開裂される普遍分子メカニズムの探究2022

    • Author(s)
      吉田竜星、尾﨑省吾、川上広宣 、片山勉
    • Organizer
      日本生化学会 第95回日本生化学大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Mechanisms for bacterial origin unwinding mediated by DnaA and HU, a ubiquitous nucleoid-associated protein.2022

    • Author(s)
      Ryusei Yoshida, Shogo Ozaki, Hironori Kawakami, and Tsutomu Katayama
    • Organizer
      NIG International Symposium 2022
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Diversity and conservation in the initiation mechanisms of the Escherichia coli replication origin oriC2022

    • Author(s)
      Tsuomu Katayama, Ryusei Yoshida, Chuyuan Lu, Kazuma Korogi, Takumi Tsuruda, Kazutoshi Kasho, Shogo Ozaki
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 大腸菌染色体の開始複合体における複製ヘリカーゼ装着の多様な分子機構2022

    • Author(s)
      片山 勉, 吉田竜星, 鶴田 匠, 興梠和真, 加生和寿, 尾崎省吾
    • Organizer
      日本遺伝学会第94回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report

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Published: 2022-04-28   Modified: 2024-12-25  

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