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分子空間固定型ネガマイシンの標的分子同定と論理的リードスルー創薬への展開

Research Project

Project/Area Number 22KJ2791
Project/Area Number (Other) 21J23350 (2021-2022)
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeMulti-year Fund (2023)
Single-year Grants (2021-2022)
Section国内
Review Section Basic Section 47010:Pharmaceutical chemistry and drug development sciences-related
Research InstitutionTokyo University of Pharmacy and Life Science

Principal Investigator

大村 紀子  東京薬科大学, 薬学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2023-03-08 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000)
Fiscal Year 2023: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2022: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2021: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Keywordsリードスルー / ナンセンス変異 / 遺伝性疾患 / ネガマイシン
Outline of Research at the Start

ナンセンス変異性疾患は、構造遺伝子中に未熟終止コドン(PTC)が生じ、機能不全のタンパク質が生成することにより発症する。申請者は、PTCを読み飛ばす(リードスルー)活性を有する(+)-ネガマイシンに着目した構造活性相関研究により、既存の誘導体とは異なる新規骨格をもつ分子空間固定型ネガマイシンの獲得に至った。
本研究では、ナンセンス変異型遺伝性疾患の新規治療戦略の確立を目指し、分子空間固定型ネガマイシン誘導体を基盤とした創薬化学研究を展開するとともに、ネガマイシン誘導体の標的分子同定を達成する。そして、標的分子の立体構造に基づいた論理的薬物設計により、さらに高活性な医薬品候補化合物の獲得を図る。

Outline of Annual Research Achievements

ナンセンス変異性疾患は、構造遺伝子中に未熟終止コドン(PTC)が生じ、機能不全の不完全長タンパク質が生成することにより発症する。近年、PTCを読み飛ばす(リードスルー)ことで、機能を持つ完全長タンパク質を生成させる方法が注目を集めている。ネガマイシンは1970年に放線菌より単離同定され、PTCを読み飛ばす(リードスルー)ことが報告されている。これまで、申請者はネガマイシンに着目した創薬研究を展開し、強力なリードスルー活性を有する誘導体TCP-304の独自開発に成功している。一方、ネガマイシン誘導体の作用メカニズムは未解明であり、本創薬研究の課題となっている。そこで本研究では、TCP-304を先導化合物とした構造活性相関研究の継続により、さらに高活性な誘導体を得るとともに、ネガマイシンの作用標的同定をめざしたケミカルバイオロジー研究を展開した。
その結果、まずTCP-304を基盤とした誘導体合成により、TCP-304の2.5倍強いリードスルー活性を有する誘導体TCP-306をはじめとする複数の新規高活性誘導体の獲得に成功した。
ネガマイシンの作用標的同定研究においては、ネガマイシン誘導体に光親和性官能基を修飾した化学プローブを新たに合成し、細胞抽出液を用いたプルダウンアッセイを実施したが、誘導体に由来する特異的な標的分子の同定には至らなかった。
一方、誘導体のリードスルー活性評価の過程において、リードスルーの起こりやすさ(リードスルー効率)がPTCの種類とその周辺の塩基配列に影響を受けることが示唆された。そこで、リードスルーのメカニズム解明研究の一端として、ネガマイシン誘導体TCP-306がリードスルーを起こしやすい遺伝子配列的特徴(リードスルー特性)を調査した。その結果、ネガマイシン誘導体のリードスルー特性がアミノグリコシド系抗生物質のそれとは異なることを新たに見出した。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2023 2022 2021

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results)

  • [Journal Article] Development of Conformationally Restricted Negamycin Derivatives for Potent Readthrough Activity2023

    • Author(s)
      Omura Noriko、Taguchi Akihiro、Kuwahara Tomoki、Hamada Keisuke、Watanabe Mizuki、Nakakuki Masanori、Konno Sho、Takayama Kentaro、Taniguchi Atsuhiko、Nomura Toshifumi、Shuto Satoshi、Hayashi Yoshio
    • Journal Title

      ACS Medicinal Chemistry Letters

      Volume: 14 Issue: 12 Pages: 1807-1814

    • DOI

      10.1021/acsmedchemlett.3c00424

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Readthrough Activity of Negamycin Derivatives against TP53 Nonsense Mutant2023

    • Author(s)
      Noriko Omura, Ayaka Ema, Akihiro Taguchi, Keisuke Hamada, Sho Konno, Kentaro Takayama, Atsuhiko Taniguchi and Yoshio Hayashi
    • Organizer
      28th American Peptide Symposium
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 分子空間固定型ネガマイシン誘導体の創製と筋ジストロフィー由来ナンセンス変異に対するリードスルー特性評価2023

    • Author(s)
      大村 紀子、田口 晃弘、桑原 智希、濵田 圭佑、渡邉 瑞貴、中久木 正則、今野 翔、高山 健太郎、谷口 敦彦、乃村 俊史、周東 智、林 良雄
    • Organizer
      第 40 回メディシナルケミストリーシンポジウム
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 筋ジストロフィー由来ナンセンス変異に対するネガマイシン誘導体のリードスルー効率2023

    • Author(s)
      大村 紀子、田口 晃弘、濵田 圭佑、今野 翔、谷口 敦彦、林 良雄
    • Organizer
      3.日本薬学会第143年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 3-エピデオキシネガマイシンの分子空間固定が及ぼすリードスルー活性への影響2022

    • Author(s)
      大村紀子、田口晃弘、濵田圭佑、桑原智希、渡邉瑞貴、中久木正則、今野翔、高山健太郎、谷口敦彦、乃村俊史、周東智、林良雄
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第16回年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Readthrough Effect of a Nonsense Mutation in p53 Tumor Suppressor Gene by Negamycin Derivatives2022

    • Author(s)
      Noriko Omura, Ayaka Ema, Akihiro Taguchi, Keisuke Hamada, Sho Konno, Kentaro Takayama, Atsuhiko Taniguchi, Yoshio Hayashi
    • Organizer
      第59回ペプチド討論会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Effect of Conformational Restriction of 3-epi-Deoxynegamycin on Readthrough Activity2022

    • Author(s)
      Noriko Omura, Akihiro Taguchi, Keisuke Hamada, Tomoki Kuwahara, Mizuki Watanabe, Masanori Nakakuki, Sho Konno, Kentaro Takayama, Atsuhiko Taniguchi, Toshifumi Nomura, Satoshi Shuto, Yoshio Hayashi
    • Organizer
      36th European Peptide Symposium/12th International Peptide Symposium
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 分子空間固定型ネガマイシンの合成とそのリードスルー活性評価2022

    • Author(s)
      大村 紀子、田口 晃弘、濵田 圭佑、桑原 智希、渡邉 瑞貴、中久木 正則、今野 翔、高山 健太郎、谷口 敦彦、乃村 俊史、周東 智、林 良雄
    • Organizer
      日本薬学会第142年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] ネガマイシン3位アミノ基誘導体の創製と各種遺伝性疾患に対するリードスルー効果の検討2021

    • Author(s)
      大村 紀子、濵田 圭佑、田口 晃弘、今野 翔、高山 健太郎、谷口 敦彦、林 良雄
    • Organizer
      創薬懇話会2021 in 京都
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] DEVELOPMENT OF CONFORMATIONALLY RESTRICTED NEGAMYCIN DERIVATIVES FOR POTENT READTHROUGH ACTIVITY2021

    • Author(s)
      Noriko Omura, Akihiro Taguchi, Keisuke Hamada, Tomoki Kuwahara, Mizuki Watanabe, Masanori Nakakuki, Sho Konno, Kentaro Takayama, Atsuhiko Taniguchi, Toshifumi Nomura, Satoshi Shuto, Yoshio Hayashi
    • Organizer
      第58回ペプチド討論会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Structure-Activity Relationship Study Focusing on 3-epi-Deoxynegamycin for Readthrough Activity2021

    • Author(s)
      Noriko Omura, Akihiro Taguchi, Keisuke Hamada, Tomoki Kuwahara, Mizuki Watanabe, Masanori Nakakuki, Sho Konno, Kentaro Takayama, Atsuhiko Taniguchi, Toshifumi Nomura, Satoshi Shuto, Yoshio Hayashi
    • Organizer
      13th AFMC INTERNATIONAL MEDICINAL CHEMISTRY SYMPOSIUM
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research

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Published: 2021-05-27   Modified: 2024-12-25  

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