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膜コンタクトサイトから明らかにする新たなゴルジ体―トランスゴルジ網間積荷輸送機構

Research Project

Project/Area Number 22KJ3129
Project/Area Number (Other) 21J00910 (2021-2022)
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeMulti-year Fund (2023)
Single-year Grants (2021-2022)
Section国内
Review Section Basic Section 44010:Cell biology-related
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

清水 優太朗  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2023-03-08 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywordsシロイヌナズナ / オルガネラ / 膜交通 / トランスゴルジ網 / ゴルジ体 / 植物
Outline of Research at the Start

トランスゴルジ網(TGN)は、小胞体で合成されたタンパク質をゴルジ体を介して受け取り、それらを細胞膜や液胞などの目的地に仕分けて輸送する重要な細胞小器官である。一般的にTGNはゴルジ体に隣接して存在しており、ゴルジ体が成熟した結果生じると考えられている。しかしながら、このゴルジ体成熟モデルでは説明できない事実が数多く報告されており、その形成機構およびゴルジ体-TGN間におけるタンパク質輸送機構についての理解は進んでいない。本研究では、顕微鏡下で観察が容易な植物細胞のゴルジ体とTGNに着目し、細胞生化学的手法やケミカルバイオロジーの手法を用いてこれら分子機構の解明に迫る。

Outline of Annual Research Achievements

トランスゴルジ網(TGN)はゴルジ体から運ばれてきた積荷タンパク質やエンドサイトーシスされた積荷タンパク質を選別し最終目的地へ送り出す重要なオルガネラである。TGNまでの輸送経路である小胞体からゴルジ体、そしてゴルジ体間の積荷タンパク質輸送機構についてはよく研究されており、それらの輸送機構がゴルジ体-TGN間に適用されると考えられているものの、実際にはゴルジ体-TGN間でどのように積荷タンパク質が輸送されているのかについて十分な知見はない。本研究課題の目的は、植物細胞を対象に、細胞生化学的手法とケミカルスクリーニングを駆使し、ゴルジ体とトランスゴルジ網間における積荷タンパク質輸送機構を明らかにすることである。申請者らはこれまでに、大半のTGNがゴルジ体に隣接して存在する一方でゴルジ体とTGNが頻繁に解離する現象を明らかにしてきた。このゴルジ体とTGNの接着・解離により生じるオルガネラ境界面こそが効率的な積荷タンパク質の輸送に重要であるとの仮説のもと、それらを実現する因子の同定とその生理学的役割を明らかにすることが本研究の目的である。 ゴルジ体マーカーとTGNマーカーの局在関係に影響を与える化合物スクリーニングをおこなったが、適切なヒット化合物を得ることはできなかった。細胞生化学的手法として、ゴルジ体あるいはTGNに局在するタンパク質に近位依存性ビオチン標識酵素を融合した植物体を作出し、LC-MS/MS によりプロテオームを比較した。得られたプロテオームからゴルジ体とTGN間で繋留因子として機能すると考えられる解析候補タンパク質群を多数同定した。一部の解析候補タンパク質に蛍光タンパク質を融合して細胞内局在を解析し、それらがゴルジ体とTGNに局在することを確認した。今後はこれら解析候補タンパク質群の異体遺伝学的・生化学的解析を進めていく予定である。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2023 2022 2021

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] 最先端イメージングで迫るトランスゴルジ網の積荷選別機構2022

    • Author(s)
      SHIMIZU Yutaro、UEMURA Tomohiro
    • Journal Title

      KAGAKU TO SEIBUTSU

      Volume: 60 Issue: 5 Pages: 215-217

    • DOI

      10.1271/kagakutoseibutsu.60.215

    • ISSN
      0453-073X, 1883-6852
    • Year and Date
      2022-05-01
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The sorting of cargo proteins in the plant trans-Golgi network2022

    • Author(s)
      Shimizu Yutaro、Uemura Tomohiro
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 13 Pages: 957995-957995

    • DOI

      10.3389/fpls.2022.957995

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Dynamic behavior of VAMP727 between the trans-Golgi network and the RAB5-positive endosome in Arabidopsis2023

    • Author(s)
      Yutaro Shimizu, Shinya Hagihara, Akihiko Nakano, Tomohiro Uemura
    • Organizer
      23rd Meeting of the European Network for Plant Endomembrane Research
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ゴルジ体ートランスゴルジ網間の物理的接着および積荷輸送に関わるタンパク質の探索2023

    • Author(s)
      清水 優太朗、萩原 伸也、中野 明彦、植村 知博
    • Organizer
      第10回日本エンドメンブレンミーティング
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 膜交通経路分岐の場トランスゴルジ網における積荷選別の可視化解析2023

    • Author(s)
      清水 優太朗、中野 明彦、植村 知博
    • Organizer
      第26回植物オルガネラワークショップ
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Improving efficiency of the Agrobacterium-mediated transformation by drugs2023

    • Author(s)
      Yutaro Shimizu, Kotaro Nishiyama, Jekson Robertlee, Shigeo S. Sugano, Shinya Hagihara
    • Organizer
      The 65th Annual Meeting of the Japanese Society of Plant Physiologists
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 塩ストレス応答におけるNHX5/6の局在解析2023

    • Author(s)
      井上柚紀、清水優太朗、伊藤瑛海、中野明彦、植村知博
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] トランスゴルジ網と多胞体間における積荷タンパク質輸送の可視化解析2022

    • Author(s)
      清水優太朗、植村知博、中野明彦
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Syntaxin6N末端領域を有する植物固有タンパク質の生理機能に関する研究2022

    • Author(s)
      東出さら、長尾レイナ、伊藤瑛海、伊藤容子、清水優太朗、由良敬、中野明彦、植村知博
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Syntaxin6 N末端領域を有する植物固有タンパク質の細胞内局在の解析2021

    • Author(s)
      長尾レイナ、清水優太朗、藤倉崇紘、伊藤瑛海、由良敬、中野明彦、植村知博
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] TGNー液胞間の輸送が制御する塩ストレス応答2021

    • Author(s)
      井上柚紀、清水優太朗、伊藤瑛海、中野明彦、植村知博
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

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Published: 2021-05-27   Modified: 2024-12-25  

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