High resolution analysis of 3D chromatin structures in innate immune responses

• Project/Area Number: 22KK0117
• Research Category: Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Medium-sized Section 49:Pathology, infection/immunology, and related fields
• Research Institution: Kumamoto University
• Principal Investigator: 黒滝 大翼 熊本大学, 国際先端医学研究機構, 特任准教授 (10568455)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 菊池 健太 熊本大学, 国際先端医学研究機構, 特定事業研究員 (60907939) ; 谷 時雄 熊本大学, 大学院先端科学研究部(理), 教授 (80197516)
• Project Period (FY): 2022-10-07 – 2026-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2022)
• Budget Amount: ¥20,150,000 (Direct Cost: ¥15,500,000、Indirect Cost: ¥4,650,000); Fiscal Year 2025: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000); Fiscal Year 2024: ¥6,630,000 (Direct Cost: ¥5,100,000、Indirect Cost: ¥1,530,000); Fiscal Year 2023: ¥7,150,000 (Direct Cost: ¥5,500,000、Indirect Cost: ¥1,650,000); Fiscal Year 2022: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
• Keywords: クロマチン高次構造 / 自然免疫細胞 / 炎症反応 / 次世代シークエンス解析

Outline of Research at the Start

DMAは核内に格納され、様々なレベルのクロマチン高次構造を形成する。しかし、クロマチン高次構造の持つ生物学的機能については不明な点が多い。申請者は自然免疫細胞の分化過程におけるクロマチン高次構造の変化を解析し、炎症関連遺伝子においてクロマチン高次構造が感染刺激の前に強く形成されていることを見出した。本研究計画では感染刺激前のクロマチン高次構造の確立の意義を追求するために、米国国立衛生研究所において最先端クロマチン高次構造解析技術を有する複数の研究者ならびに自然免疫細胞の分化研究で実績のある当研究代表者が国際共同研究チームを編成し、過去に類を見ない自然免疫応答プログラムの高深度解析を実現する。