Impact of cross-reactive immunity to pre-existing infections on COVID-19 pathogenesis in East Africa

• Project/Area Number: 22KK0148
• Research Category: Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Medium-sized Section 58:Society medicine, nursing, and related fields
• Research Institution: Kumamoto University
• Principal Investigator: 上野 貴将 熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター, 教授 (10322314)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): BARABONA GODFREY 熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター, 特別研究員 (40906674) ; 野村 拓志 熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター, 講師 (80711001)
• Project Period (FY): 2022-10-07 – 2026-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2022)
• Budget Amount: ¥20,020,000 (Direct Cost: ¥15,400,000、Indirect Cost: ¥4,620,000); Fiscal Year 2025: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000); Fiscal Year 2024: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000); Fiscal Year 2023: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000); Fiscal Year 2022: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
• Keywords: SARS-CoV-2 / COVID-19

Outline of Research at the Start

本研究では、タンザニアでCOVID-19診療に当たる複数の医療機関の協力の下、感染リスクの高い医療従事者が保有するSARS-CoV-2抗原に対する交差反応性を解析して、COVID-19病態の軽減と関連する感染免疫学的な要因を明らかにする。合わせて、他のサブサハラ地域の医療従事者を対象とした比較解析、およびHLAトランスジェニックマウス等を用いた免疫応答の検証実験を組み合わせることで、COVID-19病態と関連する因子を検証する。その成果は、保健インフラが脆弱な途上国での戦略的な感染制御プログラムの実践に寄与すると期待される。

Outline of Annual Research Achievements

本研究では、タンザニアでCOVID-19診療に当たる複数の医療機関の協力の下、感染リスクの高い医療従事者が保有するSARS-CoV-2抗原に対する交差反応性を解析して、COVID-19病態の軽減と関連する感染免疫学的な要因を明らかにする。合わせて、他のサブサハラ地域の医療従事者を対象とした比較解析、およびHLAトランスジェニックマウス等を用いた免疫応答の検証実験を組み合わせることで、COVID-19病態と関連する因子を検証する。本年度は、コホート構築を試みた。感染リスクの高い医療従事者の前向きフォローアップコホートとCOVID-19回復者およびワクチン接種ボランティアからのPBMC検体を採取した。一部の凍結検体を日本に送り、抗体応答などの検査を実施した。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

倫理申請手続きを前もって進めていたこともあり、予定していたコホートの構築とPBMC検体の採取を始めることができた。

Strategy for Future Research Activity

細胞性免疫応答の解析を開始する。

Research Products

• [Int'l Joint Research] ムヒンビリ健康科学大学/ムヒンビリ国立病院(タンザニア)
• [Journal Article] The SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike G446S mutation potentiates antiviral T-cell recognition (2022)
  • Author(s): Motozono C, Toyoda M, Tan TS, Hamana H, Goto Y, Aritsu Y, Miyashita Y, Oshiumi H, Nakamura K, Okada S, Udaka K, Kitamatsu M, Kishi H, Ueno T
  • Journal Title: Nat Commun Volume: 13 Issue: 1 Pages: 5440-5440
  • DOI: 10.1038/s41467-022-33068-4
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Dissecting Naturally Arising Amino Acid Substitutions at Position L452 of SARS-CoV-2 Spike (2022)
  • Author(s): Tan Toong Seng、Toyoda Mako、Ode Hirotaka、Barabona Godfrey、Hamana Hiroshi、Kitamatsu Mizuki、Kishi Hiroyuki、Motozono Chihiro、Iwatani Yasumasa、Ueno Takamasa
  • Journal Title: Journal of Virology Volume: 96 Issue: 20
  • DOI: 10.1128/jvi.01162-22
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Virological characteristics of the SARS-CoV-2 Omicron BA.2.75 variant (2022)
  • Author(s): Saito et al.
  • Journal Title: Cell Host & Microbe Volume: 30 Issue: 11 Pages: 1540-1540
  • DOI: 10.1016/j.chom.2022.10.003
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Dysfunctional Sars-CoV-2-M protein-specific cytotoxic T lymphocytes in patients recovering from severe COVID-19 (2022)
  • Author(s): Ogura Hideki、Gohda Jin、Lu Xiuyuan、Yamamoto Mizuki、Takesue Yoshio、Son Aoi、Doi Sadayuki、Matsushita Kazuyuki、Isobe Fumitaka、Fukuda Yoshihiro、Huang Tai-Ping、Ueno Takamasa、Mambo Naomi、Murakami Hiromoto、Kawaguchi Yasushi、Inoue Jun-ichiro、Shirai Kunihiro、Yamasaki Sho、Hirata Jun-Ichi、Ishido Satoshi
  • Journal Title: Nature Communications Volume: 13 Issue: 1 Pages: 7063-7063
  • DOI: 10.1038/s41467-022-34655-1
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] The SARS-CoV-2 spike S375F mutation characterizes the Omicron BA.1 variant (2022)
  • Author(s): Kimura Izumi, et al
  • Journal Title: iScience Volume: 25 Issue: 12 Pages: 105720-105720
  • DOI: 10.1016/j.isci.2022.105720
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research