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Structure and function of complex of substrate-binding protein and macromolecule-specific ABC transpoter

Research Project

Project/Area Number 23380049
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field Applied microbiology
Research InstitutionSetsunan University (2013)
Kyoto University (2011-2012)

Principal Investigator

MURATA Kousaku  摂南大学, 理工学部, 教授 (90142299)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) HASHIMOTO Wataru  京都大学, 大学院・農学研究科, 准教授 (30273519)
MIKAMI Bunzo  京都大学, 大学院・農学研究科, 教授 (40135611)
Project Period (FY) 2011-04-01 – 2014-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥18,200,000 (Direct Cost: ¥14,000,000、Indirect Cost: ¥4,200,000)
Fiscal Year 2013: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2012: ¥6,110,000 (Direct Cost: ¥4,700,000、Indirect Cost: ¥1,410,000)
Fiscal Year 2011: ¥7,280,000 (Direct Cost: ¥5,600,000、Indirect Cost: ¥1,680,000)
KeywordsABCトランスポーター / 酸性多糖輸送 / Sphingomonas属細菌 / X線結晶構造 / 輸送体分子進化 / X線結晶構造 / 基質結合タンパク質 / アルギン酸 / スフィンゴモナス属細菌 / X線結晶構造解析 / プロテオリポソーム再構成系 / ヘテロ多糖 / 高分子輸送 / アルギン酸結合タンパク質 / ABCタンパク質
Research Abstract

The structure and function relationship of macromolecule(alginate)-specific ABC transporter (importer:AlgM1-AlgM2/AlgS-AlgS) of Sphingomonas sp, A1 was analyzed.The substrate-binding proteins (AlgQ) bind/reliese alginate by opening/closing the N-domein and C-domein. The subsite 1 in the AlgQ specifically binds mannuronate. Through the contact with alginate-bound AlgQ, the permeases (AlgM1 and AlgM2) constituting importer open, receive alginate from AlgQ, and then alginate is introduced into cytosol by using ATP-hydrolyzing energy, which is generated by the action of AlgS (ATPase). This ATP transporter was different from the ABC transporters responsible for the transport of low-molecular weight substrates in that the substrate-binding protein (AlgQ) forms the tunnel that allows the passage of alginate, a long chain acid polysaccharide.

Report

(4 results)
  • 2013 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • Research Products

    (35 results)

All 2013 2012 2011 2009 Other

All Journal Article (20 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (13 results) (of which Invited: 1 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results)

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    • Industrial Property Rights Holder
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    • Industrial Property Number
      2013-034710
    • Filing Date
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      村田幸作, 橋本 渉, 河井重幸, 織田浩司, 庵原 啓司, 三上文三, 竹田浩之, 米山史紀, 落合秋人
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人京都大学, 株式会社 マルハニチロホールディングス
    • Filing Date
      2009-08-28
    • Acquisition Date
      2011-10-21
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URL: 

Published: 2011-04-06   Modified: 2019-07-29  

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