Basic study on the network of mRNA maturation process by analyzing diversified mRNA exporter.

• Project/Area Number: 23380059
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Applied biochemistry
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: MASUDA Seiji 京都大学, 生命科学研究科, 准教授 (20260614)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): OKUMURA Katsuzumi 三重大学, 大学院・生物資源学研究科, 教授 (30177183)
• Project Period (FY): 2011-04-01 – 2014-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2013)
• Budget Amount: ¥19,110,000 (Direct Cost: ¥14,700,000、Indirect Cost: ¥4,410,000); Fiscal Year 2013: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2012: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2011: ¥10,010,000 (Direct Cost: ¥7,700,000、Indirect Cost: ¥2,310,000)
• Keywords: mRNA / 核外輸送 / 輸送体 / 複合体 / mRNA輸送体 / 複合体形成

Research Abstract

Messenger RNA exporter regulates the mRNA processing. In human, mRNA exporter is diversified. Here, I am focusing on the mechanism of the complex formation of TREX and AREX as functional mRNA exporters.
The analysis using chimera mutants and point-mutated proteins, I have shown that TREX and AREX complex formation by UAP56 and URH49 are regulated by single amino acid exchange. This indicates that UAP56 and URH49 were diversified from the common ancestor and obtained the specific function through forming specific complex.

Research Products

• [Journal Article] Cooperative functions of ZnT1, metallothionein and ZnT4 in the cytoplasm are required for full (2013)
  • Author(s): Fujimoto S, Kimura T, Nagao M and Kambe T, et al. （11人中11番目）
  • Journal Title: PLOS ONE Volume: 8 Issue: 10 Pages: e77445-e77445
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0077445
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Identification of 6-octadecynoic acid from a methanol extract of Marrubium vulgare L. as a peroxisome proliferator-activated receptor γ agonist (2013)
  • Author(s): Ohtera, A., Miyamae, Y., Nakai, N., Kawachi, A., Kawada, K., Han, J., Isoda, H., Neffati, M., Akita, T., Maejima, K., Masuda, S., Kambe, T., Mori, N., Irie, K. and Nagao, M
  • Journal Title: Biochem. Biophys. Res. Commun Volume: 440 Issue: 2 Pages: 204-209
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2013.09.003
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Trafficking of mRNAs containing ALREX-promoting elements through nuclear speckles (2013)
  • Author(s): Akef, A., Zhang, H., Masuda, S. and Palazzo, AF
  • Journal Title: Nucleus Volume: 4 Issue: 4 Pages: 326-40
  • DOI: 10.4161/nucl.26052
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] mRNA核外輸送の効率化による動物細胞タンパク質生産 (2012)
  • Author(s): 松村嘉員, 増田誠司
  • Journal Title: バイオサイエンスとインダストリー Volume: 70 Pages: 373-375
  • NAID: 10031003447
  • URL: http://www.jba.or.jp/pc/bi/
• [Journal Article] Establishment of the monitoring system which detects the inhibition of mRNA processing (2012)
  • Author(s): Fujita, K., Okamura, M., Nishimoto, S., Kurihara, T., Momma, K., Miyamae, Y., Kambe, T., Nagao, M., Narita, H. and Masuda, S
  • Journal Title: Biosci. Biotechnol. Biochem Volume: 76 Pages: 1248-1251
  • URL: https://www.jstage.jst.go.jp/article/bbb/76/6/76_120226/_article
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] mRNA輸送体の多様化とその生物学的意義 (2012)
  • Author(s): 山崎智弘, 増田誠司
  • Journal Title: 化学と生物 Volume: 50 Pages: 9-11
  • URL: http://www.jsbba.or.jp/pub/journal_kasei/
• [Journal Article] Establishment of the monitoring system which detects the inhibition of mRNA processing. (2012)
  • Author(s): Fujita, K., Okamura, M., Nishimoto, S., Kurihara, T., Momma, K., Miyamae, Y., Kambe, T., Nagao, M., Narita, H. and Masuda, S.
  • Journal Title: Biosci. Biotechnol. Biochem. Volume: 76 Pages: 1248-1251
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Enhancing recombinant protein production in human cell lines with a constitutive transport element and mRNA export proteins (2011)
  • Author(s): Aihara Y, Fujiwara N, Yamazaki T, Kambe T, Nagao M, Hirose Y, Masuda S
  • Journal Title: J Biotechnol Volume: 153 Issue: 3-4 Pages: 86-91
  • DOI: 10.1016/j.jbiotec.2011.03.024
  • NAID: 120003072129
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Tissue nonspecific alkaline phosphatase is activated via a two-step mechanism by zinc transport complexes in the early secretory pathway (2011)
  • Author(s): Fukunaka, A., Kurokawa, Y., Teranishi, F., Sekler, I., Oda, K., Ackland, ML., Faundez, V., Hiromura, M., Masuda, S., Nagao, M., Enomoto, S. and Kambe, T
  • Journal Title: J Biol Chem Volume: 286 Issue: 18 Pages: 16363-16373
  • DOI: 10.1074/jbc.m111.227173
  • Peer Reviewed
• [Presentation] The identification of regions regulates different complex formations of UAP56 and URH49, which are essential for mRNA export. (2014)
  • Author(s): Kenichi Fujita, Yuki Minami, Seiji Masuda
  • Organizer: The 12th International Student Seminar
  • Place of Presentation: 京都
• [Presentation] 動物細胞の核外輸送過程を利用したタンパク質生産法 (2014)
  • Author(s): 増田誠司
  • Organizer: 日本農芸化学会
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] mRNA成熟阻害活性を指標とする抗ガン化合物の探索と産業利用 (2014)
  • Author(s): ç
  • Organizer: 日本農芸化学会
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] The GLE1 mutation identified in LCCS1 affects nuclear mRNA export (2013)
  • Author(s): Masumi Okamura, Takuya Shiki, Seiji Masuda
  • Organizer: RiboClub
  • Place of Presentation: ケベック、カナダ
• [Presentation] 胎性致死の遺伝病LCCS1にて同定されたGLE1の変異FinMajorはmRNAの核外輸送効率を低下させる (2013)
  • Author(s): 岡村真純、志岐拓哉、増田誠司
  • Organizer: 日本分子生物学会
  • Place of Presentation: 神戸
• [Presentation] mRNA輸送因子DBP5の核-細胞質間輸送とmRNA輸送の相関性 (2012)
  • Author(s): 志岐拓哉、宮前友策、永尾雅哉、神戸大朋、増田誠司
  • Organizer: 日本農芸化学会
  • Place of Presentation: 京都・京都女子大学
  • Year and Date: 2012-03-25
• [Presentation] mRNA輸送因子UAP56とURH49の形成する異なる複合体構築機構の解明 (2012)
  • Author(s): 藤田賢一、宮前友策、永尾雅哉、神戸大朋、増田誠司
  • Organizer: 日本農芸化学会
  • Place of Presentation: 京都・京都女子大学
  • Year and Date: 2012-03-24
• [Presentation] 動物細胞の核外輸送過程を利用したタンパク質生産法
  • Author(s): 増田誠司
  • Organizer: 日本農芸化学会大会
• [Presentation] mRNA 成熟阻害活性を指標とする抗ガン化合物の探索と産業利用
  • Author(s): 増田誠司
  • Organizer: 日本農芸化学会大会
• [Presentation] The identification of regions regulates different complex formations of UAP56 and URH49, which are essential for mRNA export
  • Author(s): Fujita K, Minami Y, Masuda S
  • Organizer: The 12th International Student Seminar
• [Presentation] 胎性致死の遺伝病LCCS1 にて同定されたGLE1の変異FinMajor はmRNA の核外輸送効率を低下させる
  • Author(s): 岡村真純, 志岐拓哉, 増田誠司
  • Organizer: 第36回日本分子生物学会年会
• [Presentation] The GLE1 mutation identified in LCCS1 affects nuclear mRNA export
  • Author(s): Okamura M, Shiki T, Masuda S
  • Organizer: RiboClub annual meeting
• [Presentation] mRNA 核外輸送因子UAP56 ならびにURH49 における複合体形成差異を決定する領域の同定
  • Author(s): 藤田賢一, 南裕基, 増田誠司
  • Organizer: 第15回日本RNA 学会年会
• [Presentation] 家族性遺伝病LCCS1 の原因遺伝子 hGLE1 の mRNA 輸送における機能解析
  • Author(s): 岡村真純, 志岐拓哉, 宮前友策, 神戸大朋, 永尾雅哉, 増田誠司
  • Organizer: 日本農芸化学会関西支部 第478回講演会
• [Presentation] mRNA 核外輸送因子UAP56 ならびにURH49 の複合体形成能を支配する領域の同定と機能解析
  • Author(s): 藤田賢一, 平山瑞希, 宮前友策, 永尾雅哉, 神戸大朋, 増田誠司
  • Organizer: 2012年度日本農芸化学会関西支部 第478回講演会
• [Presentation] The identification of regions regulates different complex formations of UAP56 and URH49, which are essential for mRNA export
  • Author(s): Fujita K, Minami Y, Hirayama M, Masuda S
  • Organizer: The 11th International Student Seminar
• [Presentation] mRNA 輸送因子UAP56 ならびにURH49 における複合体形成制御領域の同定
  • Author(s): 藤田賢一, 南裕基, 平山瑞季, 増田誠司
  • Organizer: 第35回日本分子生物学会
• [Presentation] DBP5 の核-細胞質間移行はmRNA 輸送に必須である
  • Author(s): 志岐拓哉, 岡村真純, 伊藤慶紗, 増田誠司
  • Organizer: 第35回日本分子生物学会
• [Presentation] Establishing a highly efficient protein production system in mammalian cells by manipulating the mRNA export step
  • Author(s): Matsumura Y., Kobayashi A, Masuda S
  • Organizer: JAACT2012
• [Presentation] Disturbing the function of the nuclear exosome results in the accumulation of adenylated RNA in human nuclei
  • Author(s): Fujiwara N, Okumura K, Fujiwara T, Masuda S
  • Organizer: the 4th EMBO meeting
• [Presentation] ヒト核内エキソソームはアデニン鎖の付加されたRNA基質を分解する
  • Author(s): 藤原奈央子, 程開明, 永尾雅哉, 神戸大朋, 宮前友策, 増田誠司
  • Organizer: 第14回日本RNA 学会年会(第14回RNA ミーティング)
• [Presentation] mRNA 輸送因子UAP56 とURH49 の形成する異なる複合体構築機構の解明
  • Author(s): 藤田賢一, 宮前友策, 永尾雅哉, 神戸大朋, 増田誠司
  • Organizer: 日本農芸化学大会
• [Presentation] mRNA 輸送因子DBP5 の核-細胞質間輸送とmRNA 輸送の相関性
  • Author(s): 志岐拓哉, 宮前友策, 永尾雅哉, 神戸大朋, 増田誠司
  • Organizer: 日本農芸化学大会
• [Presentation] PAPD5 adenylates nucleoplasmic substrates of the human Exosome
  • Author(s): Fujiwara N , Yumitate R, Wu K , Masuda S
  • Organizer: The 10th International Student Seminar
• [Presentation] The role of human Gle1 protein in mRNA export
  • Author(s): Okamura M, Shiki T, Masuda S
  • Organizer: The 10th International Student Seminar
• [Presentation] The molecular mechanism of different complex formation in UAP56 and URH49, which are essential for mRNA export
  • Author(s): Fujita K, Kurihara T, Yamazaki T, Masuda S
  • Organizer: The 10th International Student Seminar
• [Presentation] ヒト核内RNA品質管理機構におけるポリアデニル化およびエキソヌクレアーゼhRrp6 の関与について, 口頭
  • Author(s): 藤原奈央子, 弓立涼介, 呉攸, 増田誠司
  • Organizer: 平成23年度 日本農芸化学会 関西・中部支部合同大会
• [Presentation] mRNA 核外輸送因子UAP56 とURH49の形成する複合体の分子基盤解析
  • Author(s): 藤田賢一, 栗原朋也, 山崎智弘, 増田誠司
  • Organizer: 平成23年度日本農芸化学会 関西・中部支部合同大会
• [Presentation] ヒト核内RNA 品質管理機構における標的RNA 分子へのA付加と分解はエキソソームとRNAヘリカーゼMTR4 の相互作用を通じて協調される
  • Author(s): 藤原奈央子, 増田誠司
  • Organizer: 第84回日本生化学会大会
• [Presentation] mRNA核外輸送因子UAP56ならびにURH49における複合体形成差異を決定する領域の同定
  • Author(s): 藤田賢一、南裕基、増田誠司
  • Organizer: 日本RNA学会
  • Place of Presentation: 愛媛
• [Presentation] ヒト核内エキソソームはアデニン鎖の付加されたRNA基質を分解する
  • Author(s): 藤原奈央子、程開明、永尾雅哉、神戸大朋、宮前友策、増田誠司
  • Organizer: 日本RNA学会
  • Place of Presentation: 仙台
• [Presentation] Disturbing the function of the nuclear exosome results in the accumulation of adenylated RNA in human nuclei
  • Author(s): Fujiwara N, Okumura K, Fujiwara T, Masuda S
  • Organizer: EMBO meeting
  • Place of Presentation: フランス ニース アクロポリスコンベンションセンター
• [Presentation] Establishing a highly efficient protein production system in mammalian cells by manipulating the mRNA export step
  • Author(s): Matsumura Y., Kobayashi A and Masuda S.
  • Organizer: JAACT
  • Place of Presentation: 名古屋
• [Presentation] Nucleocytoplasmic Transport of DBP5 is Essential for mRNA Export
  • Author(s): Shiki T、Okamura M、Ito M、Masuda S
  • Organizer: 日本分子生物学会
  • Place of Presentation: 福岡
• [Presentation] mRNA輸送因子UAP56ならびにURH49における複合体形成制御領域の同定
  • Author(s): 藤田賢一、南裕基、平山瑞希、増田誠司
  • Organizer: 日本分子生物学会
  • Place of Presentation: 福岡
• [Presentation] 家族性遺伝病 LCCS1 の原因遺伝子 hGLE1 の mRNA 輸送における機能解析
  • Author(s): 岡村真純、志岐拓哉、宮前友策、神戸大朋、永尾雅哉、増田誠司
  • Organizer: 日本農芸化学会
  • Place of Presentation: 京都
• [Presentation] mRNA核外輸送因子UAP56ならびにURH49の複合体形成能を支配する領域の同定と機能解析
  • Author(s): 藤田賢一、平山瑞希、宮前友策、永尾雅哉、神戸大朋、増田誠司
  • Organizer: 日本農芸化学会
  • Place of Presentation: 京都
• [Presentation] The identification of regions regulates different complex formations of UAP56 and URH49, which are essential for mRNA export.
  • Author(s): Fujita K, Minami Y, Hirayama M, Masuda S
  • Organizer: International Student Seminar
  • Place of Presentation: 京都
• [Book] 動物細胞の培養を成功させる条件設定集 (2014)
  • Author(s): 岡村真純、平山瑞季、猪瀬春子、増田誠司
  • Publisher: 技術情報協会
• [Book] mRNA biogenesis in the nucleus and its export to the cytoplasm. "Current Frontiers and Perspectives in Cell Biology", eds by Najman, S (2012)
  • Author(s): Fujiwara, N., Shiki, T. and Masuda, S
  • Publisher: InTech - Open Access Publisher, ISBN
• [Book] Current Frontiers and Perspectives in Cell Biology (2012)
  • Author(s): Fujiwara, N., Shiki, T. and Masuda, S.
  • Total Pages: 556
  • Publisher: InTech - Open Access Publisher
• [Book] "Cell Biology", InTech-Open Access Publisher. ISBN 979-953-307-505-0(eds by Najman, S.) (2012)
  • Author(s): Fujiwara, N., Shiki, T., Masuda, S.
  • Publisher: mRNA biogenesis in the nucleus and its export to the cytoplasm(in press)
• [Book] 効率的なmRNA 核外輸送系を用いたタンパク質生産法「動物細胞の培養を成功させる条件設定集」
  • Author(s): 岡村真純, 平山瑞季, 猪瀬春子, 増田誠司
  • Publisher: 技術情報協会(in press)
• [Remarks]
  • URL: http://www.lif.kyoto-u.ac.jp/labs/bunshioutou/
• [Remarks] 分子応答機構学研究室ホームページ
  • URL: http://www.lif.kyoto-u.ac.jp/labs/bunshioutou/
• [Remarks] 京都大学大学院生命科学研究科分子応答機構学
  • URL: http://www.lif.kyoto-u.ac.jp/j/modules/education/content0040.html
• [Remarks] 分子応答機構学教室ホームページ
  • URL: http://www.lif.kyoto-u.ac.jp/labs/bunshioutou/
• [Remarks] 京都大学大学院生命科学研究科分子応答機構学
  • URL: http://www.lif.kyoto-u.ac.jp/j/modules/education/content0040.html
• [Patent(Industrial Property Rights)] 核内から細胞質へのターゲットmRNAの輸送を促進する方法,タンパク質の発現方法および製造方法,ならびに,それに用いるキット (2012)
  • Inventor(s): 増田誠司
  • Industrial Property Rights Holder: 増田誠司
  • Industrial Property Rights Type: 特許
  • Industrial Property Number: 2012-165287
  • Filing Date: 2012-07-26
• [Patent(Industrial Property Rights)] 核内から細胞質へのターゲットmRNAの輸送を促進 する方法、タンパク質の発現方法および製造方法、ならびに、それに用いるキット (2012)
  • Inventor(s): 増田誠司
  • Industrial Property Rights Holder: 増田誠司
  • Industrial Property Rights Type: 特許
  • Filing Date: 2012-07-26