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Improvement of molecular information of dominant species for phyto-plankton monitoring

Research Project

Project/Area Number 23510021
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Environmental dynamic analysis
Research InstitutionNational Museum of Nature and Science, Tokyo

Principal Investigator

TUJI Akihiro  独立行政法人国立科学博物館, 植物研究部, 研究主幹 (40356267)

Project Period (FY) 2011 – 2013
Project Status Completed (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000)
Fiscal Year 2013: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2012: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2011: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
Keywordsモニタリング / 植物プランクトン / メタゲノム解析 / バーコーディング / 珪藻 / 遺伝子 / 固有種 / プランクトン / Single Cell PCR / 付着藻類 / 分子系統解析 / Spicaticribra kingstonii
Research Abstract

1. The check list for phyto-plankton monitoring on artificial reservoir has build up and published as academic paper and home page.
2. About 20 cyanobacteria strains and 360 diatom strains were isolated from Japan and world-wide water bodies, and molecular analysis of 230 strains were done. It include many newly obtained sequences without deposited gene bank.
3. A meta-genome analysis on Lake Kasumigaura was performed on planktonic diatoms using rbcL-3P gene. Comparing meta-genome analysis and normal microscopic counting (analysis), the trend of dominant spices was fitted. Less than half species of rbcL molecular information in the analysis had deposited in gene bank.

Report

(4 results)
  • 2013 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2012 Research-status Report
  • 2011 Research-status Report
  • Research Products

    (51 results)

All 2014 2013 2012 2011 Other

All Journal Article (17 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (24 results) Book (5 results) Remarks (5 results)

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    • Journal Title

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    • NAID

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