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Investigation of the protein-protein interactions in a bacterial polyhedral organelle and their application

Research Project

Project/Area Number 23560943
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Biofunction/Bioprocess
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

TOBIMATSU Takamasa  岡山大学, 自然科学研究科, 准教授 (30188768)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) MORI Ko-ichi  岡山大学, 大学院自然科学研究科, 助教 (50379715)
Project Period (FY) 2011 – 2013
Project Status Completed (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2012: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2011: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Keywords生体触媒 / 細菌 / 細胞小器官 / ナノバイオ / バイオリアクター / バクテリア多面体オルガネラ / pduオルガネラ / ジオールデヒドラターゼ / タンパク質相互作用 / 酵素システム / ジオ ールデヒドラターゼ
Research Abstract

Considerable number of bacteria have proteinaceous polyhedral organelle in which metabolic reactions are carried to minimize the loss of volatile metabolic intermediates. In this study, we have developed expression system for polyhedral organelle genes, and analyzed their functions. We also found new interactions between some organelle enzymes, including diol dehydratase which was a key enzyme in the organelle metabolic pathway. These results suggest the importance of auto-assembly of the organelle enzymes in the formation process of polyhedral organelle.

Report

(4 results)
  • 2013 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2012 Research-status Report
  • 2011 Research-status Report
  • Research Products

    (19 results)

All 2014 2013 2012 2011 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (15 results)

  • [Journal Article] Sandwiched zinc-finger nucleases demonstrating higher homologous recombination rates than conventional zinc-finger nucleases in mammalian cells.2014

    • Author(s)
      Mori T, Mori K, Tobimatsu T, Sera T.
    • Journal Title

      Bioorg Med Chem Lett.

      Volume: 24 Issue: 3 Pages: 813-816

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2013.12.096

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    • Author(s)
      Mori K, Oiwa T, Kawaguchi S, Kondo K, Takahashi Y, Toraya T
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 53 Issue: 16 Pages: 2661-2671

    • DOI

      10.1021/bi500223k

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  • [Journal Article] Essential roles of nucleotide-switch and metal-coordinating residues for chaperone function of diol dehydratase-reactivase.2013

    • Author(s)
      Koichi Mori, Koji Obayashi, Yasuhiro Hosokawa, Akina Yamamoto, Mayumi Yano, Toshiyuki Yoshinaga, and Tetsuo Toraya
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 52 Issue: 48 Pages: 8677-8686

    • DOI

      10.1021/bi401290j

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  • [Journal Article] Redesign of coenzyme B12dependent diol dehydratasbe resistant to the mechanism-baseinactivation by glycerol and act on longer chain 1,2-diols2012

    • Author(s)
      Yamanishi M, Kinoshita K, Fukuoka M, Tanokuchi A, Saito T, Ikeda Y, Shibata N, Tobimatsu T, Toraya T
    • Journal Title

      FEBS Journal

      Volume: 279 Issue: 5 Pages: 793-804

    • DOI

      10.1111/j.1742-4658.2012.08470.x

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      第84回日本生化学会大会
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      2011-09-22
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      田尻麻衣, 塚田浩之, 田中佑樹, 灰垣佑輝, 安原麻衣, 森光一, 虎谷哲夫
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      日本ビタミン学会第63回大会
    • Place of Presentation
      広島市
    • Year and Date
      2011-06-05
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      田野口亜耶, 山崎監, 小倉謙一, 中村雄大, 飛松孝正, 虎谷哲夫
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    • Author(s)
      大岩敏宏, 高橋佑典, 近藤恭介, 森光一, 虎谷哲夫
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都
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      飛松孝正, 山崎藍, 中村雄大, 齋 藤翔太, 田野口亜耶, 小倉謙一, 虎谷哲夫
    • Organizer
      第432 回ビタミンB 研究協議会
    • Place of Presentation
      東京
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      山崎藍, 中村雄大, 齋藤翔太, 田 野口亜耶, 小倉謙一, 飛松孝正, 虎谷哲夫
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      日本ビタミン学会第65 回大会
    • Place of Presentation
      東京
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      森光一, 大岩敏宏, 高橋佑典, 近 藤恭介, 世良貴史, 虎谷哲夫
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      日本ビタミン学会第65 回大会
    • Place of Presentation
      東京
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  • [Presentation] ジオールデヒドラターゼの活性維持システムによる補欠分子族型補酵素のリサイクリ ング

    • Author(s)
      虎谷哲夫、田野口亜耶、山崎 藍、小倉謙一、中村雄大、飛松孝正
    • Organizer
      ビタミン B 研究委員会第431回研究協議会
    • Place of Presentation
      大阪市
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Published: 2011-08-05   Modified: 2019-07-29  

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