The role of DNA damage induced chromatin dynamics in the establishment and maintenance of pluripotency of stem cells

• Project/Area Number: 23651047
• Research Category: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Research Field: Risk sciences of radiation/Chemicals
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: IKURA Masae 京都大学, 放射線生物研究センター, 研究員 (40535275)
• Project Period (FY): 2011 – 2012
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2012)
• Budget Amount: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000); Fiscal Year 2012: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000); Fiscal Year 2011: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
• Keywords: TIP60ヒストンアセチル化酵素 / ヒストンH2AX / 細胞の多能性 / iPS細胞 / DNA損傷応答

Research Abstract

We have previously shown that TIP60 histone acetyltransferase complex regulates histone H2AX eviction upon DNA damage, which facilitate DNA damage response signaling. In this study, we tested whether chromatin dynamics via H2AX regulated by TIP60 is involved in the establishment or maintenance of pluripotency of stem cells including iPS cells. As a result, we found that TIP60 is not involved in the establishment of pluripotency of iPS cells.

Research Products

• [Journal Article] Purification of the human SMN-GEMIN2 complex and assessment of its stimulation of RAD51-mediated DNA recombination reactions (2011) (2011)
  • Author(s): Takaku, M., Tsujita, T., Horikoshi, N., Takizawa, Y., Qing, Y., Hirota, K., Ikura, M., Ikura, T., Takeda, S., Kurumizaka, H.
  • Journal Title: Biochemistry Volume: 50 Pages: 6797-6805
• [Journal Article] Purification of the human SMN-GEMIN2 complex and assessment of its stimulation of RAD51-mediated DNA recombination reactions (2011)
  • Author(s): Takaku, M
  • Journal Title: Biochemistry Volume: 50 Pages: 6797-6805
  • Peer Reviewed
• [Presentation] The role of chromatin dynamics in DNA damage-induced checkpoint activation (2013)
  • Author(s): Masae Ikura, Ryo Matsuda, Tsuyoshi Ikura
  • Organizer: 第3回国際シンポジウム
  • Place of Presentation: 広島大学原爆放射線医科学研究所
  • Year and Date: 2013-02-12
• [Presentation] ピルビン酸キナーゼM2はダイオキシン受容体の活性化補助因子である (2012)
  • Author(s): 松田俊、足立淳、井原賢、田沼延公、島礼、井倉正枝、井倉毅、松田知成
  • Organizer: 第35回分子生物学会年会
  • Year and Date: 2012-12-14
• [Presentation] クロマチン高次構造上における相同組換え反応の解析 (2012)
  • Author(s): 町田晋一、高久誉大、小林航、越阪部晃永、立和名博昭、鈴木秀和、浦聖恵、井倉正枝、井倉毅、田代聡、胡桃坂仁志
  • Organizer: 第35回分子生物学会年会
  • Year and Date: 2012-12-12
• [Presentation] The role of chromatin dynamics in DNA damage-induced checkpoint activation (2012)
  • Author(s): Masae Ikura, Satoshi Tashiro, Hiroki Shima, Kazuhiko Igarashi and Tsuyoshi Ikura
  • Organizer: 広島大学原爆放射線医科学研究所創立50 周年記念国際シンポジウム
• [Presentation] The role of chromatin dynamics in DNA damage-induced checkpoint activation (2012)
  • Author(s): 井倉毅
  • Organizer: 広島大学原爆放射線医科学研究所創立50 周年記念国際シンポジウム
  • Place of Presentation: 広島
• [Presentation] The role of histone H2AX eviction in DNA damage-induced checkpoint activation (2011)
  • Author(s): 井倉正枝、松浦嘉奈子、田代 聡、島 弘季、松田 涼、五十嵐和彦、井倉 毅
  • Organizer: 第34回日本分子生物学会年会ワークショップ
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2011-12-15
• [Presentation] The role of histone H2AX eviction in DNA damage-induced checkpoint activation (2011)
  • Author(s): 井倉毅
  • Organizer: 第34回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] リン酸化プロテオミクスを用いた新規DNA損傷初期応答キナーゼの探索 (2011)
  • Author(s): 足立淳
  • Organizer: 第34回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] SMN-GEMIN2 complex stimulates the RAD51-mediated recombination reactions (2011)
  • Author(s): Takaku, M
  • Organizer: 第34回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] リン酸化プロテオミクスを用いた新規DNA損傷初期応答キナーゼの探索
  • Author(s): 足立淳、鳴海良平、佐野聖三、久家貴寿、白水 崇、松本雅記、中山敬一、井倉正枝、井倉 毅、高田 穣、朝長毅
  • Organizer: 第34回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] SMN-GEMIN2 complex stimulates the RAD51-mediated recombination reactions
  • Author(s): Takaku, M., Tsujita, T., Horikoshi, N., Takizawa, Y., Qing, Y., Hirota, K., Ikura, M., Ikura, T., Takeda, S., Kurumizaka, H.
  • Organizer: 第34回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] The role of chromatin dynamics in DNA damage-induced checkpoint activation
  • Author(s): Masae Ikura
  • Organizer: 第3回広島大学原爆放射線医科学研究所国際シンポジウム
  • Place of Presentation: 広島大学原爆放射線医科学研究所
• [Presentation] ピルビン酸キナーゼM2はダイオキシン受容体の活性化補助因子である
  • Author(s): 松田俊
  • Organizer: 第35回分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場
• [Presentation] クロマチン高次構造上における相同組換え反応の解析
  • Author(s): 町田晋一
  • Organizer: 第35回分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場
• [Presentation] DNA損傷応答におけるヒストンH2AXとH2AZのアセチル化クロストーク
  • Author(s): 松田 涼
  • Organizer: 第55回放射線影響学会
  • Place of Presentation: 東北大学
• [Book] 遺伝情報の発現制御 -転写機構からエピジェネティクスまで- 著David S. Latchman（第３章翻訳、松田 俊、井倉正枝、井倉 毅） (2012)
  • Author(s): 井倉正枝
  • Total Pages: 429
  • Publisher: メディカル・サイエンス・インターナショナル
• [Book] 遺伝情報の発現制御 -転写機構からエピジェネティクスまで
  • Author(s): David S. Latchman