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Characterization of large-scale genome-reduced fission yeast strains

Research Project

Project/Area Number 23651206
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Applied genomics
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

TAKEGAWA Kaoru  九州大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (50197282)

Project Period (FY) 2011 – 2013
Project Status Completed (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2013: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2012: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2011: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Keywords分裂酵母 / 遺伝子削除 / 物質生産 / 代謝機能 / 大規模遺伝子削除 / 染色体工学 / ミニマムゲノム
Research Abstract

The gene number of Schizosaccharomyces pombe belong to smallest class in free-living eukaryotes. We further reduced S. pombe gene number by genome reduction to examine a minimal gene set required for growth in laboratory condition. The genome-reduced strain has four deletion regions. As results of the genome reductions, 224 genes of total approximately 5100 genes were reduced. The quadruple-deletion strain that has total deletion size of 657.3 kb, showed some decreasing effects of the uptake of glucose and a part of amino acids in comparison with the parental strain. In the quadruple-deletion strain, cellular ATP concentration was increased 2.7-fold and the production level of an enhanced green fluorescent protein (EGFP) was improved to 1.7-fold.

Report

(4 results)
  • 2013 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2012 Research-status Report
  • 2011 Research-status Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2013 2012 2011

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (10 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Characterization of genome-reduced fission yeast strains2013

    • Author(s)
      Sasaki M, Kumagai H, Takegawa K, and Tohda H
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res

      Volume: 41(10) Pages: 5382-5399

    • NAID

      40019822920

    • Related Report
      2013 Final Research Report
  • [Journal Article] Characterization of genome-reduced fission yeast strains.2013

    • Author(s)
      asaki M, Kumagai H, Takegawa K, and Tohda H
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: in press

    • NAID

      40019822920

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 染色体工学技術を利用した分裂酵母の有用物質生産システムの構築2011

    • Author(s)
      竹川 薫, 佐々木真弓, 東田英毅
    • Journal Title

      生物工学会誌

      Volume: 89 Pages: 521-523

    • NAID

      110008750610

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    • Organizer
      第50回化学関連支部合同九州大会
    • Place of Presentation
      北九州市
    • Year and Date
      2013-07-06
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      藤木真優, 佐々木真弓, 竹川 薫
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      藤木真優, アリムジャン・イディリス, 竹川 薫
    • Organizer
      日本農芸化学会関西・中四国・西日本支部および日本ビタミン学会近畿・中国四国・九州沖縄地区合同大会
    • Place of Presentation
      県立広島大学
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      藤木真優, アリムジャン・イディリス, 竹川 薫
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      鹿児島
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      (翠山荘) 山口市
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      京都女子大学
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    • Publisher
      シーエムシー出版
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Published: 2011-08-05   Modified: 2019-07-29  

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