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Origin and evolution of allosteric riboswitches

Research Project

Project/Area Number 23657160
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Evolutionary biology
Research InstitutionTokyo University of Science

Principal Investigator

TAMURA Koji  東京理科大学, 基礎工学部, 教授 (30271547)

Project Period (FY) 2011 – 2013
Project Status Completed (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2012: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2011: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Keywords機能進化 / RNA / リボスイッチ / アロステリック
Research Abstract

The Bacillus subtilis glycine riboswitch comprises tandem glycine-binding aptamers and regulates transcription via the sensing of glycine. And it shows allosteric effect by binding of one glycine to one aptamer. Here, I found that the riboswitch behaves in a "glycine-independent" manner in the presence of polyethylene glycol and ethylene glycol. The effect is related to the formation of a terminator stem within the expression platform under such conditions. This provided new perspective about the evolution of riboswitch and acquisition of allostericity that molecule-specific functions of riboswitches would have come later, after the formation of less specific domain in riboswitches.

Report

(4 results)
  • 2013 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2012 Research-status Report
  • 2011 Research-status Report
  • Research Products

    (57 results)

All 2014 2013 2012 2011 Other

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (46 results) (of which Invited: 6 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] RNA evolution conjectured from tRNA and riboswitches2014

    • Author(s)
      Tamura, K
    • Journal Title

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      Volume: (in press)

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      http://www.hypothesisjournal.com

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      Koji Tamura
    • Organizer
      RNA2011 (The 16th Annual Meeting of the RNA Society AND The RNA Society of Japan 13th Annual Meeting)
    • Place of Presentation
      京都
    • Related Report
      2011 Research-status Report
  • [Book] 生命分子を統合するRNAーその秘められた役割と制御機構2013

    • Author(s)
      田村浩二
    • Publisher
      羊土社
    • Related Report
      2013 Final Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://kojitamura.web.fc2.com/

    • Related Report
      2013 Final Research Report

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Published: 2011-08-05   Modified: 2019-07-29  

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