Establishment of a simple, easy and useful new recombinant virus manufacture system using a homologous recombination phenomenon

• Project/Area Number: 23658240
• Research Category: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Research Field: Basic veterinary science/Basic zootechnical science
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: MIURA Tomoyuki 京都大学, ウイルス研究所, 准教授 (40202337)
• Project Period (FY): 2011 – 2012
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2013)
• Budget Amount: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000); Fiscal Year 2012: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2011: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
• Keywords: 感染症 / 組換えウイルス / エイズ / SHIV / HIV-1mt / デングウイルス / ダニ媒介性脳炎ウイルス / 相同組換え / ウイルス / 動物モデル / 微生物

Research Abstract

I examined the influence that the length of the overlap domain, a position, and homology give in homologous recombination efficiency, and also the conditions such as the gene introduction method and the gene introduction cells using the conventional and new generation SHIV, and clarified the optimum. By this way, I succeeded in rearranging the env region of the various kinds of CCR5 type HIV-1 clinical isolates with maintaining variety in conventional and new generation SHIV as a backbone. Furthermore, I succeeded in an application of the method to Dengue virus and Tick-bone encephalitis virus construction.

Research Products

• [Journal Article] Generation of a replication-competent chimeric simian-human immunodeficiency virus carrying env from subtype C clinical isolate through intracellular homologous recombination (2013)
  • Author(s): Fujita, Y., Otsuki, H., Watanabe, Y., Yasui, M., Kobayashi, T., Miura, T., and Igarashi, T
  • Journal Title: Virology Volume: 436 Pages: 100-111
  • NAID: 120005434974
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Generation of a Replication-competent Simian–human Immunodeficiency Virus, the Neutralisation Sensitivity of Which can be Enhanced in the Presence of a Small Molecule CD4 Mimic. (2013)
  • Author(s): Otsuki, H., Hishiki, T., Miura, T., Hashimoto, C., Narumi, T., Tamamura, H., Yoshimura, K., Matsushita, S., and Igarashi, T.
  • Journal Title: Journal of General Virology Volume: 94 Pages: 2710-2716
  • DOI: 10.1099/vir.0.055590-0
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Generation of a replication-competent chimeric simian-human immunodeficiency virus carrying env from subtype C clinical isolate through intracellular homologous recombination. (2013)
  • Author(s): Fujita, Y., Otsuki, H., Watanabe, Y.,Yasui, M., Kobayashi, T., Miura, T., and Igarashi, T.
  • Journal Title: Virology Volume: 436 Pages: 100-111
  • DOI: 10.1016/j.virol.2012.10.036
  • NAID: 120005434974
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] No viral evolution in the lymph nodes of SIV-infected rhesus macaques during combined antiretroviral therapy (2013)
  • Author(s): Oue M, et al.
  • Journal Title: J. Virol. Volume: (In press) Pages: 4789-4793
  • DOI: 10.1128/jvi.03367-12
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Quantification system for the viral dynamics of a highly pathogenic simian/human immunodeficiency virus based on an in vitroexperiment and a mathematical model (2012)
  • Author(s): Iwami, S., Holder, B. P., Beauchemin,C. A. A., Morita, S., Tada, T., Sato, K.,Igarashi, T., and Miura, T.
  • Journal Title: Retrovirology Volume: 9 Pages: 18-18
  • DOI: 10.1186/1742-4690-9-18
  • NAID: 120004920398
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Lymph nodes harbor viral reservoirs that cause rebound of plasma viremia in SIV-infected macaques upon cessation of combined antiretroviral therapy. (2012)
  • Author(s): Horiike, M.
  • Journal Title: Virology Volume: 423 Pages: 107-118
  • DOI: 10.1016/j.virol.2011.11.024
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Identifying viral parameters from in vitro cell cultures (2012)
  • Author(s): Iwami, S.
  • Journal Title: Frontiers in Microbiology Volume: 3 Pages: 319-319
  • DOI: 10.3389/fmicb.2012.00319
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Isolation of potent neutralizing monoclonal antibodies from an SIV-Infected rhesus macaque by phage display (2011)
  • Author(s): Kuwata, T. et al.
  • Journal Title: AIDS Res. Hum. Retroviruses Volume: 27 Pages: 487-500
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Generation of a monkey-tropic human immunodeficiency virus type 1 carrying env from a CCR5-tropic subtype C clinical isolate
  • Author(s): Otsuki, H., Yoneda, M., Igarashi, T., and Miura, T
  • Journal Title: Virology Volume: (in press)
  • NAID: 120005456020
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Generation of a replication-competent simianhuman immunodeficiency virus, the neutralisation sensitivity of which can be enhanced in the presence of a small molecule CD4 mimic
  • Author(s): Otsuki, H., Hishiki, T., Miura, T., Hashimoto, C., Narumi, T., Tamamura, H., Yoshimura, K., Matsushita, S., and Igarashi, T
  • Journal Title: J. Gen. Virol Volume: 94 Pages: 2710-2716
  • Peer Reviewed
• [Presentation] CCR5 指向性を示す新規サル指向性HIV-1 はサル個体に持続感染する (2013)
  • Author(s): 齊藤暁, 大附寛幸, 東濃篤徳, 鈴木紗織, 松田健太, 高橋尚史, 岩谷靖雅, 杉浦亙, 野間口雅子, 足立昭夫, 保富康宏, 俣野哲朗, 三浦智行, 明里宏文
  • Organizer: 第27回日本エイズ学会学術集会
  • Place of Presentation: 熊本
• [Presentation] CCR5 指向性を示す新規サル指向性HIV-1 はサル個体に持続感染する (2013)
  • Author(s): 齊藤暁, 大附寛幸, 東濃篤徳, 鈴木紗織, 松田健太, 高橋尚史, 岩谷靖雅, 杉浦亙, 野間口雅子, 足立昭夫, 保富康宏, 俣野哲朗, 三浦智行, 明里宏文
  • Organizer: 第61回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 神戸
• [Presentation] CCR5 指向性サブタイプC エンベローを持つサル指向性 HIV-1のブタオザルにおける複製 (2013)
  • Author(s): 大附寛幸, 五十嵐樹彦, 三浦智行
  • Organizer: 第61回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 神戸
• [Presentation] 分泌型ルシフェラーゼ遺伝子を有するデングウイルス1 型レプリコンの構築 (2013)
  • Author(s): 加藤文博, 小林剛, 三浦智行, 五十嵐樹彦, 日紫喜隆行
  • Organizer: 第61回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 神戸
• [Presentation] ウイルスの標的細胞指向性はサル指向性HIV-1 の増殖に影響するか? (2013)
  • Author(s): 齊藤暁, 大附寛幸, 東濃篤徳, 鈴木紗織, 松田健太, 高橋尚史, 岩谷靖雅, 杉浦亙, 保富康宏, 俣野哲朗, 三浦智行, 明里宏文
  • Organizer: 第156回日本獣医学会学術集会
  • Place of Presentation: 岐阜
• [Presentation] ウイルスの標的細胞指向性はサル指向性HIV-1の増殖に影響するか？ (2013)
  • Author(s): 齊藤暁、大附寛幸、東濃篤徳、鈴木紗織、松田健太、高橋尚史、岩谷靖雅、杉浦亙、保富康宏、俣野哲朗、三浦智行、明里宏文
  • Organizer: 第156回日本獣医学会学術集会
  • Place of Presentation: 岐阜
• [Presentation] 分泌型ルシフェラーゼ遺伝子を有するデングウイルス1型レプリコンの構築 (2013)
  • Author(s): 加藤文博、小林剛、三浦智行、五十嵐樹彦、日紫喜隆行
  • Organizer: 第61回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 神戸
• [Presentation] CCR5指向性サブタイプCエンベローを持つサル指向性 HIV-1 のブタオザルにおける複製 (2013)
  • Author(s): 大附寛幸、五十嵐樹彦、三浦智行
  • Organizer: 第61回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 神戸
• [Presentation] CCR5指向性を示す新規サル指向性HIV-1はサル個体に持続感染する (2013)
  • Author(s): 齊藤暁、大附寛幸、東濃篤徳、鈴木紗織、松田健太、高橋尚史、岩谷靖雅、杉浦亙、野間口雅子、足立昭夫、保富康宏、俣野哲朗、三浦智行、明里宏文
  • Organizer: 第61回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 神戸
• [Presentation] CCR5指向性を示す新規サル指向性HIV-1はサル個体に持続感染する (2013)
  • Author(s): 齊藤暁、大附寛幸、東濃篤徳、鈴木紗織、松田健太、高橋尚史、岩谷靖雅、杉浦亙、野間口雅子、足立昭夫、保富康宏、俣野哲朗、三浦智行、明里宏文
  • Organizer: 第27回日本エイズ学会学術集会
  • Place of Presentation: 熊本
• [Presentation] 細胞内相同組換えを利用したCCR5 指向性サブタイプC HIV-1 由来env を持つサル指向性HIV-1 の作出 (2012)
  • Author(s): 大附寛幸, 一瀬裕太郎, 小林剛, 五十嵐樹彦, 三浦智行
  • Organizer: 第26回日本エイズ学会
  • Place of Presentation: 神奈川
• [Presentation] シベリア型ダニ媒介性脳炎ウイルスIR99-2f7株の感染性cDNAクローンの構築 (2012)
  • Author(s): 川岸崇裕, 加藤文博, 日向亮輔, 三浦智行, 小林剛, 五十嵐樹彦
  • Organizer: 第60回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 大阪
• [Presentation] 中和感受性を増強する薬剤による抗HIV-1 治療戦略に向けた新規SHIV/アカゲザル評価モデルの開発 (2012)
  • Author(s): 大附寛幸, 一瀬裕太郎, 小林剛, 原田恵嘉, 吉村和久, 鳴海哲夫, 玉村啓和, 松下修三, 五十嵐樹彦, 三浦智行
  • Organizer: 第60回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 大阪
• [Presentation] 霊長類エイズモデル感染病態に関わるウイルスゲノム基盤に関する研究 (2012)
  • Author(s): 三浦智行, 大附寛幸, 米田舞, 一瀬裕太郎, 小林剛, 五十嵐樹彦
  • Organizer: 第154回日本獣医学会
  • Place of Presentation: 岩手
• [Presentation] ダニ媒介性脳炎ウイルスCapsid欠損レプリコンの構築及びSingle-round infectious systemの開発 (2012)
  • Author(s): 日向亮輔
  • Organizer: 第47回日本脳炎ウイルス生態学研究会
  • Place of Presentation: 熊本
• [Presentation] Generation of monkey-tropic human immunodeficiency virus strains carrying a variety of CCR5-utilizing env genes from HIV-1 subtype C clinical isolates through intracellular homologous recombination. (2012)
  • Author(s): Hiroyuki Otsuki
  • Organizer: 19th East Asia Joint Symposium on Biomedical Research
  • Place of Presentation: Seoul, Korea
• [Presentation] 抗デングウイルス活性を有する化合物の探索および作用機序の解析 (2012)
  • Author(s): 加藤文博
  • Organizer: 第60回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 大阪
• [Presentation] 中和感受性を増強する薬剤による抗HIV-1治療戦略に向けた新規SHIV/アカゲザル評価モデルの開発 (2012)
  • Author(s): 大附寛幸
  • Organizer: 第60回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 大阪
• [Presentation] シベリア型ダニ媒介性脳炎ウイルスＩＲ９９-２ｆ７株の感染性ｃＤＮＡクローンの構築 (2012)
  • Author(s): 川岸崇裕
  • Organizer: 第60回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: 大阪
• [Presentation] 細胞内相同組換えを利用したCCR5指向性サブタイプＣ HIV-1由来envを持つサル指向性HIV-1の作出 (2012)
  • Author(s): 大附寛幸
  • Organizer: 第26回日本エイズ学会
  • Place of Presentation: 神奈川
• [Presentation] 中和抵抗性のサル/ヒト免疫不全ウイルスの作製とin vitro における立体構造変化誘導剤による中和感受性増強効果の評価 (2011)
  • Author(s): 大附寛幸, 三浦智行, 小林剛, 吉村和久, 玉村啓和, 松下修三, 五十嵐樹彦
  • Organizer: 第25回日本エイズ学会学術集会
  • Place of Presentation: 東京