Study of the genetic diversity of C57BL/6N inbred mouse substrains

• Project/Area Number: 23700518
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Research Field: Laboratory animal science
• Research Institution: The Institute of Physical and Chemical Research
• Principal Investigator: MEKADA Kazuyuki 独立行政法人理化学研究所, 実験動物開発室, 専任研究員 (90360651)
• Project Period (FY): 2011 – 2012
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2012)
• Budget Amount: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000); Fiscal Year 2012: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2011: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
• Keywords: マウス / C57BL/6N / 近交系 / 亜系統 / SNP / 多型 / 遺伝的多型

Research Abstract

The C57BL/6N strain is widely used as the genetic background for knockout mice generated by large-scale projects worldwide. In this study, we identified novel single nucleotide polymorphisms (SNPs) specific to the C57BL/6N strain and selected SNPs for genetic monitoring of C57BL/6N substrains. As a result, we confirmed a number of SNP loci that demonstrated genetic differences among C57BL/6N substrains. This SNP information will be useful for accurate genetic monitoring of the C57BL/6N congenic strain background.

Research Products

• [Journal Article] Molecular Identification of tw5 : Vps52 promotes pluripotential cell differentiation through cell-cell interactions (2012)
  • Author(s): Sugimoto M, Kondo M, Hirose M, Suzuki M, Mekada K, Abe T, Kiyonari H, Ogura A, Takagi N, Artzt K, Abe K
  • Journal Title: Cell Reports Volume: 2 Pages: 1363-74
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] ハタネズミ属におけるXY 染色体対合能力の喪失について (2012)
  • Author(s): 目加田和之, Borodin PM
  • Journal Title: 草食実験動物 Volume: 34 Pages: 25-32
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Multiple independent evolutionary losses of XY pairing at meiosis in the grey vole (2011)
  • Author(s): Borodin PM, Basheva EA, Torgasheva1 AA, Dashkevich1 OA, Golenishchev FN, Kartavtseva IV, Mekada K, Dumont BL
  • Journal Title: Chromosome Research Volume: 20 Pages: 259-68
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Kbus/Idr, a mutant mouse strain with skeletal abnormalities and hypophosphatemia : Identification as an allele of 'Hyp ' (2011)
  • Author(s): Moriyama K, Hanai A, Mekada K, Yoshiki A, Ogiwara K, Kimura A, Takahashi T
  • Journal Title: Journal of Biomedical Science Volume: 18 Pages: 60-60
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 2 種のβ型レチノイド関連オーファン受容体(RORβ)遺伝子変異マウスにおける大脳皮質組織構築異常 (2013)
  • Author(s): 澤田和彦,廣瀬美和,村上亜弓,目加田和之,中田初美,太田聡史,吉木 淳
  • Organizer: 第117回日本解剖学会総会・全国学術集会
  • Place of Presentation: 高松
  • Year and Date: 2013-03-28
• [Presentation] C57BL/6N亜系統特異的SNPマーカーの整備 (2013)
  • Author(s): 目加田和之
  • Organizer: 第60回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: つくば
• [Presentation] 代表的実験マウスC57BL/6系統の遺伝的多型性について (2012)
  • Author(s): 目加田和之
  • Organizer: 草食実験動物研究会第37回大会
  • Place of Presentation: 熱海
  • Year and Date: 2012-11-24
• [Presentation] ゲノム情報に基づく次世代マウスリソースの拡充 (2012)
  • Author(s): 吉木 淳,池 郁生,目加田和之,綾部信哉,平岩典子,中田初美,持田慶司,小倉淳郎
  • Organizer: 第3 期NBRP 開始記念 ナショナルバイオリソースプロジェクト(NBRP)シンポジウム-第3 期の挑戦-
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2012-11-21
• [Presentation] 胚移植法の改良による野生由来マウス各系統ガラス化保存胚からの産子獲得 (2012)
  • Author(s): 持田慶司,長谷川歩未,平岩典子,目加田和之,吉木 淳,小倉淳郎
  • Organizer: 第105回日本繁殖生物学会大会
  • Place of Presentation: つくば
  • Year and Date: 2012-09-07
• [Presentation] 野生由来マウス各系統における抗インヒビン血清およびeCG を用いた過排卵と体外受精成績 (2012)
  • Author(s): 長谷川歩未,持田慶司,平岩典子,渡辺元,田谷一善,目加田和之,吉木淳,小倉淳郎
  • Organizer: 第105回日本繁殖生物学会大会
  • Place of Presentation: つくば
  • Year and Date: 2012-09-07
• [Presentation] 理研BRC のIMPC(国際マウス表現型解析コンソーシアム)参画計画1-ノックアウトマウスの生産 (2012)
  • Author(s): 吉木 淳,目加田和之,中田初美,平岩典子,池 郁生,岩間瑞穂,伊集院麻衣子,田熊究一,高橋仁美,阪口真美子,廣瀬美智子,持田慶司,小倉淳郎,小幡裕一
  • Organizer: 第59回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: 別府
  • Year and Date: 2012-05-26
• [Presentation] 野生由来マウス各系統の保存のための凍結精子および胚の効果的な利用.(1)過排卵誘起と体外受精の成績 (2012)
  • Author(s): 長谷川歩未,持田慶司,平岩典子,伊集院麻衣子,田熊究一,高橋仁美,阪口真美子,大高直樹,古谷貴史,山口真輝,濱 大樹,高島梨香,渡辺 元,田谷一善,目加田和之,吉木 淳,小倉淳郎
  • Organizer: 第59回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: 別府
  • Year and Date: 2012-05-25
• [Presentation] 野生由来マウス各系統の保存のための凍結精子および胚の効果的な利用.(2)胚のガラス化保存と移植成績 (2012)
  • Author(s): 持田慶司,長谷川歩未,平岩典子,伊集院麻衣子,田熊究一,高橋仁美,阪口真美子,大高直樹,古谷貴史,山口真輝,濱 大樹,高島梨香,渡辺 元,田谷一善,目加田和之,吉木 淳,小倉淳郎
  • Organizer: 第59回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: 別府
  • Year and Date: 2012-05-25
• [Presentation] Rosa26 遺伝子座へのCAG/EGFP-tdsRed 遺伝子挿入による新規Cre レポーターマウスの開発 (2012)
  • Author(s): 関口渓人,長谷川賀一,谷本陽子,大徳陽子,水野聖哉,村上亜弓,門田雅世,橋本知美,目加田和之,中田初美,吉木淳,依馬正次,杉山文博,八神健一,高橋 智
  • Organizer: 第59回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: 別府
  • Year and Date: 2012-05-24
• [Presentation] がん研究を支援するマウスリソースの整備と利用紹介 (2012)
  • Author(s): 目加田和之,吉木 淳
  • Organizer: 平成23 年度「個体レベルでのがん研究支援活動」ワークショップ
  • Place of Presentation: 大津
  • Year and Date: 2012-01-18
• [Presentation] 血管内皮系譜細胞にCre 酵素発現するトランスジェニックマウスの開発 (2012)
  • Author(s): 大徳陽子,長谷川賀一,関口渓人,谷本陽子,水野聖哉,村上亜弓,門田雅世,橋本知美,目加田和之,中田初美,吉木淳,依馬正次,杉山文博,高橋 智,八神健一
  • Organizer: 第59回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: 別府
• [Presentation] 膵β細胞特異的にCre 酵素発現するトランスジェニックマウスの開発 (2012)
  • Author(s): 長谷川賀一,関口渓人,谷本陽子,大徳陽子,水野聖哉,村上亜弓,門田雅世,橋本知美,目加田和之,中田初美,吉木淳,依馬正次,杉山文博,高橋 智,八神健一
  • Organizer: 第59回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: 別府
• [Presentation] 野生由来マウス系統の内在性乳癌ウィルスの検討 (2012)
  • Author(s): 平岩典子,中田初美,小島怜子,大高直樹,村上亜弓,目加田和之,吉木 淳
  • Organizer: 第59回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: 別府
• [Presentation] ヘアレスコンジェニックマウスの確立と供給 (2012)
  • Author(s): 門田雅世,大高直樹,村上亜弓,廣瀬真由,目加田和之,吉木 淳
  • Organizer: 第59回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: 別府
• [Presentation] C57BL/6N 亜系統グループ内の遺伝的多様性について (2012)
  • Author(s): 目加田和之,廣瀬真由,吉木 淳
  • Organizer: 第59回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: 別府
• [Presentation] 理研BRCにおける寄託マウスの受入業務について (2012)
  • Author(s): 岡本裕行,梶田亜矢子,目加田和之,中田初美,吉木 淳,池 郁生
  • Organizer: 第59回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: 別府
• [Presentation] マウス新規EdaTa-Rbrc変異ゲノム欠失領域の解明 (2012)
  • Author(s): 関 幸子,橋本知美,新井富士美,小島怜子,斎藤昭男,村上亜弓,目加田和之,中田初美,吉木 淳
  • Organizer: 第59回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: 別府
• [Presentation] C57BL/6N亜系統グループ内の遺伝的多様性について (2012)
  • Author(s): 目加田和之
  • Organizer: 第59回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: 別府
• [Presentation] ハタネズミ属におけるXY 染色体対合能力の喪失について (2011)
  • Author(s): 目加田和之,Borodin PM
  • Organizer: 草食実験動物研究会第36回大会
  • Place of Presentation: 熱海
  • Year and Date: 2011-11-26
• [Presentation] 実験動物施設における省エネシステムの評価と実証 (2011)
  • Author(s): 田中 真,下園剛司,横田将志,小林めぐみ,木下雅史,目加田和之,高橋 稔,吉木 淳
  • Organizer: 第42回筑波実験動物研究会
  • Place of Presentation: つくば
  • Year and Date: 2011-11-22
• [Presentation] Rorb ミュータントマウスにおける大脳皮質組織構築異常 (2011)
  • Author(s): 澤田和彦,村上亜弓,目加田和之,中田初美,太田聡史,吉木 淳
  • Organizer: 第51回日本先天異常学会学術集会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2011-07-23
• [Presentation] SMXA リコンビナント近交系群のSDP の追加とウレタン誘発肺腫瘍抵抗性遺伝子座Par3 の再検討 (2011)
  • Author(s): 大野民生,空閑雅子,西村正彦,目加田和之,吉木 淳
  • Organizer: 第58回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: 船橋
  • Year and Date: 2011-05-26
• [Presentation] マウスC57BL/6N 亜系統のBAC エンドシークエンス (2011)
  • Author(s): 吉木 淳,村田武英,山崎孝人,豊田 敦,目加田和之,太田聡史,山崎由紀子,小幡裕一,阿部訓也
  • Organizer: 第58回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: 船橋
  • Year and Date: 2011-05-26
• [Presentation] 動物飼育施設の環境因子のマウス繁殖への影響 (2011)
  • Author(s): 田中 真,目加田和之,横田将志,小林めぐみ,吉木 淳
  • Organizer: 第58回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: 船橋
  • Year and Date: 2011-05-25
• [Presentation] Semantic web 技術を利用した哺乳類バイオリソースのデータベース (2011)
  • Author(s): 桝屋啓志,高月照江,斎藤実香子,脇 和規,田中信彦,目加田和之,中田初美,西條 薫,吉田有子,蒔田由布子,若菜茂晴,中村幸夫,吉木 淳,豊田哲郎
  • Organizer: 第34回に本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] Air-conditioning technologies for laboratory animal facilities (2011)
  • Author(s): Kamitani M, Gotoda R, Tanaka M, Mekada K, Yoshiki A
  • Organizer: The 7th SALAS/6th AMMRA Annual Regional Conference
  • Place of Presentation: Lim Chu Kang, Singapore
• [Presentation] 操作性かつ動物福祉に配慮した炭酸ガス安楽死装置の開発 (2011)
  • Author(s): 目加田和之,飯塚 眞,横田将志,小林めぐみ,吉木 淳
  • Organizer: 第58回日本実験動物学会総会
  • Place of Presentation: 船橋
• [Remarks]
  • URL: http://www.brc.riken.jp/lab/animal/