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Evolution of adaptive trraits to climate change in a wild relative of Arabidopsis thaliana distributed along wide altitudinal ranges.

Research Project

Project/Area Number 23770016
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Ecology/Environment
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

HIRAO Akira  筑波大学, 生命環境系, 研究員 (20447048)

Research Collaborator TANAKA Kenta  筑波大学, 生命環境系, 准教授
Project Period (FY) 2011 – 2013
Project Status Completed (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2012: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2011: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords機能遺伝子 / 適応度 / 標高傾度 / 次世代シーケンス / 異質倍数体 / ホメオログ / 共通圃場実験 / 相互移植実験 / 適応遺伝子 / 適応形質
Research Abstract

Genetic variation along environmental gradients such as altitude provides understanding to genetic basis of adaptive evolution. Arabidopsis kamchatica subsp. kamchatica, a wild relative of A. thaliana, occurs along wide altitudinal gradients. In this study, we took advantage of the wide altitudinal distribution of A. kamchatica to detect the genetic basis of local adaptation. The results of screening on eight candidate genes by next generation sequencing indiicate that GL1, a trichome gene, and PHYB, a photorecetor gene, are under natural selection and are associated with altitudinal adaptation.

Report

(4 results)
  • 2013 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2012 Research-status Report
  • 2011 Research-status Report
  • Research Products

    (26 results)

All 2014 2013 2012 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (18 results) (of which Invited: 2 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] わが国の高山植物の遺伝的多様性と脆弱性-温暖化条件下で氷期遺存種の南限集団が示すこと-2014

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      平尾章
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      地球環境

      Volume: 19

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      Volume: 印刷中

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      地学雑誌

      Volume: 122(4) Pages: 628-637

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      田中健太・平尾章・鈴木亮・飯島慈裕・浜田崇・尾関雅章・廣田充
    • Journal Title

      Journal of Geography (Chigaku Zasshi)

      Volume: 122 Issue: 4 Pages: 628-637

    • DOI

      10.5026/jgeography.122.628

    • NAID

      130003373660

    • ISSN
      0022-135X, 1884-0884
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      日本進化学会第15回大会
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      つくば市
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      第60回日本生態学会シンポジウム「標高傾度の中にある,隠れた遺伝的多様性」
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      静岡市
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      2013-03-07
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      上田市,プチホテル・ゾンタック
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      つくば市,筑波大学
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      2013年日本地球惑星科学連合 セッション「中部山岳地域の自然環境変動」
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      千葉市,幕張メッセ国際会議場
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      日本進化学会第14回大会
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      八王子市
    • Year and Date
      2012-08-23
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      平尾章・恩田義彦・清水(稲継)理恵・瀬々潤・清水健太郎・田中健太
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      NGS現場の会・第二回研究会
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      大阪
    • Year and Date
      2012-05-24
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  • [Presentation] 山岳植物の遹伝的多様性,および標高傾度に沿った分化2012

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      第59回日本生態学会企画集会「気候変動に対する高山・亜高山生態系の応答の将来予測:遹伝子から景観レベルまで」
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      大津
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  • [Presentation] Screening for diversifying selection on six flowering and hervivory-defence genes among 19 natural populations of Arabidopsis kamchatica : from pooled-DNA analysis with parallel sequencing2012

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      Hirao, AS, Y. Onda, R. Shimizu-Inatsugi, J. Sese, K. K. Shimizu and T. Kenta
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      The 5th EAFES International Congress
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      Otsu
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  • [Presentation] 標高万能植物ミヤマハタザオの標高適応遺伝子:トライコームと光受容体

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      平尾章・恩田義彦・清水(稲継)理恵・ 瀬々潤・清水健太郎・田中健太
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      日本進化学会第14回大会
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      東京、首都大学東京
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  • [Presentation] 標高万能植物ミヤマハタザオの環境適応遺伝子:トライコームと光受容体

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      高山市、高山市民文化会館
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  • [Presentation] 標高万能植物ミヤマハタザオにおけるトライコームおよび光受容体遺伝子の集団間分化

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      平尾章・恩田義彦・清水(稲継)理恵・ 瀬々潤・清水健太郎・田中健太
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      静岡市、静岡県コンベンションアーツセンター(グランシップ静岡)
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      Hirao AS, Onda Y, Shimizu-Inatsugi R, Sese J, Shimizu KK, Kenta T
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      59th Annual Meeting of Ecological Society of Japan
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      龍谷大学(滋賀県)
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      Kenta T, Sawada Y, Yamada A, Onda Y, Hirao AS, Bacigalupe, LD, Hirai MY
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      59th Annual Meeting of Ecological Society of Japan
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      龍谷大学(滋賀県)
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      中部山岳地域環境変動研究機構2011年度年次研究報告会
    • Place of Presentation
      信州大学(長野県)
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  • [Book] Plant genetic diversity and plant-pollinator interactions along altitudinal gradients2014

    • Author(s)
      Itino T, Hirao AS
    • Total Pages
      250
    • Publisher
      Springer
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Published: 2011-08-05   Modified: 2019-07-29  

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