Epigenetic changes in gene expression profiles induced by species crosses.

• Project/Area Number: 23780011
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Research Field: Breeding science
• Research Institution: National Institute of Agrobiological Sciences
• Principal Investigator: FUKAI Eigo 独立行政法人農業生物資源研究所, 植物科学研究領域・植物共生機構研究ユニット, 特別研究員 (00570657)
• Project Period (FY): 2011 – 2012
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2012)
• Budget Amount: ¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000); Fiscal Year 2012: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2011: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
• Keywords: 遠縁交雑 / エピジェネティクス / トランスポゾン / 次世代シークエンサー / トランスクリプトーム / ゲノム / ミヤコグサ / 種間交雑 / マメ科

Research Abstract

Hybridization between distantly related species has been regarded as a stimulus inducing epigenetic changes in gene expression profiles in the progeny. This study identified gene expression changes in the progeny of crosses between different Lotus species.

Research Products

• [Journal Article] Activation of an endogenous retrotransposon associated with epigenetic changes in Lotus japonicus: A tool for functional genomics in legumes (2013)
  • Author(s): Eigo Fukai, Jens Stougaard, Makoto Hayashi
  • Journal Title: The Plant Genome Volume: (Accepted)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Establishment of a Lotus japonicus gene tagging population using the exon-targeting endogenous retrotransposon LORE1 (2012)
  • Author(s): Eigo Fukai, Takashi Soyano, Yosuke Umehara, Shinobu Nakayama, Hideki Hirakawa, Satoshi Tabata, Shusei Sato, Makoto Hayashi
  • Journal Title: The Plant Journal Volume: 69 Issue: 4 Pages: 720-730
  • DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04826.x
  • Peer Reviewed
• [Presentation] ミヤコグサの種間交雑RIL集団におけるレトロトランスポゾンの活性化 (2013)
  • Author(s): 深井英吾, Niels Sandal, 吉川学, 平川英樹, 梅原洋佐, 河内宏, 佐藤修正, Jens Stougaard, 廣近洋彦, 林誠
  • Organizer: 日本育種学会第123回講演会
  • Place of Presentation: 東京農業大学
  • Year and Date: 2013-03-27
• [Presentation] ミヤコグサの種間交雑RIL集団におけるレトロトランスポゾンの活性化 (2013)
  • Author(s): 深井英吾, Niels Sandal, 吉川学, 平川英樹, 梅原洋佐, 河内宏, 佐藤修正, Jens Stougaard, 廣近洋彦, 林誠
  • Organizer: 日本植物生理学会年会 第54回
  • Place of Presentation: 岡山大学
  • Year and Date: 2013-03-22
• [Presentation] Establishment of a Lotus japonicus gene tagging population using the endogenous retrotransposon LORE1. (2012)
  • Author(s): Eigo Fukai, Takashi Soyano, Yosuke Umehara, Shinobu Nakayama, Satoshi Tabata, Shusei Sato, Makoto Hayashi
  • Organizer: VI International conference on Legume Genomics and Genetics
  • Place of Presentation: Hyderabad, India
  • Year and Date: 2012-10-10
• [Presentation] 内在性レトロトランスポゾンLORE1によるマメ科モデル植物ミヤコグサの大規模遺伝子タギング系の開発 (2012)
  • Author(s): 深井英吾, 征矢野敬, 梅原洋佐, 中山しのぶ, 平川英樹, 田畑哲之, 佐藤修正, 林誠
  • Organizer: 日本育種学会第121回講演会
  • Place of Presentation: 宇都宮大学
  • Year and Date: 2012-03-29
• [Presentation] 内在のレトロトランスポゾンLORE1を用いたミヤコグサの大規模遺伝子タギング系の開発 (2012)
  • Author(s): 深井英吾, 征矢野敬, 梅原洋佐, 中山しのぶ, 平川英樹, 田畑哲之, 佐藤修正, 林誠
  • Organizer: 日本植物生理学会年会 第53回
  • Place of Presentation: 京都産業大学
  • Year and Date: 2012-03-16
• [Presentation] Establishment of a Lotus japonicus gene tagging population using the endogenous retrotransposon LORE1. (2012)
  • Author(s): Eigo Fukai
  • Organizer: VI International conference on Legume Genomics and Genetics
  • Place of Presentation: Hyderabad Marriott Hotel & Convention Centre, Hyderabad, India
• [Presentation] 内在のレトロトランスポゾンLORE1を用いたミヤコグサの大規模遺伝子タギング系の開発 (2012)
  • Author(s): 深井英吾、征矢野敬、梅原洋佐、中山しのぶ、平川英樹、田畑哲之、佐藤修正、林誠
  • Organizer: 第53回 日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 京都産業大学
• [Presentation] 内在性レトロトランスポゾン LORE1 によるマメ科モデル植物ミヤコグサの大規模遺伝子タギング系の開発 (2012)
  • Author(s): 深井英吾、征矢野敬、梅原洋佐、中山しのぶ、平川英樹、田畑哲之、佐藤修正、林誠
  • Organizer: 日本育種学会 第121回講演会
  • Place of Presentation: 宇都宮大学
• [Presentation] 内在のレトロトランスポゾンLORE1を用いたミヤコグサの大規模遺伝子タギング系 (2011)
  • Author(s): 深井英吾, 征矢野敬, 梅原洋佐, 中山しのぶ, 岸田佳恵、平川英樹, 田畑哲之, 佐藤修正, 林誠
  • Organizer: 植物微生物研究会第21回研究交流会
  • Place of Presentation: 岡山大学
  • Year and Date: 2011-09-20
• [Presentation] 内在のレトロトランスポゾンLORE1を用いたミヤコグサの大規模遺伝子タギング系 (2011)
  • Author(s): 深井英吾，征矢野敬，梅原洋佐，中山しのぶ，岸田佳恵，平川英樹，田畑哲之，佐藤修正，林誠
  • Organizer: 植物微生物研究会 第21回研究交流会
  • Place of Presentation: 岡山大学
• [Remarks] 所属研究室のウェブサイト
  • URL: http://www.nias.affrc.go.jp/org/DivPlant/Symbiosis/