Construction of a vector library for silencing 72 metabolic genes

• Project/Area Number: 23780096
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Research Field: Applied microbiology
• Research Institution: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• Principal Investigator: NAKASHIMA Nobutaka 独立行政法人産業技術総合研究所, 生物プロセス研究部門, 主任研究員 (70357622)
• Project Period (FY): 2011 – 2012
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2012)
• Budget Amount: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2012: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000); Fiscal Year 2011: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
• Keywords: 微生物ゲノム / アンチセンスRNA / 大腸菌 / ピルビン酸 / 遺伝子サイレンシング / 中央代謝経路 / 遺伝子 / サイレンシング / 代謝経路

Research Abstract

The central metabolic pathway of Escherichia coli consists of 60 reaction steps, in which 72 gene products are involved. In order to analyze these reaction steps comprehensively, 72 vectors were constructed that express antisense RNAs against these 72 gen

Research Products

• [Journal Article] Gene silencing in Escherichia coli using antisense RNAs expressed from doxycycline-inducible vectors (2013)
  • Author(s): 中島信孝
  • Journal Title: Letters in applied microbiology Volume: 印刷中
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Subtracting gene function by gene silencing and disruption in bacteria (2012)
  • Author(s): 中島信孝 、Shan Goh 、田村具博
  • Journal Title: Current biotechnology Volume: 1巻 Pages: 166-174
  • URL: http://www.benthamdirect.org/pages/b_viewarticle.php?articleID=3176089
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A new carbon catabolite repression mutation of Escherichia coli, mlc*, and its use for producing isobutanol (2012)
  • Author(s): 中島信孝、田村具博
  • Journal Title: Journal of bioscience and bioengineering Volume: 114巻 Issue: 1 Pages: 38-44
  • DOI: 10.1016/j.jbiosc.2012.02.029
  • NAID: 110009479362
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Subtracting Gene Function by Gene Silencing and Disruption in Bacteria (2012)
  • Author(s): 中島信孝
  • Journal Title: Current biotechnology Volume: 1 Pages: 166-174
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A new carbon catabolite repression mutation of Escherichia coli, mlc*, and its use for producing isobutanol. (2012)
  • Author(s): Nobutaka Nakashima and Tomohiro Tamura
  • Journal Title: Journal of Bioscience and Bioengineering Volume: 印刷中
  • NAID: 110009479362
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Gene silencing in Escherichia coli using antisense RNAs expressed from doxycycline-induciblevectors
  • Author(s): 中島信孝、田村具博
  • Journal Title: Letters in applied microbiology Volume: (in press)
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 大腸菌を用いたバイオマスからの有用物質生産と大規模な代謝経路解析 (2013)
  • Author(s): 中島信孝
  • Organizer: 産総研新技術説明会
  • Place of Presentation: 独立行政法人科学技術振興機構東京本部別館(東京都)
  • Year and Date: 2013-02-26
• [Presentation] 大腸菌の代謝工学を用いた有用物質生産 (2012)
  • Author(s): 中島信孝
  • Organizer: 産総研オープンラボ
  • Place of Presentation: 独立行政法人産業技術総合研究所つくばセンター(茨城県)
  • Year and Date: 2012-10-25
• [Presentation] 大腸菌遺伝子の アンチセンス RNA による発現制御 (2012)
  • Author(s): 中島信孝
  • Organizer: アンチセンス・遺伝子・デリバリーシンポジウム2012
  • Place of Presentation: 仙台市民会館(宮城県)
  • Year and Date: 2012-09-26
• [Presentation] 大腸菌遺伝子のアンチセンスRNAによる発現抑制
  • Author(s): 中島信孝
  • Organizer: アンチセンス・遺伝子・デリバリーシンポジウム2012
  • Place of Presentation: 仙台市
  • Invited
• [Presentation] 大腸菌の代謝工学を用いた有用物質生産
  • Author(s): 中島信孝
  • Organizer: 産総研オープンラボ
  • Place of Presentation: つくば市
• [Presentation] 大腸菌を用いたバイオマスからの有用物質生産と大規模な代謝経路解析
  • Author(s): 中島信孝
  • Organizer: 産総研新技術説明会
  • Place of Presentation: 東京・市ヶ谷
• [Patent(Industrial Property Rights)] 細菌の中央代謝経路を解析する方法、及び該方法に用いるアンチセンス RNA 発現ベクターのセット (2012)
  • Inventor(s): 中島信孝、田村具博
  • Industrial Property Rights Holder: 中島信孝、田村具博
  • Industrial Property Number: 2012-199846
  • Filing Date: 2012-09-11
• [Patent(Industrial Property Rights)] 細菌の中央代謝経路を解析する方法、及び該方法に用いるアンチセンスRNA発現ベクターのセット (2012)
  • Inventor(s): 中島信孝、田村具博
  • Industrial Property Rights Holder: 中島信孝、田村具博
  • Industrial Property Rights Type: 特許
  • Industrial Property Number: 2012-199846
  • Filing Date: 2012-09-11