Highly sensitive, precise and comprehensiveanalysis of gene expression using FFhybrid probe

• Project/Area Number: 23790061
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Research Field: Physical pharmacy
• Research Institution: University of Shizuoka
• Principal Investigator: TODOROKI Kenichiro 静岡県立大学, 薬学部, 准教授 (70341451)
• Project Period (FY): 2011 – 2012
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2012)
• Budget Amount: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000); Fiscal Year 2012: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000); Fiscal Year 2011: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
• Keywords: 分析化学 / 遺伝子解析 / HPLC / フルオラスケミストリー / フルオラス化学

Research Abstract

We have developed a new type of analytical probegene expression -so called FF hybrid probe-that functions through a fluorous separation technique. This probe is consisted of oligonucletotide, fluorescein and perfluorooctyl chain (fluorous tag). By using this probe, sensitive, precise and comprehensive analysis of gene expression could be analyzed.

Research Products

• [Journal Article] Fully automated reagent peak-free liquid chromatography fluorescence analysis of highly polar carboxylic acids using a column-switching system and fluorous scavenging derivatization (2013)
  • Author(s): K. Todoroki, H. Hashimoto, K. Machida, M. Itoyama, T. Hayama, H. Yoshida, H. Nohta, M. Nakashima, M. Yamaguchi
  • Journal Title: Journal of Separation science Volume: 36 Issue: 2 Pages: 232-238
  • DOI: 10.1002/jssc.201200692
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Binary fluorous alkylation of biogenic primary amines with perfluorinated aldehyde followed by fluorous liquid chromatography-tandem mass spectrometry analysis (2012)
  • Author(s): T. Hayama, Y. Sakaguchi, H. Yoshida, M. Itoyama, K. Todoroki, M. Yamaguchi, H. Nohta
  • Journal Title: Analytical chemistry Volume: 84(19) Issue: 19 Pages: 8407-8414
  • DOI: 10.1021/ac3020092
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Chiral amines as reagents for HPLC-MS enantioseparation of chiral carboxylic acids. (2012)
  • Author(s): Tsutsui H, Fujii S, Sakamoto T, Min JZ, Todoroki K, Toyo'oka T
  • Journal Title: Journal of Separation Science Volume: 35 Issue: 13 Pages: 1551-1559
  • DOI: 10.1002/jssc.201200091
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Simultaneous determination of DL-lactic acid and DL-3-hydroxybutyric acid enantiomers in saliva of diabetes mellitus patients by high-throughput LC-ESI-MS/MS. (2012)
  • Author(s): Tsutsui H, Mochizuki T, Maeda T, Noge I, Kitagawa Y, Min JZ, Todoroki K, Inoue K, Toyo'oka T.
  • Journal Title: Analytical and Bioanalytical Chemistry Volume: 404 Issue: 6-7 Pages: 1925-1934
  • DOI: 10.1007/s00216-012-6320-0
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Determination of Histamine in Microdialysis Samples from Guinea Pig Skin by High-performance Liquid Chromatography with Fluorescence Detection (2012)
  • Author(s): T.Yoshitake, S.Ijiri, S.Yoshitake, K.Todoroki, H.Yoshida, J.Kehr, H.Nohta, M.Yamaguchi
  • Journal Title: Skin Pharmacology and Physiology Volume: 25(2) Issue: 2 Pages: 65-72
  • DOI: 10.1159/000330899
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Liquid chromatographic determination of microcystins in water samples following pre-column excimer fluorescence derivatization with 4-(1-pyrene)butanoic acid hydrazide (2012)
  • Author(s): T. Hayama, K. Katoh, T. Aoki, M. Itoyama, K. Todoroki, H. Yoshida, M. Yamaguchi, H. Nohta
  • Journal Title: Analytica Chimica Acta Volume: 755 Pages: 93-99
  • DOI: 10.1016/j.aca.2012.10.009
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Highly Sensitive and Selective Derivatization-LC Method for Biomolecules Based on Fluorescence Interactions and Fluorous Separations (2011)
  • Author(s): K.Todoroki, H.Yoshida, T.Hayama, M.Itoyama, H.Nohta, M.Yamaguchi
  • Journal Title: Journal of Chromatography B Volume: 879(17-18)(Invited Review) Issue: 17-18 Pages: 1325-1337
  • DOI: 10.1016/j.jchromb.2010.11.038
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Selective liquid-chromatographic determination of native fluorescent biogenic amines in human urine based on fluorous derivatization (2011)
  • Author(s): Y.Sakaguchi, H.Yoshida, T.Hayama, M.Itoyama, K.Todoroki, M.Yamaguchi, H.Nohta
  • Journal Title: Journal of Chromatography A Volume: 218(33) Issue: 33 Pages: 5581-5586
  • DOI: 10.1016/j.chroma.2011.05.076
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Liquid Chromatographic Determination of Aminopolycarboxylic Acids in Water Samples Based on Intramolecular Excimer-Forming Fluorescence Derivatization (2011)
  • Author(s): Kenji Katoh, Tadashi Hayama, Miki Itoyama, Kenichiro Todoroki, Hideyuki Yoshida, Masatoshi Yamaguchi, Hitoshi Nohta
  • Journal Title: BUNSEKI KAGAKU Volume: 60 Issue: 1 Pages: 39-44
  • DOI: 10.2116/bunsekikagaku.60.39
  • NAID: 10027409883
  • ISSN: 0525-1931
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Selective determination of cysteines through precolumn double-labeling and liquid chromatography followed by detection of intramolecular FRET (2011)
  • Author(s): Makoto Yoshitake, Hitoshi Nohta, Naoko Sejima, Kenichiro Todoroki, Hideyuki Yoshida and Masatoshi Yamaguchi
  • Journal Title: Analytical and Bioanalytical Chemistry Volume: 399 Issue: 4 Pages: 1665-1675
  • DOI: 10.1007/s00216-010-4461-6
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Fluorous Derivatization and Fluorous-phase Separation for Fluorometric Determination of Naproxen and Felbinac in Human Plasma (2011)
  • Author(s): Y.Sakaguchi, H.Yoshida, T.Hayama, M.Yoshitake, M.Itoyama, K.Todoroki, M.Yamaguchi, H.Nohta
  • Journal Title: Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis Volume: 55(1) Issue: 1 Pages: 176-180
  • DOI: 10.1016/j.jpba.2011.01.011
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Highly Sensitive Capillary Electrophoresis Analysis of N-Linked Oligosaccharides in Glycoproteins Following Fluorescence Derivatization with Rhodamine 110 and Laser-induced Fluorescence Detection (2011)
  • Author(s): S.Ijiri, K.Todoroki, H.Yoshida, T.Yoshitake, H.Nohta, M.Yamaguchi
  • Journal Title: Electrophoresis Volume: 32(24) Issue: 24 Pages: 3499-3509
  • DOI: 10.1002/elps.201100258
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Development of Novel Fluorescence-Derivatization-HPLC Methods Enabling Highly Sensitive and Selective Analysis of Biological Compounds (2011)
  • Author(s): Kenichiro Todoroki
  • Journal Title: Yakugaku Zasshi Volume: 131 Pages: 1207-1211
  • NAID: 130001075910
  • Peer Reviewed
• [Presentation] Dress-upキラルカラムによる光学活性物質のHPLC分離技術の開発 (2012)
  • Author(s): 石井裕大,豊田耕司,轟木堅一郎,閔俊哲,井之上浩一,豊岡利正
  • Organizer: フルオラス科学研究会第5回シンポジウム
  • Place of Presentation: 仙台
  • Year and Date: 2012-11-29
• [Presentation] 蛍光相互作用およびフルオラス分離技術を利用した生体成分の高感度・高選択的誘導体化-LC分析 (2012)
  • Author(s): 轟木堅一郎
  • Organizer: 味の素イノベーション研究所セミナー
  • Place of Presentation: 川崎
  • Year and Date: 2012-06-12
• [Presentation] 蛍光相互作用およびフルオラス分離技術を利用した生体成分の高感度・高選択的誘導体化-LC分析 (2012)
  • Author(s): 轟木堅一郎
  • Organizer: 味の素イノベーション研究所セミナー
  • Place of Presentation: 川崎市
  • Invited
• [Presentation] ヒト爪中糖化中間体の迅速分析法の開発及び糖尿病診断への応用 (2012)
  • Author(s): 閔俊哲
  • Organizer: 第58回日本薬学会東海支部総会・大会
  • Place of Presentation: 静岡市
• [Presentation] ヒト爪中ジアセチルポリアミンの高感度迅速分析法の開発 (2012)
  • Author(s): 諸田有佳
  • Organizer: 第58回日本薬学会東海支部総会・大会
  • Place of Presentation: 静岡市
• [Presentation] イムノアフィニティー精製－HPLCによる血漿中抗体医薬品の選択的分析法の開発 (2012)
  • Author(s): 豊田耕司
  • Organizer: 第10回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム(PPF)2012
  • Place of Presentation: 京都市
• [Presentation] 安定同位体希釈UPLC-MS/MS法による微量血漿中の鎮静剤デクスメデトミジンの迅速測定 (2012)
  • Author(s): 坂本亮
  • Organizer: 第25回バイオメディカル分析科学シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京都内
• [Presentation] 光学活性カルボン酸のキラル誘導体化LC-MS/MS分析 －唾液中DL-乳酸、DL-β-ヒドロキシ酪酸の定量－ (2012)
  • Author(s): 筒井陽仁
  • Organizer: 第25回バイオメディカル分析科学シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京都内
• [Presentation] Rapid and sensitive determination of the intermediates of advanced glycation end products in human nail by UPLC-ESI-TOF-MS (2012)
  • Author(s): Jun Zhe Min
  • Organizer: 19th International Mass Spectrometry Conference (IMSC2012)
  • Place of Presentation: 京都市
• [Presentation] 日本酒中のチオール化合物のスクリーニング (2012)
  • Author(s): 西村麻衣子
  • Organizer: 第104回日本食品衛生学会学術講演会
  • Place of Presentation: 岡山市
• [Presentation] ヒト爪及び毛髪中遊離 D/L-アミノ酸の比を用いた糖尿病診断への試み (2012)
  • Author(s): 閔俊哲
  • Organizer: 新アミノ酸分析研究会 第2回学術講演会
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] アミロイドβペプチドのC-末端アミノ酸配列を利用したトリプシン分解-UPLC-MS/MS定量法の検討 (2012)
  • Author(s): 望月奈々
  • Organizer: 新アミノ酸分析研究会 第2回学術講演会
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] ヒト脳組織中アミロイドβを対象としたC-末端フラグメントターゲットの超高感度UPLC-MS/MSの開発 (2012)
  • Author(s): 井之上浩一
  • Organizer: 第23回クロマトグラフィー科学会議
  • Place of Presentation: 岐阜市
• [Presentation] 高温逆相HPLCによる抗体医薬品の分離挙動解析 (2012)
  • Author(s): 豊田耕司
  • Organizer: 新アミノ酸分析研究会 第2回学術講演会
  • Place of Presentation: 東京都内
• [Presentation] 高温逆相HPLCによる抗体医薬品の分離挙動解析 (2012)
  • Author(s): 中根敦子
  • Organizer: 第23回クロマトグラフィー科学会議
  • Place of Presentation: 岐阜市
• [Presentation] 臭素原子を導入した高い同定能力を有するLC-MS/MS用誘導体化試薬の開発 (2012)
  • Author(s): 望月由布子
  • Organizer: 第23回クロマトグラフィー科学会議
  • Place of Presentation: 岐阜市
• [Presentation] チオウレア構造を有するLC/ESI-MS/MSキラル誘導体化試薬の開発 (2012)
  • Author(s): 長尾竜治
  • Organizer: 第23回クロマトグラフィー科学会議
  • Place of Presentation: 岐阜市
• [Presentation] Dress-upキラルカラムによる光学活性物質のHPLC分離技術の開発 (2012)
  • Author(s): 石井裕大
  • Organizer: フルオラス科学研究会第5回シンポジウム
  • Place of Presentation: 仙台市
• [Presentation] Fluorous Scavenging Derivatization による高極性有機酸の蛍光誘導体化-超高速LC 分析法の開発 (2011)
  • Author(s): 轟木堅一郎,閔俊哲,中島学,豊岡利正
  • Organizer: 第22回クロマトグラフィー科学会議
  • Place of Presentation: 仙台
  • Year and Date: 2011-10-22
• [Presentation] Fluorous Scavenging Derivatization による高極性有機酸の蛍光誘導体化-超高速LC 分析 (2011)
  • Author(s): 轟木堅一郎,閔俊哲,中島学,豊岡利正
  • Organizer: フルオラス科学研究会第4回シンポジウム
  • Place of Presentation: 大阪
  • Year and Date: 2011-10-07
• [Presentation] 分析化学トピックス3点盛り (2011)
  • Author(s): 轟木堅一郎
  • Organizer: 第24回九州分析化学若手の会春の講演会
  • Place of Presentation: 福岡
  • Year and Date: 2011-05-23
• [Presentation] Fluorous Derivatization Combined with LC-MS/MS: Matrix Effect-Free Method for the determination of Biogenic Amines (2011)
  • Author(s): Tadashi Hayama, Ryoko Abe, Rika Kuroki, Miki Itoyama, Kenichiro Todoroki, Hideyuki Yoshida, Hitoshi Nohta, Masatoshi Yamaguchi
  • Organizer: IUPAC International Congress on Analytical Sciences 2011
  • Place of Presentation: Kyoto
• [Presentation] Analysis of Sialo-Sugar Chains Using Fluorous Derivatization Followed by Liquid Chromatography with Tandem Mass Spectrometry (2011)
  • Author(s): Yohei Sakaguchi, Tadashi Hayama, Hideyuki Yoshida, Miki Itoyama, Kenichiro Todoroki, Hitoshi Nohta, Masatoshi Yamaguchi
  • Organizer: IUPAC International Congress on Analytical Sciences 2011
  • Place of Presentation: Kyoto
• [Presentation] 分析化学トピックス3点盛り (2011)
  • Author(s): 轟木堅一郎
  • Organizer: 第24回九州分析化学若手の会春の講演会(招待講演)
  • Place of Presentation: 福岡
• [Presentation] 糖タンパク質中N型糖鎖の高感度キャピラリー電気泳動分析 (2011)
  • Author(s): 井尻聡一郎，轟木堅一郎，吉田秀幸，吉武尚，能田均，山口政俊
  • Organizer: 第18回クロマトグラフィーシンポジウム
  • Place of Presentation: 福岡
• [Presentation] ペンタフルオロフェニル構造を用いる分離指向性誘導体化法の開発 (2011)
  • Author(s): 川見祐介、坂口洋平、吉田秀幸、巴山忠、糸山美紀、轟木堅一郎、能田均、山口政俊
  • Organizer: 第18回クロマトグラフィーシンポジウム
  • Place of Presentation: 福岡
• [Presentation] Fluorous Scavenging Derivatization（FSD）法による病態モデルマウス尿中有機酸の蛍光誘導体化-HPLC 分析 (2011)
  • Author(s): 森 俊訓、橋本裕輝、轟木堅一郎、町田和之、糸山美紀、巴山忠、吉田秀幸、能田均、中島学、山口政俊
  • Organizer: 第48回化学関連支部合同九州大会
  • Place of Presentation: 北九州
• [Presentation] フルオラス誘導体化-オンライン濃縮-蛍光検出法による自然蛍光性カルボン酸の高選択的LC分析 (2011)
  • Author(s): 山下大貴、坂口洋平、池永純、吉田秀幸、糸山美紀、巴山忠、轟木堅一郎、能田均、山口政俊
  • Organizer: 第48回化学関連支部合同九州大会
  • Place of Presentation: 北九州
• [Presentation] フルオラス誘導体化-LC-MS/MS 法によるシアル酸関連化合物の高感度かつ高選択的分析(4) 糖鎖性腫瘍マーカーへの適用 (2011)
  • Author(s): 坂口洋平、巴山忠、吉田秀幸、糸山美紀、轟木堅一郎、能田均、山口政俊
  • Organizer: 第48回化学関連支部合同九州大会
  • Place of Presentation: 北九州
• [Presentation] LC-MSによる光学活性カルボン酸分離分析のための市販のキラル化合物の評価 (2011)
  • Author(s): 筒井陽仁、藤井慎也、閔 俊哲、轟木堅一郎、豊岡利正
  • Organizer: 第24回バイオメディカル分析科学シンポジウム
  • Place of Presentation: 大山
• [Presentation] ヒト毛髪中D,L-アミノ酸の迅速分析 (2011)
  • Author(s): 閔 俊哲、諸田有佳、保坂大樹、轟木堅一郎、豊岡利正
  • Organizer: 第24回バイオメディカル分析科学シンポジウム
  • Place of Presentation: 大山
• [Presentation] 健常人及び癌患者の爪中ポリアミンの分析 (2011)
  • Author(s): 松本暁人、閔 俊哲、東達也、轟木堅一郎、豊岡利正
  • Organizer: 第9回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム（PPF2011）
  • Place of Presentation: 箱根
• [Presentation] Fluorous Scavenging Derivatization法による高極性有機酸の高感度HPLC分析法の開発と病態モデルマウス尿試料分析への適用 (2011)
  • Author(s): 轟木堅⼀郎、橋本裕輝、森 俊訓、町田和之、糸山美紀、巴山 忠、吉田秀幸、能田 均、中島 学、山口政俊
  • Organizer: 第9回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム（PPF2011）
  • Place of Presentation: 箱根
• [Presentation] クーロアレイ型電気化学検出器を用いた唾液中の酸化・還元物質の網羅的測定 (2011)
  • Author(s): 山崎朝子、豊岡利正、閔 俊哲、轟木堅一郎:
  • Organizer: 日本分析化学会第60年会
  • Place of Presentation: 名古屋
• [Presentation] フェネチルアミン系乱用薬物の光学異性体分離分析 (2011)
  • Author(s): 谷口さゆり、平島晴生、稲垣真輔、閔 俊哲、轟木堅一郎、豊岡利正、花尻瑠理、合田幸広
  • Organizer: 日本分析化学会第60年会
  • Place of Presentation: 名古屋
• [Presentation] Fluorous Scavenging Derivatization による高極性有機酸の蛍光誘導体化-超高速LC 分析 (2011)
  • Author(s): 轟木堅一郎、閔 俊哲、中島 学、豊岡利正
  • Organizer: フルオラス科学研究会第４回シンポジウム
  • Place of Presentation: 大阪
• [Presentation] Determination of DL-amino acids, derivatized with R(-)-DBD-PyNCS, in nail of diabetic patients by UPLC-ESI-TOF-MS (2011)
  • Author(s): Jun Zhe Min, Suguru Hatanaka, Tatsuya Higashi, Kenichiro Todoroki, Toshimasa Toyo’oka
  • Organizer: 37th International Symposium on High Performance Liquid Phase Separations and Related Techniques (HPLC 2011)
  • Place of Presentation: Dalian, China
• [Presentation] UPLC-TOF-MSを用いたヒト毛髪中遊離D-アミノ酸の分析 (2011)
  • Author(s): 閔 俊哲、保坂大樹、諸田有佳、轟木堅一郎、豊岡利正
  • Organizer: 第22回クロマトグラフィー科学会議
  • Place of Presentation: 仙台
• [Presentation] 生体内光学活性カルボン酸の誘導体化LC-MS/MS分析 (2011)
  • Author(s): 筒井陽仁、藤井慎也、閔 俊哲、轟木堅一郎、豊岡利正
  • Organizer: 第22回クロマトグラフィー科学会議
  • Place of Presentation: 仙台
• [Remarks]
  • URL: http://w3pharm.u-shizuoka-ken.ac.jp/~analchem/