乳児期を中心とした小児急性白血病と骨髄異形成症候群における新規原因遺伝子の解析

• Project/Area Number: 23791151
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Research Field: Pediatrics
• Research Institution: Gunma University
• Principal Investigator: 柴 徳生 群馬大学, 医学部, 医員 (50600615)
• Project Period (FY): 2011 – 2012
• Project Status: Discontinued (Fiscal Year 2011)
• Budget Amount: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000); Fiscal Year 2013: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2012: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2011: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
• Keywords: CBL / NUP98-NSD1 / 小児 / 白血病 / JMML / AML / DNMT3A

Research Abstract

若年性骨髄単球性白血病(JMML)24例を対象にしたSNPアレイを用いた網羅的な遺伝子コピー数解析の結果、11q23領域に片親性ダイソミーを見出し、この領域内にあるCBL遺伝子変異を同定した。CBL変異陽性例はPTPN11等の既知の遺伝子変異を認めず、CBLは新たな責任遺伝子と考えられた。また、RUNX1変異を有する家族性血小板異常症で慢性骨髄単球性白血病(CMML)を発症した1女児例で、GMML発症後の検体のみからCBL遺伝子変異を同定し、RUNX1変異に付加的な異常を初めて報告した。さらに、乳児急性リンパ性白血病、治療関連白血病においてもCBL遺伝子のミスセンス変異を同定し、リンパ性白血病でのCBL遺伝子変異の報告は初であり、乳児白血病の病因解明に寄与すると考えられた。
また、小児急性骨髄性白血病(AML)の臨床試験であるAML99プロトコールに登録された124例で、NUP98-NSD1遺伝子再構成を6例(4.8%)に見出し、有意に予後不良(4年全生存率;33%)であることを突き止めた。NUP98-NSD1は現在準備中の次期AML-12プロトコールに予後不良因子として採用が決まっている。さらに、先に実施したマイクロアレイを用いた遺伝子発現アレイ解析の結果とあわせて検討を行ったところ、NUP98-NSD1遺伝子再構成6例は特徴的な遺伝子発現パターンを示し、NUP98-NSD1遺伝子再構成陰性例中18例で、この6列と同様の発現パターンを示すことを見出し、この一群(NUP98-NSD1 signature群)の予後もNUP98-NSD1遺伝子再構成例同様不良であった(4年全生存率;37.5%)。
最終年度は、次世代シークエンサーを用いた小児AML24例の遺伝子解析を行い、複数の新規発症候補遺伝子を同定した。現在、小児AML192例においてその頻度および臨床的な意義を解析中である。

Research Products

• [Journal Article] CBL mutation in chronic myelomonocytic leukemia secondary to familial platelet disorder with propensity to develop acute myeloid leukemia (FPD/AML). (2012)
  • Author(s): Shiba N, Hasegawa D, Park MJ, Murata C, Sato-Otsubo A, Ogawa C, Manabe A, Arakawa H, Ogawa S, Hayashi Y.
  • Journal Title: Blood Volume: 119 Pages: 2612-4
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] CBL mutations in infant acute lymphoblastic leukaemia. (2012)
  • Author(s): Shiba N, Park MJ, Taki T, Takita J, Hiwatari M, Kanazawa T, Sotomatsu M, Ishii E, Arakawa H, Ogawa S, Hayashi Y.
  • Journal Title: Br J Haematol. Volume: 156 Pages: 672-4
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] DNMT3A mutations are rare in childhood acute myeloid leukaemia, myelodysplastic syndromes and juvenile myelomonocytic leukaemia. (2012)
  • Author(s): Shiba N, Taki T, Park MJ, Shimada A, Sotomatsu M, Adachi S, Tawa A, Horibe K, Tsuchida M, Hanada R, Tsukimoto I, Arakawa H, Hayashi Y.
  • Journal Title: Br J Haematol. Volume: 156 Pages: 413-4
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] NUP98-NSD1 gene fusion and its related gene expression signature are strongly associated with apoor prognosis inpediatric acute myeloid leukemia
  • Author(s): Norio Shiba, et al.
  • Journal Title: Genes Chromosomes and Cancer Volume: (in press)
  • Peer Reviewed
• [Presentation] Whole exome sequencing reveals spectrum of gene mutations in pediatric AML (2012)
  • Author(s): Norio Shiba
  • Organizer: 第54回米国血液学会
  • Place of Presentation: アトランタ(米国)
  • Year and Date: 2012-12-09
• [Presentation] GATA2 mutations in pediatric acute myeloid leukemia (2012)
  • Author(s): Norio Shiba
  • Organizer: 第54回米国血液学会
  • Place of Presentation: アトランタ(米国)
  • Year and Date: 2012-12-09
• [Presentation] NUP98-NSD1 related gene expression signature is strongly associated with a poor prognosis in pediatric acute myeloid leukemia (2012)
  • Author(s): Norio Shiba
  • Organizer: 第54回米国血液学会
  • Place of Presentation: アトランタ(米国)
  • Year and Date: 2012-12-08
• [Presentation] GATA2 mutations in pediatric acute myeloid leukemia (2012)
  • Author(s): 柴徳生
  • Organizer: 第54回日本小児血液学会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2012-12-01
• [Presentation] Identification of Scmatic Mutations in pediatric Acute Myeloid Leukeimia Using Whole-Exoroe Sequencing (2012)
  • Author(s): 柴徳生
  • Organizer: 第54回日本小児血液学会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2012-12-01
• [Presentation] Whole exome resequencing reveals novel gene mutaions in pediatric AML (2012)
  • Author(s): 柴徳生
  • Organizer: 第72回日本血液学会
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 2012-10-21
• [Presentation] NUP98-NSD1 related gene expression signature is associated with a poor prognosis in pediatric AML (2012)
  • Author(s): 柴徳生
  • Organizer: 第72回日本血液学会
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 2012-10-21
• [Presentation] Identification of Somatic Mutations in pediatric Acute Myeloid Leukeimia Using Whole-Exome Sequencing (2012)
  • Author(s): 柴徳生
  • Organizer: 第71回日本癌学会
  • Place of Presentation: 札幌
  • Year and Date: 2012-09-21
• [Presentation] 発現アレイを用いた小児急性骨髄性白血病におけるNUP98-NSD1再構成関連群の解析 (2012)
  • Author(s): 柴徳生
  • Organizer: 第115回日本小児科学会
  • Place of Presentation: 福岡
  • Year and Date: 2012-04-20
• [Presentation] NUP98-NSD1 Fusion Gene Is Strongly Associated with a Poor Prognosis in Pediatric Acute Myeloid Leukemia: A Study of the Japanese Childhood AML99 Cooperative Study Group (2011)
  • Author(s): Norio Shiba, Tomohiko Taki, Myoung-ja Park, MD, Hitoshi Ichikawa, Manabu Sotomatsu, Souichi Adachi, Akio Tawa, Keizo Horibe, Hirokazu Arakawa, and Yasuhide Hayashi
  • Organizer: American Society of Hematology (ASH)
  • Place of Presentation: San Diego, USA
• [Presentation] CBL mutations in pediatric leukemia including therapy-related leukemia and infant leukemia (2011)
  • Author(s): SHIBA Norio, TAKI Tomohiko, PARK Myoung-ja, and HAYASHI Yasuhide
  • Organizer: 第70回日本癌学会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場、名古屋
• [Presentation] CBL Mutation in Chronic Myelomonocytic Leukemia Secondary to Familial Platelet Disorder with Propensity to Develop Acute Myeloid Leukemia (FPD/AML) (2011)
  • Author(s): Norio Shiba, Daisuke Hasegawa, Myoung-ja Park, Chisato Murata, Aiko Matsubara, Chitose Ogawa, Atsushi Manabe, Hirokazu Arakawa, Seishi Ogawa, and Yasuhide Hayashi
  • Organizer: 第73回日本血液学会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場、名古屋