The role of acetylation of histone variant H2AZ in chromatin dynamics upon DNA damage

• Project/Area Number: 23810015
• Research Category: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Risk sciences of radiation/Chemicals
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: MATSUDA Ryo 京都大学, 放射線生物研究センター, 研究員 (70614155)
• Project Period (FY): 2011 – 2012
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2012)
• Budget Amount: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000); Fiscal Year 2012: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2011: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
• Keywords: TIP60 複合体 / ヒストン H2AX / ヒストン H2AZ / アセチル化 / DNA 損傷応答 / TIP60複合体 / ヒストンH2AX / ヒストンH2AZ / DNA損傷応答

Research Abstract

To understand the role of acetylation in chromatin dynamics upon DNA damage, we purified the DNA helicase TAP54, which is the component of the TIP60 histone acetyltransferase (HAT) complex, from nuclear extract of HeLa cells. We found that TAP54 complex has HAT activity. Mass spetrometry (MS) analysis indicated that histone acetyltranferase, which is different from TIP60, and histone variant H2AZ were identified in the TAP54 complex. Since we have already shown that TIP60 acetylates histone variant H2AX upon DNA damage, these findings suggest that the cross talk between acetylation of H2AX and H2AZ has important roles in DNA damage response.

Research Products

• [Journal Article] The actin family member Arp6 and the histone variant H2A.Z are required for spatial positioning of chromatin in chicken cell nuclei. (2012)
  • Author(s): Maruyama E., Hori T., Tanabe H., Kitamura H., Matsuda R., Tone S., Pavel H., Habermann FA., Hase JV, Cremer C., Fukagawa T, and Harata(equal first authors)
  • Journal Title: Journal of Cell Science Volume: 125 Pages: 3739-3743
  • DOI: 10.1242/jcs.103903
  • Peer Reviewed
• [Presentation] The role of chromatin dynamics in DNA damage-induced checkpoint activation (2013)
  • Author(s): Masae Ikura, Ryo Matsuda, Tsuyoshi Ikura
  • Organizer: 第3回 広島大学原爆放射線医科学研究所 第3回国際シンポジウム
  • Year and Date: 2013-02-12
• [Presentation] The role of chromatin dynamics in DNA damage-induced checkpoint activation (2013)
  • Author(s): Tsuyoshi Ikura
  • Organizer: 第3回 広島大学原爆放射線医科学研究所 第3回国際シンポジウム
  • Place of Presentation: 広島大学霞キャンパス 広仁会館（広島県）
• [Presentation] ヒトアクチンファミリー遺伝子ノックアウト細胞を用いたヒト INO80 複合体のゲノム安定性維持および酸化ストレス応答における機能解析 (2012)
  • Author(s): 高橋裕一郎、松田涼、北村大志、西島仁、柴原慶一、原田昌彦
  • Organizer: 第35回分子生物学会年会
  • Year and Date: 2012-12-11
• [Presentation] DNA 損傷応答におけるヒストン H2AX とH2AZ のアセチル化クロストーク (2012)
  • Author(s): 松田涼、井倉正枝、原田昌彦、田代聡、井倉毅
  • Organizer: 放射線影響学会
  • Place of Presentation: 東北大学
  • Year and Date: 2012-09-07
• [Presentation] DNA損傷応答におけるヒストンH2AXとH2AZのアセチル化クロストーク (2012)
  • Author(s): 松田 涼
  • Organizer: 第55回放射線影響学会
  • Place of Presentation: 東北大学（宮城県）
• [Presentation] ヒトアクチンファミリー遺伝子ノックアウト細胞を用いたヒトINO80複合体のゲノム安定性維持および酸化ストレス応答における機能解析 (2012)
  • Author(s): 高橋 裕一郎
  • Organizer: 第35回分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡県）
• [Presentation] The role of histone H2AX eviction in DNA damage-induced check point activation (2011)
  • Author(s): 井倉毅
  • Organizer: 第34回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2011-12-15
• [Presentation] ヒトhArp5およびhArp8遺伝子ノックアウト細胞を用いたINO80クロマチンリモデリング複合体の機能解析 (2011)
  • Author(s): 高橋裕一郎
  • Organizer: 第34回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2011-12-15