Project/Area Number |
23H03495
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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Allocation Type | Single-year Grants |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related
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Research Institution | Tokyo Institute of Technology |
Principal Investigator |
柳澤 渓甫 東京工業大学, 情報理工学院, 助教 (40866646)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
吉野 龍ノ介 筑波大学, 医学医療系, 助教 (50817575)
和久井 直樹 長岡工業高等専門学校, 電気電子システム工学科, 准教授 (80786038)
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Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2027-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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Budget Amount *help |
¥18,590,000 (Direct Cost: ¥14,300,000、Indirect Cost: ¥4,290,000)
Fiscal Year 2023: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000)
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Keywords | 共溶媒分子動力学 / 環状ペプチド / 分子設計 / 創薬支援計算 / 標的タンパク質選抜 |
Outline of Research at the Start |
タンパク質間相互作用 (PPI) を標的とするような薬剤設計において、環状ペプチドが注目されている。RaPID法など、タンパク質に結合する環状ペプチドを実験的に発見することは可能であるが、どのような結合構造を示すかを知る必要がある。 本研究では、アミノ酸プローブを導入した共溶媒分子動力学シミュレーションと、タンパク質表面上におけるアミノ酸配置の組合せの最適化を行うことで、薬剤標的タンパク質の新規発見と、環状ペプチドの設計を同時に行う手法を開発する。従来独立に行われてきた標的タンパク質の探索と薬剤分子設計の同時実行は、標的タンパク質の選択に新たな指針を与え、薬剤分子設計を容易にするものである。
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