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電子伝達系たんぱく質の光反応初期過程解明

Research Project

Project/Area Number 23K03349
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 13040:Biophysics, chemical physics and soft matter physics-related
Research InstitutionKanagawa University

Principal Investigator

籔下 篤史  神奈川大学, 付置研究所, 研究員 (20376536)

Project Period (FY) 2023-04-01 – 2028-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2027: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2026: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2025: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Keywords超高速分光
Outline of Research at the Start

ヘム蛋白は生体内で様々な重要な機能を担っており、これらのヘム蛋白の機能を制御するためにはどのように機能が開始するか解明する必要があるが、その初期反応メカニズムは未だに解明されていない。
本研究は申請者が独自開発を行っている超短パルスレーザーと高速フェムト秒分光装置を用い、ヘム蛋白の初期反応メカニズムを解明する。測定対象は、電子輸送系を担うシトクロムcを含むヘム蛋白である。超短紫外パルスレーザーを開発、及びそれによる分光を行うことで、2原子分子の乖離、再結合に伴う分子構造変化やそのダイナミクスが明らかとし、ヘム蛋白の機能制御を行う医薬品開発につながる重要な知見を与える。

Outline of Annual Research Achievements

本研究課題ではたんぱくの光反応における初期反応メカニズムを、超短パルスレーザーと超高速分光システムを開発して、それを用いて観測することにより初めて明らかにするものである。
一般的な分子振動周期である20フェムト秒よりもはるかに短いパルス幅のレーザーを用いることにより、分子構造が分子振動の周期でリアルタイムに変化している様子が可視化される。これにより光励起した反応がどのような構造変化を伴って進行するのかを明らかにすることができる。
たんぱくの光反応においては、発色団の光励起から反応が始まるが、その発色団を取り囲む環境であるアミノ酸残基の配置とその発色団への結合が、その後に続く反応に大きな影響を与えると考えられる。
たんぱくの光反応へ与えるアミノ酸残基の影響を見る研究の一環として、赤色蛍光たんぱくであるtagRFPにとその突然変異体であるtagRFP-Tに対して超高速分光実験を行った。このtagRFP-TはもともとのtagRFPに比べて9倍ほど高い光安定性が報告されている。この突然変異体が持つ光安定性は加えた突然変異によるアミノ酸残基との結合の変化が発色団の光異性化を可能にして、失活した発光性を再度活性化させるのではないかということが提案されているが、実際に光異性化がどのようにして活性化されどのようなタイムスケールで進行するのかという実験的証拠は得られていなかった。
本研究でtagRFPとtagRFP-Tの超高速分光を行い、その詳細なデータの解析を行い比較した結果、突然変異体では特定の分子振動モードが励起され、フェムト秒領域で発色団の光異性化が進むため、その光安定性の向上が得られるということが初めて明らかとなった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

たんぱくの光反応へ与えるアミノ酸残基の影響を見る研究の一環として、赤色蛍光たんぱくであるtagRFPにとその突然変異体であるtagRFP-Tに対して超高速分光実験を行った。このtagRFP-TはもともとのtagRFPに比べて9倍ほど高い光安定性が報告されている。この突然変異体が持つ光安定性は加えた突然変異によるアミノ酸残基との結合の変化が発色団の光異性化を可能にして、失活した発光性を再度活性化させるのではないかということが提案されているが、実際に光異性化がどのようにして活性化されどのようなタイムスケールで進行するのかという実験的証拠は得られていなかった。
本研究でtagRFPとtagRFP-Tの超高速分光を行い、その詳細なデータの解析を行い比較した結果、突然変異体では特定の分子振動モードが励起され、フェムト秒領域で発色団の光異性化が進むため、その光安定性の向上が得られるということが初めて明らかとなった。
この実験やデータ解析に時間がかかるのみならず、結果の解釈には理論計算との対比も必要であるため、当初研究結果の発表まで時間がかかると思われたが、予想以上に研究が進展し、下記の雑誌に研究結果を発表することができた。
"Excited State Vibrational Dynamics Reveals a Photocycle That Enhances the Photostability of the TagRFP-T Fluorescent Protein", Atsushi Yabushita*, Chia-Yun Cheng, Ying Kuan Ko, Takayoshi Kobayashi, Izumi Iwakura, and Ralph Jimenez, J. Phys. Chem. B, 128, 5, 1188-1193 (2024)

Strategy for Future Research Activity

ここでえられたtagRFPとtagRFP-Tの比較実験により、発色団周辺のアミノ酸残基の配置がそのたんぱくの機能に大きく影響を与えることが実験的に示された。これはtagRFPのみならず他の蛍光たんぱくに対しても同様であることが期待される。本年度に発表した論文の共著者であるJimenez教授のグループと共同研究を進め、さまざまな蛍光たんぱくの突然変異体に対して新しい機能発現のメカニズムを探る研究を進めていきたいと考えている。
ここで用いている超短パルスレーザーと高速スキャンフェムト秒分光システムは我々独自に開発したシステムでありきわめて独創性の高くオリジナリティの高いデータが得られるが、さらに2次元電子分光などの新しい手法を取り入れることにより、これまでの分光手法では解析が難しかったエネルギー移動や電荷移動のダイナミクスを反映した電子状態のカップリングの強さを評価できるようになるため、そのための分光システムの構築も目指したい。
特にヘムたんぱくのひとつであるシトクロムcは細胞内の電子伝達系チャンネルの機能に必須なたんぱくであり、呼吸のための電子輸送、活性酸素の除去、細胞のアポトーシスなどのコントロールを行っている。2次元電子分光法を用いてシトクロムcの光励起後の電荷移動ダイナミクスを明らかにすることで、シトクロムcがかかわっている上記の様々なプロセスをコントロールするための指針となる研究結果が得られると期待される。

Report

(1 results)
  • 2023 Research-status Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2024 2023 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Colorado Boulder(米国)

    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] National Yang Ming Chiao Tung University(その他の国・地域)

    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Journal Article] Excited State Vibrational Dynamics Reveals a Photocycle That Enhances the Photostability of the TagRFP-T Fluorescent Protein2024

    • Author(s)
      Yabushita Atsushi、Cheng Chia-Yun、Ko Ying Kuan、Kobayashi Takayoshi、Iwakura Izumi、Jimenez Ralph
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry B

      Volume: 128 Issue: 5 Pages: 1188-1193

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.3c07212

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Directly Unveiling the Energy Transfer Dynamics between Alq<sub>3</sub> Molecules and Si by Ultrafast Optical Pump?Probe Spectroscopy2023

    • Author(s)
      Tai Yu-Chan、Tzeng Wen-Yen、Lin Jhen-Dong、Kuo Yi-Hou、Chen Fu-Xiang Rikudo、Tu Ruei-Jhe、Huang Ming-Yang、Pai Shyh-Shii、Chang Nick Weihan、Tseng Sheng-Yang、Chen Chi、Lin Chun-Liang、Yabushita Atsushi、Cheng Shun-Jen、Luo Chih-Wei
    • Journal Title

      Nano Letters

      Volume: 23 Issue: 22 Pages: 10490-10497

    • DOI

      10.1021/acs.nanolett.3c03251

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Ultrafast electronic and vibrational dynamics in carbon nanotubes dependent on chirality and alkylation2024

    • Author(s)
      Atsushi Yabushita, Shih-Wen Kai, Chia-Hung Lin, Hsuan-Yu Ou, Ying-Kuan Ko, Yutaka Maeda, Takayoshi Kobayashi
    • Organizer
      the 7th International Symposium on Frontiers in Materials Science (FMS 2024)
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Ultrafast electronic and vibrational dynamics of TagRFP under mutation to improve photostability2023

    • Author(s)
      Atsushi Yabushita, Chia-Yun Cheng, Izumi Iwakura, Takayoshi Kobayashi
    • Organizer
      The 2024 Annual Meeting (TPS 2024)
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Initial reaction dynamics of a red fluorescent protein TagRFP under mutation of S158T observed by 10fs visible laser pulse2023

    • Author(s)
      Atsushi Yabushita,QiuJun Lin,Ying Kuan Ko,Takayoshi Kobayashi, Izumi Iwakura, Ralph Jimenez
    • Organizer
      The 1st International Symposium “Laser control technology for innovation of biomedical and electronics
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Vibrational energy transfer between carbon nanotubes observed by ultrashort visible pulse laser2023

    • Author(s)
      Atsushi Yabushita, Nishant Kumar Pathak, Yui Konno, Ying Kuan Ko, Yutaka Maeda, Takayoshi Kobayashi, Bhaskar Kanseri
    • Organizer
      The 31st International Conference on Photochemistry (ICP2023)
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 10fs可視光パルスによる蛍光たんぱくTagRFPの超高速ダイナミクス測定2023

    • Author(s)
      籔下篤史,QiuJun Lin,Ying Kuan Ko,岩倉いずみ,小林孝嘉
    • Organizer
      日本物理学会第78回年次大会
    • Related Report
      2023 Research-status Report

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Published: 2023-04-13   Modified: 2024-12-25  

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