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Development of oligosaccharide production by using novel alpha-glucan-hydrolyzing enzymes with strict substrate specificity

Research Project

Project/Area Number 23K05039
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 38030:Applied biochemistry-related
Research InstitutionShizuoka University

Principal Investigator

宮崎 剛亜  静岡大学, グリーン科学技術研究所, 准教授 (30775721)

Project Period (FY) 2023-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywords多糖 / イソマルトース / デキストラン / 糖質加水分解酵素 / オリゴ糖 / CAZy / コージビオース / ニゲロース / 乳酸菌 / グルコース / 菌体外多糖
Outline of Research at the Start

一部の乳酸菌はバイオフィルムとして、グルコースがα-1,6結合で重合したデキストランを産生する。種や株によってはα-1,2結合やα-1,3結合を多く含むα-グルカンを合成し、複雑な構造を持っている。α-1,2結合やα-1,3結合からなるオリゴ糖であるコージビオースやニゲロースは機能性が報告されているオリゴ糖であるが、非常に高価である。本研究では、研究代表者が発見したα-1,2、α-1,3、α-1,6結合を特異的に加水分解する酵素の基質特異性と立体構造の知見を基に、乳酸菌α-グルカンから機能性をオリゴ糖を生産する技術を開発することを目的とする。

Outline of Annual Research Achievements

α-グルカンは、天然に最も多く存在する単糖であるグルコースがα-(1→X)結合で重合した多糖の総称であり、澱粉やデキストランなどが含まれる。本研究は、α-(1→X)-グルコシド結合特異性の厳密な酵素の基質特異性の構造基盤を得て、これらの酵素を駆使することによってα-グルカンから機能性オリゴ糖を得るための新しい変換技術を提案することを目的とする。本年度は、(1) 乳酸菌Leuconostoc citreumが産生する菌体外多糖・多分岐デキストランの資化に関与する土壌細菌Flavobacterium johnsoniae由来酵素および糖結合タンパク質の構造機能解析、(2) 新規配列を有するデキストラン分解酵素の立体構造解析、(3) その他のα-(1→X)-グルカン分解酵素とそのホモログ酵素の構造解析を行った。(1)に関しては、先行研究で構造解析が行われたデキストラナーゼFjDex31Aとα-1,2-グルコシダーゼFjGH65Aに加えてデキストラナーゼFjGH66とグルコデキストラナーゼFjGH97AについてX線結晶構造解析に成功し、これらの酵素が協同して多分岐デキストランを分解していることを生化学的、分子生物学的に立証した。本研究はJ. Biol. Chem.に論文として発表した。(2)と(3)については新たに複数のα-グルカン分解酵素のX線結晶構造解析に成功した。(3)に関連して、α-グルコシダーゼが主に分類される糖質加水分解酵素ファミリー31から新規な細菌由来α-1,4-ガラクトシダーゼを発見し、その構造機能相関についてFEBS J.に論文として発表した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

初年度で、本研究の基盤となる論文を発表でき、本研究において重要な新規配列を有するデキストラン分解酵素の立体構造解析に成功したため。

Strategy for Future Research Activity

新たにX線結晶構造解析に成功した酵素については、基質認識機構および反応機構の解明が求められるため、変異体の解析やリガンドとの複合体構造解析を行う。これらを解明できた複数の酵素を用いて、乳酸菌多分岐デキストランの分解実験を行い、精製したオリゴ糖の単離や構造解析を行っていく予定である。

Report

(1 results)
  • 2023 Research-status Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2024 2023 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 2 results) Presentation (7 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] 微生物由来α-グルカンを分解する酵素の構造と機能に関する研究2024

    • Author(s)
      宮崎 剛亜
    • Journal Title

      応用糖質科学

      Volume: 14 Pages: 14-26

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] [Review] Structure-function Analysis of GH65 α-1,2-Glucosidase and Related Enzymes Discovered in the Dextran Utilization Locus2023

    • Author(s)
      中村 駿太郎、倉田 陸矢、仁平 高則、中井 博之、殿塚 隆史、舟根 和美、朴 龍洙、宮崎 剛亜
    • Journal Title

      Bulletin of Applied Glycoscience

      Volume: 13 Issue: 2 Pages: 124-134

    • DOI

      10.5458/bag.13.2_124

    • ISSN
      2185-6427, 2424-0990
    • Year and Date
      2023-08-20
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Utilization of dietary mixed-linkage β-glucans by the Firmicute Blautia producta2023

    • Author(s)
      Singh Ravindra Pal、Niharika Jayashree、Thakur Raksha、Wagstaff Ben A.、Kumar Gulshan、Kurata Rikuya、Patel Dhaval、Levy Colin W.、Miyazaki Takatsugu、Field Robert A.
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 299 Issue: 6 Pages: 104806-104806

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2023.104806

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Bacteroidota polysaccharide utilization system for branched dextran exopolysaccharides from lactic acid bacteria2023

    • Author(s)
      Nakamura Shuntaro、Kurata Rikuya、Tonozuka Takashi、Funane Kazumi、Park Enoch Y.、Miyazaki Takatsugu
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 299 Issue: 7 Pages: 104885-104885

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2023.104885

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structure-function analysis of bacterial GH31 α‐galactosidases specific for α‐(1→4)‐galactobiose2023

    • Author(s)
      Ikegaya Marina、Park Enoch Y.、Miyazaki Takatsugu
    • Journal Title

      The FEBS Journal

      Volume: 290 Issue: 20 Pages: 4984-4998

    • DOI

      10.1111/febs.16904

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 微生物由来α-(1→3)-glucanの資化に関与する糖質加水分解酵素の機能解析2024

    • Author(s)
      岡 希望, 木村 聡, 岩田 忠久, 宮崎 剛亜
    • Organizer
      日本農芸化学会2024年度大会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Bacteroidota門細菌由来GH13_38酵素のX線結晶構造解析2024

    • Author(s)
      中村 駿太郎, 宮崎 剛亜
    • Organizer
      日本農芸化学会2024年度大会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Flavobacterium johnsoniae 由来 GH13_38 酵素の性質解析2023

    • Author(s)
      中村 駿太郎, 宮崎 剛亜
    • Organizer
      日本応用糖質科学会2023年度(第72回)大会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 微生物由来α-グルカンを分解する酵素の構造と機能に関する研究2023

    • Author(s)
      宮崎 剛亜
    • Organizer
      日本応用糖質科学会2023年度(第72回)大会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] GH31 ファミリーからの新規酵素の探索および構造と機能の解析2023

    • Author(s)
      池谷 真里奈, 朴 龍洙, 宮崎 剛亜
    • Organizer
      第12回応用糖質科学シンポジウム
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Flavobacterium johnsoniae 由来 GH13_38 酵素の基質特異性の解析2023

    • Author(s)
      中村 駿太郎, 宮崎 剛亜
    • Organizer
      糖鎖科学中部拠点 第19回「若手の力」フォーラム
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 乳酸菌の菌体外多糖・多分岐デキストランを分解する酵素群の構造と機能2023

    • Author(s)
      宮崎 剛亜
    • Organizer
      第20回 糖鎖科学コンソーシアムシンポジウム
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Invited
  • [Remarks] 静岡大学農学部酵素化学研究室ウェブサイト

    • URL

      https://wwp.shizuoka.ac.jp/glycoenzyme/

    • Related Report
      2023 Research-status Report

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Published: 2023-04-13   Modified: 2024-12-25  

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