分子進化解析手法とpanゲノム情報を用いた高精度コムギ多型マーカー作成法の開発

• Project/Area Number: 23K05179
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 39010:Science in plant genetics and breeding-related
• Research Institution: National Agriculture and Food Research Organization
• Principal Investigator: 田中 剛 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 基盤技術研究本部, 上級研究員 (70414919)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2026-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2023)
• Budget Amount: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2025: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2024: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2023: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
• Keywords: ゲノム育種 / 比較ゲノム / コムギ

Outline of Research at the Start

次世代シーケンス（NGS）技術の革新によってゲノム育種が加速している。しかし、パンコムギなどの高次倍数性植物におけるマーカー開発は、品種間多型と同祖遺伝子間多型が区別できず、２倍体のモデル植物で開発された育種技術の活用ができない。本研究では、分子進化解析手法を用いた、品種間多型と相同遺伝子間多型を区別する手法開発と、検出された品種間多型からマーカーを迅速に構築するシステム開発を実施する。