Identification of the causative gene for the "red color" mutation in coral trout using parent-offspring trio genome analysis

Research Project

Project/Area Number	23K05391
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 40040:Aquatic life science-related
Research Institution	Fisheries Research and Education Agency
Principal Investigator	宇治督国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産技術研究所(長崎), グループ長 (40372049)
Project Period (FY)	2023-04-01 – 2026-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help	¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000) Fiscal Year 2025: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000) Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000) Fiscal Year 2023: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Keywords	スジアラ / 親子トリオ解析 / ゲノム / 突然変異体 / ハタ類
Outline of Research at the Start	申請者は沖縄三大高級魚のスジアラの赤い体色をもつ突然変異体を保持している。スジアラは赤いことに経済的価値があるため、この突然変異体は経済的価値が高いが、赤い原因は不明である。そこで、この突然変異の原因遺伝子を突き止めることを目的として、両親２匹と突然変異体の全ゲノム比較解析を主に、突然変異体と野生型の比較トランスクリプトーム解析および連鎖解析を組み合わせることで原因遺伝子を推定する。この突然変異体の原因遺伝子が同定できれば、マーカーアシスト選抜やゲノム編集等により経済価値の高いスジアラ家系を作りだせる。