| Project/Area Number |
23K05573
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 42020:Veterinary medical science-related
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| Research Institution | Rakuno Gakuen University |
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Principal Investigator |
大田 寛 酪農学園大学, 獣医学群, 准教授 (50431333)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
横山 望 北海道大学, 獣医学研究院, 助教 (60599059)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
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| Keywords | 慢性腸炎 / 小細胞性消化器型リンパ腫 / RNA-seq / 発現上昇 / 消化器型リンパ腫 / 上皮内リンパ球 / セリアック病 |
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| Outline of Research at the Start |
犬の慢性腸炎は腸粘膜へのリンパ球の浸潤を特徴とする腸の慢性炎症性疾患であり、持続的な下痢による消化吸収不良を呈する。慢性腸炎の予後は様々であるが、一部の症例では難治性となり死に至る。慢性腸炎が難治性となる背景の一つに、腸炎からリンパ腫という腫瘍性疾患への進展の可能性が挙げられる。本研究では、「腸炎から消化器型リンパ腫への進展」という仮説を立て、悪性化に関わる遺伝子発現の変化を明らかにし、新規診断マーカーの開発、治療ターゲットの創出に発展させることを目的とする。
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| Outline of Annual Research Achievements |
2023年度は、腸炎症例８例、小細胞性消化器型リンパ腫４例の腸粘膜生検組織を用いて、網羅的な遺伝子発現解析手法であるRNA-seq解析を行い、小細胞性消化器型リンパ腫で有意な発現の変化（２倍以上、または１/２以下）を認める遺伝子を抽出した。その結果、小細胞性消化器型リンパ腫で有意な発現上昇を認める遺伝子が２８遺伝子、有意な発現低下を認める遺伝子が７遺伝子抽出された。小細胞性消化器型リンパ腫で有意な発現上昇を認めた２８遺伝子のうち、リンパ球の活性化や腫瘍化と関連する遺伝子が７つ認められた。これらの７つの遺伝子の発現をリアルタイムPCRで確認（バリデーション）するため、上記のRNA-seq解析で用いた症例と異なる症例の腸粘膜生検組織からTotal RNAの抽出およびcDNAの合成を行なった。現在までに、組織学的に正常な腸粘膜７例、腸炎症例の腸粘膜１０例、小細胞性リンパ腫症例の腸粘膜９例のcDNA合成を終えており、上記７遺伝子の発現をバリデーションする準備ができている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
2023年度は、RNA-seq解析を行いて腸炎と消化器型リンパ腫で発現が異なる遺伝子を抽出することを計画しており、その目標はおおむね達成された。また2023年度から2024年度にかけてリアルタイムPCRで遺伝子発現を確認（バリデーション）する計画であったが、既に解析するサンプルの調整は終えており、２０２４年６月までに解析が終了する予定である。
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| Strategy for Future Research Activity |
2023年度にRNA-seq解析で抽出され、リアルタイムPCRで遺伝子発現の上昇が確認（バリデーション）された遺伝子のうち、特にリンパ球の腫瘍化に関連することが予想される遺伝子を選定してin situ hybridizationによる局在解析・発現解析を行う。
また、大細胞性消化器型リンパ腫症例のRNA-seq解析を追加する予定である。
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