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酸化ストレスに対するミトコンドリア翻訳停滞解消システムの役割

Research Project

Project/Area Number 23K05677
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 43030:Functional biochemistry-related
Research InstitutionGunma University

Principal Investigator

行木 信一  群馬大学, 大学院理工学府, 准教授 (80302959)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 柴田 淳史  慶應義塾大学, 薬学部(芝共立), 教授 (30707633)
Project Period (FY) 2023-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords翻訳停滞解消因子 / リボソーム / 活性酸素種
Outline of Research at the Start

翻訳停滞とは,翻訳中にリボソームがmRNA上で停滞して蛋白質合成が滞る状態を指す。ミトコンドリアの翻訳系には,2種類の翻訳停滞解消因子「C12orf65」および「ICT1」が必ず存在するが,長らくC12orf65とICT1の機能的差異については不明であった。申請者は出芽酵母を用いた実験により,C12orf65が「リボソーム結合性抗生物質による翻訳停滞」の解消に必須であることを明らかにした。本研究では,ミトコンドリアにとって内在的リスク因子である酸化ストレスに着目し,酸化ストレスに対するミトコンドリア翻訳停滞解消システムの役割の解明を行う。

Outline of Annual Research Achievements

「翻訳停滞」とは,翻訳中にリボソームがmRNA上で停滞して蛋白質合成が滞る状態を指す。ミトコンドリアの翻訳系には,2種類の翻訳停滞解消因子「C12orf65」および「ICT1」が必ず存在するが,長らくC12orf65とICT1の機能的差異については不明であった。我々は出芽酵母を用いた実験により,C12orf65が「リボソーム結合性抗生物質による翻訳停滞」の解消に必須であることを明らかにした。一方,予備的実験で,特定の欠損株が酸化ストレスに著しく感受性が高いことを発見した。
本研究の目的は,酵母において,酸化ストレス下で生じるミトコンドリアの翻訳停滞状態を具体的に明らかにし,さらに,酸化ストレス下で翻訳停滞解消が不全な場合,ミトコンドリアおよび細胞にどのような応答が生じるかを調べることで,酸化ストレスに対するミトコンドリア翻訳停滞解消システムの役割を解明することである。
初年度に分担者の所属が変更となり,それに伴う研究室の引っ越しのため,リボソームプロファイリング関連の実験に遅延が現在も生じている。初年度はミトコンドリア特性に対するフローサイトメトリー解析を中心に行った。この初年度の結果によって,現在の過酸化水素による酸化ストレスでは,予想以上に死菌が生じていることが判明した。本年度は,死菌はできるだけ生じず,欠損株の増殖能が有意に低下する過酸化水素濃度の決定,および,蛍光観察によるミトコンドリアの形態観察を行った。その結果,過酸化水素の濃度を,昨年度使用した濃度の約1/10程度にすると適切であることがわかった。また,このストレス条件下において,欠損株由来のミトコンドリアの形態が棒状になる傾向があることが示された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

初年度に,分担者の所属が変更になり,それに伴う研究室の引っ越しのため,リボソームプロファイリング関連の実験に遅延が現在も生じている。現在,YPD培養条件下の酵母からのミトコンドリアタンパク質の調製条件の検討を行っている。フローサイトメトリー解析およびミトコンドリアの形状観察は順調である。

Strategy for Future Research Activity

今年度は,YPD培養条件下の酵母からのミトコンドリアタンパク質の調製条件の検討を精密に行う。また,リボソームプロファイリングの実験と平行して,SWATH法によるプロテオーム解析を試みる。

Report

(2 results)
  • 2024 Research-status Report
  • 2023 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2024 2023

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Stalled ribosome rescue factors exert different roles depending on types of antibiotics in Escherichia coli2024

    • Author(s)
      Mikami Mayu、Shimizu Hidehiko、Iwama Norika、Yajima Mihono、Kuwasako Kanako、Ogura Yoshitoshi、Himeno Hyouta、Kurita Daisuke、Nameki Nobukazu
    • Journal Title

      npj Antimicrobials and Resistance

      Volume: 2 Issue: 1 Pages: 22-22

    • DOI

      10.1038/s44259-024-00039-2

    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structural insights into recognition of SL4, the UUCG stem-loop, of human U1 snRNA by the ubiquitin-like domain, including the C-terminal tail in the SF3A1 subunit of U2 snRNP2023

    • Author(s)
      Nameki Nobukazu、Terawaki Shin-ichi、Takizawa Masayuki、Kitamura Madoka、Muto Yutaka、Kuwasako Kanako
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 174 Issue: 2 Pages: 203-216

    • DOI

      10.1093/jb/mvad033

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 酵母ミトコンドリアにおける翻訳停滞解消因子の酸化ストレス下における機能解析2024

    • Author(s)
      岡本和,酒井舜,建部智樹,星野総一郎,高稲正勝,行木信一
    • Organizer
      令和6年度 日本化学会関東支部群馬地区研究交流発表会
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Presentation] 翻訳停滞解消因子ArfAは,静菌性抗生物質による翻訳停滞を特異的に解消する2024

    • Author(s)
      清水秀彦,三上真優,岩間紀香,矢島美帆乃,桑迫香奈子,小椋義俊,姫野俵太,栗田大輔,行木信一
    • Organizer
      第97回日本生化学会大会
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Presentation] X-ray crystallography of the ubiquitin-like domain in the SF3A1 subunit of human U2 snRNP complexed with SL4, the UUCG stem-loop, of U1 snRNA2023

    • Author(s)
      Terawaki S, Nameki N, Takizawa M, Kitamura M, Muto Y, Kuwasako K.
    • Organizer
      The 21st Protein Island Matsuyama International Symposium
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ヒトU2 snRNPの構成因子SF3A1のN末端側に存在するSURPドメインとスプライシング因子SF1との相互作用メカニズムの解明2023

    • Author(s)
      行木信一、瀧澤将行、鈴木章元、谷昌子、小林直宏、坂本泰一、武藤裕、桑迫香奈子
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2023 Research-status Report

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Published: 2023-04-13   Modified: 2025-12-26  

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