メタゲノム解析による人体の全消化管細菌叢の同定と臨床応用へのアプローチ

• Project/Area Number: 23K05737
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 43060:System genome science-related
• Research Institution: Tohoku University
• Principal Investigator: 石沢 興太 東北大学, 大学病院, 講師 (60400313)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 菅野 武 自治医科大学, 医学部, 教授 (30757886) ; 青木 裕一 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 講師 (40747599) ; 高山 真 東北大学, 大学病院, 准教授 (80579954)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2023)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2027: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000); Fiscal Year 2026: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000); Fiscal Year 2025: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000); Fiscal Year 2024: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
• Keywords: メタゲノム / 全消化管 / 腸内細菌

Outline of Research at the Start

生物DNAを調べる次世代シーケンサー（NGS：Next Generation Sequencer）のコストが低下し、簡便かつ迅速に生物のゲノム情報を解析できるようなった。本研究は、NGSを用いて日本人の全消化管の微生物叢（マイクロバイオータ）をメタゲノム解析し、その種類や数の分布を消化器官ごとに明らかにする。さらに患者のマイクロバイオームを解析し、全消化管のそれぞれの菌叢がどのように発症に寄与するかを解析し、日本人の全消化管の細菌叢データ基盤を構築することで人体に共生菌叢の角度からさまざまな病気の病勢予測、評価を行う。