| Project/Area Number |
23K06144
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 47030:Pharmaceutical hygiene and biochemistry-related
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| Research Institution | National Institute of Health Sciences |
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Principal Investigator |
吉場 聡子 国立医薬品食品衛生研究所, 生化学部, 主任研究官 (70642213)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
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| Keywords | Cas9 / タンパク質分解 / 遺伝リスク / ゲノム編集 / 構造変異 |
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| Outline of Research at the Start |
ゲノム編集における遺伝リスクには、意図しない領域における小さな欠失や挿入、置換に加えて、ゲノムの構造変異や遺伝子のコピー数の増減など、染色体の再構成レベルの大きな変化があることが知られている。細胞内でCas9が長時間持続的に作用することによって、その遺伝リスクが高まる可能性が指摘されているが、特にゲノムの構造変化については詳細な検証はされていない。本研究では、細胞内Cas9のON/OFFを制御可能な独自システムを用いて、CRISPR/Cas9の長期曝露による影響についてその遺伝リスクを明らかにし、さらにCas9の作用時間及び時期の最適化を行うことでリスクの低いゲノム編集を目指す。
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| Outline of Annual Research Achievements |
ゲノム編集における遺伝リスクには、意図しない領域における小さな欠失や挿入、置換に加えて、ゲノムの構造変異や遺伝子のコピー数の増減など、染色体の再構成レベルの大きな変化があることが知られている。特に、細胞内でCas9が長時間持続的に作用することによって、その遺伝リスクが高まる可能性が指摘されている。本研究では、CRISPR/Cas9を用いたゲノム編集において、Cas9の長期曝露及び特定の細胞周期における曝露が及ぼす影響について、Cas9の作用により誘起されうる意図しない変異のうち、構造変異やコピー数変化などゲノムの大きな変化について検証を行い、その遺伝リスクを明らかにすることを目的としている。初年度は、正常な二倍体を持つRPE-1細胞において、細胞内でCas9を自在に誘導・分解が可能な独自システムを作成した。具体的には、Tet-onによるCas9の発現誘導とauxin-degronによる可逆的タンパク質分解を利用して、細胞内Cas9のonとoffを自在に制御できる細胞を作出し、この細胞を用いてターゲットの遺伝子配列を編集できることを確認した。次年度はこの細胞を用いて、Cas9の作用時間の検討とシステムの最適化を行う。また同時に、Cas9のターゲット箇所において大きな欠損が起こった細胞を抽出可能な系についても作成を進める予定である。Cas9の作用時期を厳密にコントロールすることで、変異の頻度や種類について詳細な検証を行う。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
初年度は、細胞の作成と検証を計画していたが、予定通りに研究を進めることができた。
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| Strategy for Future Research Activity |
次年度は、初年度に作成した細胞内Cas9のonとoffを自在に制御できる細胞を用いて、Cas9の作用時間の検討とシステムの最適化を行う。また同時に、Cas9のターゲット箇所において50 bp以上の大きな欠損が起こるとEGFPが消光するシステムを導入し、大きな変異を持つ細胞を抽出可能な系についても作成を進める予定である。
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