| Project/Area Number |
23K06782
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 50020:Tumor diagnostics and therapeutics-related
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| Research Institution | Kanagawa Cancer Center Research Institute |
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Principal Investigator |
紅露 拓 地方独立行政法人神奈川県立病院機構神奈川県立がんセンター(臨床研究所), 臨床研究所がん免疫療法研究開発学部, チームリーダー (90372424)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
辻 嘉代子 地方独立行政法人神奈川県立病院機構神奈川県立がんセンター(臨床研究所), 臨床研究所がん免疫療法研究開発学部, 特別研究員 (60584232)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
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| Keywords | TCR-T / シングルセル解析 / 腫瘍浸潤リンパ球 |
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| Outline of Research at the Start |
近年がんの治療手段として免疫療法が注目されている。なかでもT細胞受容体（TCR）遺伝子導入T（TCR-T）細胞療法は最も直接的な免疫療法といえるが、治療に用いるTCRの確実で効率の良い同定方法に課題が残っている。本研究では腫瘍浸潤T細胞を直接シングルセルRNAシークエンス解析することにより、腫瘍特異的T細胞の特徴を捉え、がん殺傷作用の高いTCRを効率的に取得する方法を確立する。
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| Outline of Annual Research Achievements |
令和5年度は６症例の腎がん手術材料から腫瘍浸潤白血球（TIL）の精製、T細胞の凍結保存を行った。その内訳はStage I:１例、Stage III:４例、Stage IV:１例であった。そのうち４サンプルおよび予備検討で細胞凍結していた２サンプルについてシングルセルシークエンスを完了し、さらにそのうち２サンプルについてTCR-T２０クローンずつを作成し、該当オルガノイド培養細胞への反応性を検討した。２０クローンのうちオルガノイドへの反応を示したのはそれぞれ１１クローン、４クローンであった。シングルセルシークエンスのTCRクロノタイプ情報と遺伝子発現データを同期させることにより、オルガノイド反応性TCRを発現していたT細胞とオルガノイドに反応しないTCRを発現していたT細胞の発現遺伝子変動を解析したところ、予想外なことに両者の発現遺伝子に有意差が認められなかった。一方、Stage IのサンプルとStage III-IVのサンプルを比較するとStage III-IVのサンプル中のT細胞はTOX陽性のT細胞が有意に多く、ステージの進んだ腎がんでは疲弊T細胞が多いことが明らかとなった。TILのCD4/CD8 T細胞比についてはステージとの関連は認められなかった。
これらの６症例の腎がん手術材料からオルガノイド培養の樹立を試み、５サンプルで樹立に成功した。予備実験の４サンプルのうち３サンプルについて正常組織、がん組織、オルガノイド培養細胞のwhole exome sequenceを行い、変異遺伝子を比較したところ、がん組織で見られた遺伝子変異の多くがオルガノイド培養細胞で検出されなかった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
令和５年度には２例の腎がん試料の収集とそのオルガノイドの樹立、腫瘍浸潤リンパ球からのTCR遺伝子の単離およびTCR-T細胞の作製を予定していたが、６例の試料を入手することができ、そのうち４例のシングルセルシークエンスを完了した。TCR-Tの作成についても目標の２例について完了している。
ただ、オルガノイド反応性T細胞と不反応T細胞のあいだで遺伝子発現に差が見られなかった。その原因としてオルガノイドにおいてがん組織で見られた遺伝子変異が検出できないことから、オルガノイド不反応のTCRも腫瘍内では腫瘍抗原に反応しており、その抗原がオルガノイドで欠損している可能性が考えられる。その場合、オルガノイド樹立プロトコールの再検討、オルガノイド反応性によらないTCR機能評価方法の検討などが必要になる。
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| Strategy for Future Research Activity |
これまでに予備検討分を含め１０例の手術検体を入手しているが、Stage 1：３例、Stage III-IV：７例であるのでStage 1-IIのものを中心にサンプル収集を続ける。
未完了のシングルセルシークエンスおよびTCR-T細胞作成についても順次解析・作成を進める。
TCR-Tとオルガノイドの反応性についてはオルガノイドとがん組織の差異の大きさに注意しつつ進めるとともに、TCRのクローンサイズの大小による発現遺伝子の違いについても解析を始める。
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