| Project/Area Number |
23K07366
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 53010:Gastroenterology-related
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| Research Institution | Department of Clinical Research, National Hospital Organization Nagasaki Medical Center |
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Principal Investigator |
中村 稔 独立行政法人国立病院機構(長崎医療センター臨床研究センター), 臨床研究センター, 客員研究員 (40217906)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
植野 和子 国立研究開発法人国立国際医療研究センター, 研究所, ゲノム医科学プロジェクト戸山プロジェクト 研究員 (00794512)
人見 祐基 国立研究開発法人国立国際医療研究センター, 研究所, 疾患ゲノム研究室長 (10525819)
西田 奈央 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 准教授 (50456109)
相葉 佳洋 独立行政法人国立病院機構(長崎医療センター臨床研究センター), 臨床研究センター, 研究員 (70450955)
長崎 正朗 九州大学, 生体防御医学研究所, 教授 (90396862)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2024)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
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| Keywords | 原発性胆汁性胆管炎 / ゲノムワイド関連解析 / トランスクリプトーム / 疾患感受性遺伝子 / 統合解析 / PTPN2 / IFNG / ネガティブフィードバック機構 / 疾患関連遺伝子 / 臨床ゲノム解析 / 治療標的 |
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| Outline of Research at the Start |
本研究代表者は、2010年度から日本人原発性胆汁性胆管炎(PBC)のゲノムワイド関連解析(GWAS) の全国共同研究を開始、2017年度からはケンブリッジ大学と共同で国際メタ解析を実施し、PBCの疾患感受性遺伝子、疾患発症経路や治療標的に関する多くの情報を発信してきた。本研究では、PBC症例の肝生検組織・末梢血のトランスクリプトーム（RNAseq）と臨床データとの相関解析から、PBCの病態形成に重要な遺伝子発現を同定し、新たな病態を解明するとともに、UDCAやベザフィブラート治療に抵抗して肝不全に進行する症例の治療標的の同定を目指す。
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| Outline of Annual Research Achievements |
原発性胆汁性胆管炎（PBC）の新たな病態解明と治療標的の同定を目的として、PBC症例のゲノムワイド関連解析(GWAS)、肝生検組織や末梢血のトランスクリプトーム解析、GWASとトランスクリプトームとの統合解析などを継続している。
今年度は、PBC症例の臨床情報とGWASやトランスクリプトームとの相関解析から、病態（胆管障害、肝細胞障害、免疫活動性、線維化、など）に特徴的な遺伝子変動を見出した。
これらのPBCで変動している遺伝子セットを用いて、pathway解析、上流・下流解析、肝生検組織の免疫染色、培養胆管細胞を用いたin vitroでの発現解析を行っている。その成果の一部はHepatology 2024, 80:776-790に発表した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
日本人PBC-GWAS解析症例数は計2,303症例, 健常人コントロール 5,692例、PBC-肝生検RNAseq解析140検体, PBC-末梢血RNAseq 解析145検体、さらにはPBC-末梢血DNA 全ゲノムシークエンス320症例が終了し、解析はほぼ順調に経過している。
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| Strategy for Future Research Activity |
さらに多数の検体を収集、解析を行い、臨床情報と遺伝子解析情報の揃った我が国で最大規模のPBCデータベースを構築する。
このデータベースを用いて、新たな病態ネットワークの解明方法を開発する。
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