| Project/Area Number |
23K07609
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 53030:Respiratory medicine-related
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| Research Institution | Kitasato University |
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Principal Investigator |
佐藤 崇 北里大学, 医学部, 講師 (20464836)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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| Keywords | エピゲノム / 肺がん / 分化プログラム / 肺神経内分泌がん / 多形がん / 細胞系統因子 / 不均一性 / 肺大細胞神経内分泌がん |
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| Outline of Research at the Start |
近年のがん治療の進歩にも関わらず、肺がんは依然本邦のがん死因第一位となっている。肺がんに対する新たな治療戦略開発の礎となる本質的な肺がんの特性理解が求められている。これまでの研究により、がんの発生する臓器に特徴的なDNA結合因子ががん細胞の状態を制御し、そのがんの振る舞いの根底にあることが示唆されている。研究代表者らは、この観点からエピゲノム解析を用いて肺がんの新規サブタイプを同定してきた。本研究では、保存されたヒト各種肺がん検体を用いてエピゲノムを中心とした多層網羅的な解析を行い、候補マスター制御因子の機能を解析する。各種肺がんにおける弱点を標的とした治療アプローチを開発することを目指す。
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| Outline of Annual Research Achievements |
研究代表者らは、神経内分泌要素を有する肺大細胞神経内分泌がん（LCNEC）症例を中心とした肺がんホルマリン固定パラフィン包埋組織検体のH3K27ac クロマチン免疫沈降シークエンシング（ChIP-seq）解析を行った。ChIP-seqシグナルを用いたクラスタリング解析を行い、一つのサブタイプとして神経内分泌細胞系統因子であるASCL1とNKX2-1を中心に規定されるより神経内分泌の特徴をもっているサブタイプを同定し、一方で肺神経内分泌がんにおけるがん細胞の分化状態を規定する候補転写制御因子Xを同定し、CRISPR/Cas9システムによるノックアウトおよび過剰発現系等の機能解析を行っている。Xは神経発生等に関与する遺伝子発現を制御し、肺がん細胞の形質に寄与していることを見出している。
また、肺多形がんのホルマリン固定パラフィン包埋組織検体のH3K27ac ChIP-seqを行った。次世代シークエンス解析を進めている。
さらに、肺がん細胞株を用いてEGFRチロシンキナーゼ阻害薬やKRAS阻害薬に対する耐性株を作成し、これらの耐性機序の解明を行った。Phospho-RTKアレイやH3K27ac ChIP-seqを用いていくつかの候補となる耐性メカニズムを検討中である。一つには候補転写制御因子Yの薬剤耐性への関与をCRISPR/Cas9システムによるノックアウトおよび過剰発現系を用いたin vitro実験において検証中である。悪性度を規定する病理組織像を反映した細胞株モデルでのエピゲノム状態の解析も進めている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
次世代シークエンス解析・候補転写制御因子の機能解析に時間を要している。実験系でtrouble shootingを要することがあるが、都度解決して研究を進めている。
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| Strategy for Future Research Activity |
肺神経内分泌がんにおけるがん細胞の分化状態を規定する細胞系統因子Xの機能解析を進める。in vitroの実験系ではCRISPR/Cas9システムによるノックアウトおよび過剰発現系、薬剤投与を用いたフェノタイプの検討を行い、さらにin vivo xenograftモデルによる検討を行う。また多形がんのH3K27ac ChIP-seq解析をもとに、多形がん細胞の分化状態の多様性・可塑性を調べていく。肺がん細胞株モデルにおいては、分子標的薬耐性機序、悪性形質へのエピゲノム状態の寄与を引き続き検討する。
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