| Project/Area Number |
23K07665
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 53030:Respiratory medicine-related
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| Research Institution | National Institute of Infectious Diseases |
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Principal Investigator |
星野 仁彦 国立感染症研究所, ハンセン病研究センター 感染制御部, 室長 (20569694)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
深野 華子 国立感染症研究所, ハンセン病研究センター 感染制御部, 主任研究官 (40807541)
吉田 光範 国立感染症研究所, ハンセン病研究センター 感染制御部, 主任研究官 (70772630)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
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| Keywords | 質量分析 |
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| Outline of Research at the Start |
我々は核酸クロマトグラフィー開発で使用したNGS解析済みの148臨床分離株がある。マクロライド感受性も解析しており、本邦においてMABCを代表している菌株である。ハンセン病研究センターには未解析のMABC臨床分離株が200株残されており、これらのTOF-MSデータと薬剤感受性データを追加する予定である。またM. ulceransに関しても我々は日本で唯一菌株を収集しており50株前後の臨床分離株を保有している。また当センターは継続的に菌株鑑別を行っており日本全国からMABC亜種分類あるいはM. ulcerans鑑別依頼の最新検体が供与されるので、それらも医療機関の了承を取って使用する予定である
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| Outline of Annual Research Achievements |
我々はM.abscessus3種類の亜種識別とerm(41)遺伝子の鑑別が可能な、簡便で迅速なDNAクロマトグラフィーキットの開発に成功した(KANEKA DNA Chromatography MABC/erm(41)。本キットは非常に近い将来薬事申請が承認され、健康保険適用「体外診断用医薬品」として販売される予定である。本DNAクロマトグラフィーキットの開発が大きな成功を収めたとしても、MALDI-TOF-MS法は正確で費用対効果が高く迅速な方法であり、世界中のラボで最初の識別ステップとして広く適用されているため、TOF-MS法でM.abscessusの亜種を区別できることが望ましい。残念ながら、タンパク質を用いた現在のTOF-MS法では、これらの亜種間の異なる評価の精度については相変わらず検討中である。ブルカ第3世代機MALDI Biotyper Siriusは、リン脂質、糖脂質をマイナスイオンモードで検出することができる。抗酸菌細胞壁は脂質が豊富であるため、脂質構造の多様性によって種固有fingerprintを確立できれば、正確な微生物同定の代替アプローチとなり得る。我々は148株の臨床分離株を、全ゲノム配列(WGS)データを用いて調製して、Bruker Bio-Typer Siriusによって脂質フィンガープリント法を用いた。23 個の分離株をテスト (モデル) セットに使用し、125 個をトレーニング セットに使用した。ネガティブイオンモードでマススペクトルを取得し、ブルカーが提供するClinProTools 3.0で分析した。今年度はM.abscessusとM.ulceransの２菌種の鑑別に関して論文の作成をほぼ終了した
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
M.abscessusとM.ulceransの２菌種の鑑別に関する論文をほぼ作成終了したため
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| Strategy for Future Research Activity |
M.abscessusとM.ulceransの２菌種の鑑別に関する論文を投稿し、印刷する
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