| Project/Area Number |
23K07884
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 54020:Connective tissue disease and allergy-related
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| Research Institution | Nippon Medical School |
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Principal Investigator |
桑名 正隆 日本医科大学, 大学院医学研究科, 大学院教授 (50245479)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥390,000 (Direct Cost: ¥300,000、Indirect Cost: ¥90,000)
Fiscal Year 2024: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
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| Keywords | 全身性強皮症 / トランスクリプトーム / 皮膚 |
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| Outline of Research at the Start |
全身性強皮症（SSc）は多彩な臓器に非可逆的な線維化をきたし、生命・機能予後不良な難治性疾患である。最近実施された分子標的薬の治験では、全ての患者に有効な治療薬は存在せず、その理由として病態、治療反応性の多様性が考えられている。そこで、本研究では皮膚トランスクリプトームを用いて個々のSSc患者の多様な病態を可視化し、『SSc病態モデル』を簡便かつ安価に入手可能な臨床情報と血漿蛋白により開発する。複数の大規模SSc患者レジストリや治験データを用いてモデルの治療反応性や予後予測における有用性を検証し、将来的な個別化医療の基盤とする。
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、「全身性強皮症（SSc）皮膚病態パネル」の構築のため、4つのステージを設定し、3年計画で段階的に研究を進めている。ステージ1では、公開トランスクリプトームを用いた「SSc皮膚病態パネル」の構築を目標としており、SSc患者、健常者皮膚の公開トランスクリプトームデータセットを用いて、両群間での発現差differentially Expressed Gene(DEG)解析、ssGSEAを用いたパスウェイ解析を行い、さらにMicroenvironment Cell Populations-counterを用いて組織に浸潤する免疫細胞の存在量を推定するパネルの作成を進めている。さらに、パネルにはSSc皮膚におけるMolecular subset [PLoS One. 2008; 3 :e2696.] による層別化も組み合わせ、個々の患者における分子標的薬の標的となるパスウェイの活性化状態をより可視できるようにした。
ステージ2では、皮膚トランスクリプトームによる「SSc皮膚病態パネル」の検証を目標とし、SSc患者の皮膚生検、末梢血検体に加え臨床情報を前向きに収集し、目標35例のうち33例を収集した。対象群として、整形外科での前腕部手術時の残余皮膚検体を健常検体として採取することを追加し、目標5例のうち3例の収集が完了している。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
1年目では、ステージ１の公開トランスクリプトームを用いた「SSc皮膚病態パネル」の構築を進め、SSc皮膚におけるMolecular subset [PLoS One. 2008; 3 :e2696.] による層別化を追加で組み合わせてパネルの構築を進めているが、公開データでの検証には至っていない。さらに、ステージ2の皮膚トランスクリプトームによる「SSc皮膚病態パネル」の検証については、対象群として整形外科での前腕部手術時の残余皮膚検体を健常検体として採取することを追加したことが変更点ではあるが、皮膚生検検体はSScおよび健常検体ともに、予定通りの採取ができている。
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| Strategy for Future Research Activity |
ステージ１での「SSc皮膚病態パネル」の検証については、公開データでは未治療例が少なく、臨床データが不十分であることも多く、公開データは可能な範囲でderivationとして使用し、今後入手予定の臨床試験で得られた皮膚トランスクリプトームデータを用いたvalidationを行う予定とする。ステージ2では、SSc皮膚検体および健常検体の目標症例数を達成でき次第、RNAseqによる解析を行い、皮膚トランスクリプトームによる「SSc皮膚病態パネル」の検証を行う。ステージ3では、トランスクリプトーム解析に用いた皮膚と同時に採集した血漿を用いてプロテオーム解析を行う（Olink® Target 48 Cytokine Panels使用を予定）予定としている。また、最終年度にはステージ4としてSScデータベースを用いたSSc病態パネルの治療反応性・予後予測における有用性を検証する。
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