| Project/Area Number |
23K08136
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 55020:Digestive surgery-related
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| Research Institution | Fukushima Medical University |
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Principal Investigator |
山田 玲央 福島県立医科大学, 医学部, 博士研究員 (80815100)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
岡山 洋和 福島県立医科大学, 医学部, 講師 (20583397)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2025: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2024: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Fiscal Year 2023: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000)
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| Keywords | 大腸癌 / 糖鎖 / シングルセル |
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| Outline of Research at the Start |
本研究は、シングルセル解析により数十万個の上皮系・間質系・免疫系シングルセルに対して個々に遺伝子プロファイルを解析し、新規の大腸癌サブグループを規定する糖鎖酵素遺伝子候補を抽出する。複数のシングルセルデータ集積と数千サンプル規模のバルクマルチオミクスによるバリデーションを経て、種々の解析プラットフォームおよびin vitroの実験系を駆使し、候補となる糖鎖遺伝子とその制御を受ける糖鎖分子について分子遺伝学的メカニズムの解明、免疫抑制的微小環境との関連づけ、究極的には臨床応用（バイオマーカー、標的治療）への展開を目指す。
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、シングルセル解析により数十万個の上皮系・間質系・免疫系シングルセルに対して個々に遺伝子プロファイルを解析し、新規の大腸癌サブグループを規定する糖鎖酵素遺伝子候補を抽出する。複数のシングルセルデータ集積と数千サンプル規模のバルクマルチオミクスによるバリデーションを経て、種々の解析プラットフォームおよびin vitroの実験系を駆使し、候補となる糖鎖遺伝子とその制御を受ける糖鎖分子について分子遺伝学的メカニズムの解明、免疫抑制的微小環境との関連づけ、究極的には臨床応用（バイオマーカー、標的治療）への展開を目指すものである。現在はデータ解析を主体としており、今後の各種実験の準備段階である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
データ解析が膨大かつ複雑であること、などが研究のlimitationとなっており予備的検討段階にある。
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| Strategy for Future Research Activity |
いくつかの糖鎖関連候補遺伝子について既存の報告を見直し、また公的データ解析、予備実験を行う。臨床検体を用いて免疫染色を行う。
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