遺伝子プロファイルとctDNAに基づくサブタイプ別膵癌精密医療実装のための探索的研究
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23K08158
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 55020:Digestive surgery-related
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| Research Institution | Sapporo Medical University |
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Principal Investigator |
木村 康利 札幌医科大学, 医学部, 准教授 (80311893)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
今村 将史 札幌医科大学, 医学部, 講師 (00404608)
竹政 伊知朗 札幌医科大学, 医学部, 教授 (50379252)
村上 武志 札幌医科大学, 医学部, 研究員 (50619830)
久木田 和晴 札幌医科大学, 医学部, 助教 (60563484)
及能 大輔 札幌医科大学, 医学部, 助教 (70563485)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
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| Keywords | 膵癌 / サブタイプ / RNA sequence / ctDNA / 包括的遺伝子プロファイリング / 遺伝子プロファイリング / 精密医療 |
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| Outline of Research at the Start |
高い浸潤・転移能を有し極めて不良な予後を呈する膵癌克服への課題は、早期発見困難、大多数を占める診断時進行症例に対する治療介入の限界、高率な根治術後再発である。本研究は、包括的遺伝子プロファイリングにより膵癌亜型毎の薬物療法を最適化し、治療介入後の微小残存病変をctDNAにより監視し、新規の分子標的治療法のバイオマーカーを確立するなど、膵癌精密医療を加速する一助となる。
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| Outline of Annual Research Achievements |
先行研究 (膵癌特異的ゲノム変異のliquid biopsyによる超早期術後再発診断法の開発; 基盤研究(C)/19K09179)では、患者血液のリキドバイオプシーによる網羅的ctDNA監視の妥当性を検証し(Watanabe K, Kimura Y, et al. Int J Mol Sci. 2022, Watanabe K, Kimura Y, 投稿準備中)、膵癌根治術後転移再発の超早期診断に関する知見を集積した。本研究では、上記コホートを引き継ぎ、1) 診断時生検・切除検体の包括的遺伝子プロファイリングによる膵癌亜型が一次薬物療法選択に資するコンパニオン診断となり得るか？ 2) 治療介入後のctDNAはMRDを反映し、分子標的治療法選択のガイド、となり得るかを検証する。
1)19K09179コホート(2019/05~2021/09, 膵癌204例)における臨床情報と遺伝子・ctDNAプロファイリングの突合; 本コホートには、切除・非切除症例が含まれており、非切除症例における診断時生検材料に対するctDNAプロファイル結果の整理、薬物療法種別、治療奏効、根治術後再発、転帰等の臨床情報を固定した。
2)既存コホート(19K09179)の組織遺伝子プロファイルによる膵癌亜型と代替分子マーカー(古典型; GATA6/基底型; CK5, 17)の一致率の検証；上記1)での報告通り、RNA sequencingのサンプル数と予算を含めた条件検討中である。一方、GATA6免疫染色については、パイロットサンプルに対して実施し、良好な結果を得た。
3)新規膵癌症例の前向き観察研究コホート；先行の19K09179コホートに加え、ctDNA、MRD、RNA sequencingによる膵癌亜型と膵癌再発・増悪等のイベントを登録すべく、臨床研究の立案中である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
上記で述べたとおり、概ね計画通りの進捗である。RNA sequenceのコストが高額なことから、サンプルサイズの調整にやや時間を要しておる。しかし、これもパイロットサンプルを選定し実施調整済みである。
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| Strategy for Future Research Activity |
19K09179コホートの組織遺伝子プロファイルによる膵癌亜型と代替分子マーカー(古典型; GATA6/基底型; CK5, 17)の一致率の検証；RNA sequencingのサンプル数と予算を含め、実施に向かう。GATA6免疫染色については、パイロットサンプルでの条件にて予定症例の染色と解析を行う。
新規膵癌症例の前向き観察研究コホート；先行の19K09179コホートに加え、ctDNA、MRD、RNA sequencingによる膵癌亜型と膵癌再発・増悪等のイベントを登録すべく、臨床研究を策定、IRB等の事務手続きを完了する。
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Report
(1 results)
Research Products
(9 results)
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[Journal Article] Standard versus delayed initiation of S-1 adjuvant chemotherapy after surgery for pancreatic cancer: a secondary analysis of a nationwide cohort by the Japan Pancreas Society2023
Author(s)
Tomimaru Y, Eguchi H, Shimomura Y, Kitamura T, Inoue Y, Nagakawa Y, Ohba A, Onoe S, Unno M, Hashimoto D, Kawakatsu S, Hayashi T, Higuchi R, Kitagawa H, Uemura K, Kimura Y, Satoi S, Takeyama Y; Committee of Clinical Research, Japan Pancreas Society.
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Journal Title
J Gastroenterol
Volume: 58
Issue: 8
Pages: 790-799
DOI
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Peer Reviewed / Open Access
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