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Comprehensive molecular diagnosis of glioma by liquid biopsy

Research Project

Project/Area Number 23K08545
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 56010:Neurosurgery-related
Research InstitutionOita University

Principal Investigator

秦 暢宏  大分大学, 医学部, 准教授 (10596034)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 札場 博貴  大分大学, 医学部, 助教 (00772930)
三月田 祐平  九州大学, 医学研究院, 助教 (00848640)
藤岡 寛  九州大学, 医学研究院, 助教 (10914252)
籾井 泰朋  大分大学, 医学部, 助教 (20534192)
空閑 太亮  九州大学, 大学病院, 助教 (40759932)
溝口 昌弘  九州大学, 医学研究院, 共同研究員 (50380621)
Project Period (FY) 2023-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywordsliquid biopsy / glioma / molecular diagnosis / WHO2021 / digital PCR / CSF / IDH / MLPA
Outline of Research at the Start

神経膠腫は、他の癌腫のような腫瘍マーカーが存在しないため、早期診断や病勢の把握が困難である。我々は近年開発された高感度の遺伝子解析法:digital PCRシステムを導入することで、髄液中のごく微量に存在する腫瘍由来の核酸を用いた分子診断:liquid biopsyに成功した。本課題はさらにliquid biopsyを展開し、①最新のWHO2021に対応した網羅的分子診断の確立、②腫瘍免疫微小環境解析による新規治療ターゲット同定を目指す。

Outline of Annual Research Achievements

前任施設で先進医療として取り組んできた神経膠腫の分子診断プラットフォームを"In‐house molecular diagnosis of diffuse glioma updating the revised WHO classification by a platform of the advanced medical care system, Senshin‐Iryo"としてまとめ、Neuropathology誌に掲載された。この内容と同等の分子診断を当施設でも簡易的に導入するために研究室の整備を進めた。その結果、HRM法、MLPA法を研究室のルーティンワークとして新規に稼働し、簡便な分子診断を臨床導入することに成功した。この実績を日本脳腫瘍学会のシンポジウム(Neurooncol Adv. 2024 Nov 29;6(Suppl 4):iv13-14)で発表した。現在、この成果の論文化を進めている。
liquid biopsyに対しては、大分大学グローカル感染症研究センターに新設された最新のdigital PCRマシンを稼働することで、IDH,TERT,BRAFなどのグリオーマの分子マーカーに加えて、頭蓋内悪性リンパ腫の分子マーカーであるMYD88の変異を微量な核酸から検出することに成功した。現在、臨床検体を用いた解析へ移行すべく条件設定を行っている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

研究実施計画を3段階に分類していたが、そのうち①は計画通りに達成して論文発表まで終えている。②メチル化解析に関しては、MLPA法の新規プローブを活用することにより、腫瘍組織ではMLPAによるメチル化解析を行うことができるようになっており、今後はnanoporeシークエンサーを新規に導入してより精緻な解析を確立する方針である。③腫瘍免疫微小環境の解析についても、九州大学精神科との共同研究を継続している。

Strategy for Future Research Activity

髄液を用いたメチル化解析は、MLPA法でのメチル化解析を前年度より継続しており、今後はnanoporeシークエンサーを用いた解析に発展していく方針である。免疫微小環境の解析は、研究分担者の札場が米国留学から帰国し、研究室整備を進めており、こちらの成果が期待できる。大分大学グローカル感染症センターを活用した研究体制も構築が進んでおり、single cell解析などのさらに先進的な解析へと昇華することも視野に入れている。

Report

(2 results)
  • 2024 Research-status Report
  • 2023 Research-status Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2024 2023

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 6 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Hemizygous deletion of cyclin-dependent kinase inhibitor 2A/B with p16 immuno-negative and methylthioadenosine phosphorylase retention predicts poor prognosis in IDH-mutant adult glioma2024

    • Author(s)
      Otsuji R, Hata N, Yamamoto H, Kuga D, Hatae R, Sangatsuda Y, Fujioka Y, Noguchi N, Sako A, Togao O, Yoshitake T, Nakamizo A, Mizoguchi M, Yoshimoto K.
    • Journal Title

      Neurooncol Adv

      Volume: 6 Issue: 1

    • DOI

      10.1093/noajnl/vdae069

    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] In‐house molecular diagnosis of diffuse glioma updating the revised <scp>WHO</scp> classification by a platform of the advanced medical care system, <scp>Senshin‐Iryo</scp>2024

    • Author(s)
      Hata Nobuhiro、Fujioka Yutaka、Otsuji Ryosuke、Kuga Daisuke、Hatae Ryusuke、Sangatsuda Yuhei、Amemiya Takeo、Noguchi Naoki、Sako Aki、Fujiki Minoru、Mizoguchi Masahiro、Yoshimoto Koji
    • Journal Title

      Neuropathology

      Volume: - Issue: 5 Pages: 344-350

    • DOI

      10.1111/neup.12970

    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 10019- MPC-4 IN-HOUSE MOLECULAR DIAGNOSIS FOR THE ERA OF MOLECULAR STRATIFIED THERAPY OF GLIOMAS2024

    • Author(s)
      Hata Nobuhiro、Fudaba Hirotaka、Momii Yasutomo、Anan Mitsuhiro、Fujiki Minoru
    • Journal Title

      Neuro-Oncology Advances

      Volume: 6 Issue: Supplement_4 Pages: iv13-iv14

    • DOI

      10.1093/noajnl/vdae173.052

    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Journal Article] Liquid Biopsy for Glioma Using Cell-Free DNA in Cerebrospinal Fluid2024

    • Author(s)
      Otsuji Ryosuke、Fujioka Yutaka、Hata Nobuhiro、Kuga Daisuke、Hatae Ryusuke、Sangatsuda Yuhei、Nakamizo Akira、Mizoguchi Masahiro、Yoshimoto Koji
    • Journal Title

      Cancers

      Volume: 16 Issue: 5 Pages: 1009-1009

    • DOI

      10.3390/cancers16051009

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Supramaximal Resection Can Prolong the Survival of Patients with Cortical Glioblastoma: A Volumetric Study2023

    • Author(s)
      OTSUJI Ryosuke、HATA Nobuhiro、FUNAKOSHI Yusuke、KUGA Daisuke、TOGAO Osamu、HATAE Ryusuke、SANGATSUDA Yuhei、FUJIOKA Yutaka、TAKIGAWA Kosuke、SAKO Aki、KIKUCHI Kazufumi、YOSHITAKE Tadamasa、YAMAMOTO Hidetaka、MIZOGUCHI Masahiro、YOSHIMOTO Koji
    • Journal Title

      Neurologia medico-chirurgica

      Volume: 63 Issue: 8 Pages: 364-374

    • DOI

      10.2176/jns-nmc.2022-0351

    • ISSN
      0470-8105, 1349-8029
    • Year and Date
      2023-08-15
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Angiogenic and inflammatory responses in human induced microglia-like (iMG) cells from patients with Moyamoya disease2023

    • Author(s)
      Shirozu Noritoshi, et al.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 13 Issue: 1 Pages: 14842-14842

    • DOI

      10.1038/s41598-023-41456-z

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] O6‐methylguanine methyltransferase promoter methylation status of glioblastoma cell line clonal population2023

    • Author(s)
      Anan Mitsuhiro、Del Maestro Rolando Fausto、Hata Nobuhiro、Fujiki Minoru
    • Journal Title

      Neuropathology

      Volume: 44 Issue: 1 Pages: 41-46

    • DOI

      10.1111/neup.12931

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 神経膠腫に対する分子診断技術に基づくトランスレーショナルリサーチの現状と展望2024

    • Author(s)
      秦 暢宏、札場 博貴、籾井 泰朋、阿南 光洋、尾辻 亮介、藤岡 寛、溝口 昌弘、吉本 幸司、藤木 稔
    • Organizer
      第83回日本脳神経外科学会総会
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Presentation] WHO2021に対応した施設分子診断の最適化2024

    • Author(s)
      秦 暢宏、藤岡 寛、尾辻 亮介、札場 博貴、籾井 泰朋、阿南 光洋、溝口 昌弘、吉本 幸司、藤木 稔
    • Organizer
      第42回日本脳腫瘍病理学会
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Presentation] グリオーマの分子層別化治療時代における施設内分子診断2024

    • Author(s)
      秦 暢宏、札場 博貴、籾井 泰朋、阿南 光洋、藤木 稔
    • Organizer
      第42回日本脳腫瘍学会
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Presentation] グリオーマの分子層別化治療に対応した施設内分子診断体制2024

    • Author(s)
      秦 暢宏、札場 博貴、籾井 泰朋、阿南 光洋、藤木 稔
    • Organizer
      第24回日本分子脳神経外科学会
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Presentation] Oligodendrogliomaに対する治療戦略:分子層別化による長期成績の検討2023

    • Author(s)
      秦暢宏, 尾辻亮介, 空閑太亮, 三月田祐平, 藤岡寛, 溝口昌弘, 吉本幸司
    • Organizer
      第28回日本脳腫瘍の外科学会 2023年9月30日
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 先進医療制度によるWHO新分類に対応した diffuse gliomaの in-house分子診断2023

    • Author(s)
      秦 暢宏, 藤岡 寛, 佐古 亜紀, 空閑 太亮, 三月田 祐平, 尾辻 亮介, 野口 直樹, 溝口 昌弘, 藤木 稔, 吉本 幸司
    • Organizer
      第82回日本脳神経外科学会 2023年10月25日
    • Related Report
      2023 Research-status Report

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Published: 2023-04-13   Modified: 2025-12-26  

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