| Project/Area Number |
23K08902
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 56040:Obstetrics and gynecology-related
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| Research Institution | National Institute of Infectious Diseases |
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Principal Investigator |
柊元 巌 国立感染症研究所, 病原体ゲノム解析研究センター, 室長 (70291127)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2024)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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| Keywords | HPV / 子宮頸癌 / E2 / バリアント / 分子系統解析 / 子宮頸がん |
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| Outline of Research at the Start |
子宮頸癌の原因ウイルスであるヒトパピローマウイルス（HPV）には、全長ウイルスゲノム配列で10%以下の違いを示す多数のバリアントが存在する。これまでに我々は、日本人にのみ感染している特徴的なHPVバリアントを報告してきた。本研究は、日本人に特異的なHPVゲノム配列が、日本人集団内で維持されてきた生物学的基盤を明らかにし、HPVによる持続感染および発癌につながる新たな分子メカニズムを見出すことを目指している。
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| Outline of Annual Research Achievements |
HPV16のゲノム配列は系統解析によりlineage（A, B, C, D）とsublineage（A1-4, B1-4, C1-4, D1-4）に分類されている。我々は日本人女性の子宮頸部病変からHPV16の全長ゲノム配列を決定し、日本人に特異的な新たなsublineage（A5）を見出している。日本株のHPV16ゲノム配列と中国・湖南省から報告されているHPV16ゲノム配列との比較解析を行い、日本及び東アジア地域のHPV16ゲノムの分子進化機構を解明することを目的とした。
日本（n=73）及び中国・長沙（n=82）（Genomics, 2021, 113:3895-3906）からのHPV16全長ゲノム配列を用いて、最尤法による分子系統解析を行った。またBEAST2によるベイズ系統解析により、日本株と中国株の直近共通祖先の分岐年代を推定した。
系統樹解析により、日本株に特異的なクラスターがsublineage A4とA5に確認された。また長沙株に特異的なクラスター（M, N）も認められた。A5とMのクラスターは直近共通祖先を有し、その分岐年代は約83,000年前と推定された。またこれらの日本及び長沙特異的なHPV16ゲノムは、それぞれ特徴的なアミノ酸残基を持つE2タンパク質（A5/M：A105T, N：V160F, N280D）をコードしていた。
考古学的な証拠から、日本列島に最初にヒトが渡来したのは約38,000年前と推察されており、推定されたA5とMの分岐年代はそれよりも古い年代を示したことから、A5の祖先ウイルスは初期のヒト渡来時に中国南方から日本列島に移入したことが推定された。E2タンパク質はHPVゲノムの子宮頸部基底細胞での維持に必要であり、HPVの持続感染に関わる。E2遺伝子が変異することでHPV16が各民族に適応する形で進化してきたことが示唆された。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
日本及び中国に特異的なE2バリアントの機能解析に進んでいるため。
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| Strategy for Future Research Activity |
HPV16陽性の子宮頸部上皮内腫瘍の患者検体からE2遺伝子をPCR増幅し、その配列を解読する。患者のHLAタイピングの結果を照合して、日本人に特徴的なHLAハプロタイプとE2バリアントの関連を検討する。
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