| Project/Area Number |
23K08962
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 56050:Otorhinolaryngology-related
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| Research Institution | Osaka University |
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Principal Investigator |
岸川 敏博 大阪大学, 大学院医学系研究科, 助教 (20756944)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
佐々 暢亜 大阪大学, 医学部附属病院, 医員 (90882241)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2024)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥390,000 (Direct Cost: ¥300,000、Indirect Cost: ¥90,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
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| Keywords | HPV関連中咽頭癌 / HPV16関連中咽頭癌 |
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| Outline of Research at the Start |
ヒトパピローマウイルス（human papillomavirus, HPV）関連中咽頭癌では、原因となるHPVの殆どをHPV16が占める。HPV16はゲノム配列の違いよって4つの系統（lineage）と16の亜系統（sublineage）に分類される。本研究では、日本人集団のHPV16関連中咽頭癌300例を対象に大規模なHPV16全ゲノムシーケンスを行い、本邦におけるHPV16亜系統の分布を明らかにするとともに一塩基多型（SNP）を検出する。更に、HPV16の亜系統やSNPと予後との相関について解析し、新たな予後因子を確立する。
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| Outline of Annual Research Achievements |
2023年4月までに多施設で集積したHPV16関連中咽頭癌296例の腫瘍検体341検体から採取したDNAを用いてHPV16 マルチプレックスPCRを実施した。得られたHPV16ゲノムを増幅したPCR産物を用いて次世代シーケンサーによるHPV全ゲノム解析を実施した。引き続き多施設で集積したHPV16関連中咽頭癌127例127検体を用いて同様にHPV全ゲノム解析を実施した。クオリティの保たれた465検体のシークエンスデータを用いて系統解析を実施した。20例のHPV16ゲノムに関して、サンガーシーケンスを追加した。引き続き、メタデータが集積可能な約380例を用いた予後解析を実施している。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
予定より早く、目標とした300例以上のHPV16関連中咽頭癌のHPV16ゲノムDNAを集積し、解析を開始できた。解析の行程でやや難渋しているが、概ね予定通りである。
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| Strategy for Future Research Activity |
集積したシークエンスデータの解析結果に関して、2025年度中の論文投稿、学会発表を目指す。
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