| Project/Area Number |
23K09390
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 57060:Surgical dentistry-related
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| Research Institution | Chiba University |
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Principal Investigator |
齋藤 智昭 千葉大学, 大学院医学研究院, 助教 (40833554)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
伊豫田 学 千葉大学, 大学院医学研究院, 助教 (40431746)
坂本 洋右 千葉大学, 医学部附属病院, 講師 (50451745)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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| Keywords | スーパーエンハンサー / ATAC-seq解析 / Lysyl Hydroxylase 2 / Collagen highway / Collagen Barrier / Collagen cross-link / リシン水酸化酵素2 |
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| Outline of Research at the Start |
口腔癌Cetuximab (CTX) 耐性株に特異的なSE 68領域を同定し，重要な標的遺伝子の存在をin vitro・in silico解析で報告した. 上記の標的遺伝子の中には，TNF receptor associated factor 2 (TRAF2) などECMのリモデリングやLH2上流のTGF-β・HIF-1αと関連がある遺伝子が含まれていた. その上で，エピジェネティックな転写機構が及ぼす癌関連ECM (LH2-Col) のリモデリング (Collagen Barrier機構)という機序を解明し，新しい口腔癌治療戦略の探索することを目的とした.
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、癌関連ECMと仮定するLysyl Hydroxylase 2 (LH2) 関連「硬性Collagen」を誘導する抗癌剤耐性スーパーエンハンサー（SE）領域とその標的因子の検索・同定・制御を目的としている．本研究では，先行研究で同定した口腔癌Cetuximab (CTX) 耐性株における特異的なSE領域において，PLOD2（LH2の遺伝子名；chr3_146,060,265_146,170,359）が含まれるか詳細にGnome Browserを用いて解析したが，ゲノム上のCTX耐性SE領域にPLOD2は含まれていなかった．そのために，抗癌剤の作用によって変化したゲノム領域にPLOD2が関与するか探索することとした．OSCC由来口腔癌細胞株のCAL-27を用いて，CDDP投与により時系列的に変化したゲノム領域の変化（Open chromatin領域）を検索し，その領域にPLOD2が関与しているか確認するためにATAC‐seq解析を行った．さらに，モチーフ解析も行って多角的に転写因子についても解析した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
CDDP投与により時系列的に変化するオープンクロマチン領域・ヘテロクロマチン領域をそれぞれ同定し，その領域におけるPLOD2や関連遺伝子を同定している。モチーフ解析も終了している。現在，PLOD2と関連遺伝子とのネットワークを検索している。
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| Strategy for Future Research Activity |
ATAC-seq解析をもとに、LH2ｃKOマウスのDIA解析なども併用し、LH2と関連遺伝子とのネットワークを検索する。LH2関連の硬性Collagenを解除するゲノム領域を検索・同定する。
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