| Project/Area Number |
23K11061
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 60050:Software-related
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| Research Institution | National Institute of Informatics |
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Principal Investigator |
横山 重俊 国立情報学研究所, オープンサイエンス基盤研究センター, 特任研究員 (10600968)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2023: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
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| Keywords | 研究再現性 / データ駆動型研究 / ゲノム解析 / 実験数学 / クラウドコンピューティング / Jupyter Notebook |
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| Outline of Research at the Start |
本研究では、大きな再現性までを実行可能な手順書で実現する方式を提案し、その提案に沿った研究管理基盤を実装する。さらに、その基盤を使って実際の研究への適用実験を通じて、提案方式の実用性を実証することを目的とする。このことにより研究再現から派生研究実施までをよりスムーズに接続することができ、オープンサイエンス推進に大きく貢献できることを目指す。
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| Outline of Annual Research Achievements |
Literate Computing for Reproducible Research(LC4RR)の研究管理基盤への実展開の可能性について、LC4RRが実装可能で、複数の研究分野で実用可能に展開できることを検証するために以下の研究を実施する。① LC4RR実現方式の研究：大きな再現性と小さな再現性を満たし、さらにそれらを自然に接続する方式を考案する。② LC4RRを実装した研究管理基盤の開発：実証実験可能なLC4RRを実現する研究管理基盤を開発し、Research Data Cloud(RDC)と連携する。③ 開発した研究管理基盤を使った実証実験：複数研究分野（数学分野とゲノム解析分野）での実証実験を行う。2023年度はLC4RR実現方式としてJupyter Notebookによる実行可能な研究手順書を実現したリサーチフローのプロトタイプを構築し、評価した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
プロトタイピングが成功し、LC4RRに関する実現性への目処がついたため。
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| Strategy for Future Research Activity |
研究データ管理ストレージシステムとノートブック実行システムと連携するLC4RR実行システムを開発し、研究管理基盤として統合する。特に大容量な研究データを処理する際の性能確保が連携時の課題である。実証実験のために、実用的なストレージ容量や性能及び可用性を持ったものとする。
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