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Explainable Pattern Recognition of Cardiopulmonary Coupling and its Application to Personal Sleep Monitoring

Research Project

Project/Area Number 23K11305
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related
Research InstitutionNagoya City University

Principal Investigator

黄 銘  名古屋市立大学, データサイエンス学部, 准教授 (50728300)

Project Period (FY) 2023-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2024: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Keywords睡眠構造 / 心肺カップリング / 機械学習 / パターン認識 / 睡眠
Outline of Research at the Start

本研究は、脳波信号を不要として心肺の信号だけで、睡眠過程を描く新たな軸を創出するために、心電図・光電脈拍からの心拍時系列と呼吸時系列をもとに、モデル駆動手法やデータ駆動手法を連用いて、説明可能な心肺カップリングのパターンを同定し、統計モデルで睡眠過程を描く手法を研究開発する。さらに、睡眠段階との関連性が良い手法として睡眠段階に関する情報も提示できると期待する。最後に、開発した手法の実用性を検証するために、非接触で心電図を計測できる容量性睡眠心電計での実測実験を行い、手法の再現性、睡眠段階との関連性を検証する。

Outline of Annual Research Achievements

本研究は、心電図と光電脈拍から得られる心拍時系列と呼吸時系列のみを利用し、脳波信号を使用せずに睡眠過程を新たな視点から描くための方法を開発します。具体的には、モデル駆動およびデータ駆動手法を組み合わせ、心肺カップリングのパターンを同定し、統計モデルを用いて睡眠過程を解析する手法を研究しています。初年度の研究期間には、以下の活動を行いました。
データ取得:National Sleep Research Resource(NSRR)に申請し、Sleep Heart Health Study(SHHS)やMulti-Ethnic Study of Atherosclerosis(MESA)、NCH Sleep DataBank(NCHSDB)、Stanford Technology Analytics and Genomics in Sleep(STAGES)など複数の公開データセットから終夜の睡眠ポリグラフ検査データへのアクセス権を取得しました。これにより、1万人以上のデータを利用可能としました。
データ処理システムの構築:膨大なデータ量に対応するため、データセット毎にデータを分散処理するシステムを確立しました。分散処理フレームワークの導入が困難な研究機関の状況を踏まえ、Githubのバージョン管理技術を活用して、計算過程の一元管理を実現しました。
方法論の確立:心肺カップリングの同定に向けて、ECG-derived respirationとAir flow respirationの比較、CoherenceとPhase Coherenceの特徴生成方法を検討しました。これに基づき、適切な前処理方法の確立を目指しています。
今後は、この基盤上に構築したデータ処理と分析方法を用いて、心肺の同期や変動を詳細に分析し、心臓病や睡眠障害の診断および治療に寄与する新しい知見を得ることを目指します。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

(1) 異動に伴い研究環境の再構築には時間が必要ですが、データの確保と前期の研究は予想通り進行しています。
(2) 研究体制の再構築が完了し、次年度以降の研究は予想通りに展開できる見込みです。

Strategy for Future Research Activity

(1) ベースラインの深層学習モデルを構築し、適切な前処理方法を確定します。
(2) American Academy of Sleep Medicine (AASM)が定義する睡眠ステージに準拠した分類モデルを構築し、その検証を行います。
(3) 自己学習モデルを設計し、心肺カップリングの特徴のみによる睡眠過程を説明する手法を研究します。

Report

(1 results)
  • 2023 Research-status Report
  • Research Products

    (2 results)

All 2023

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Editorial: Discovery of digital biomarkers in the background of big data and advanced machine learning2023

    • Author(s)
      Huang Ming、Chen Wenxi、Nakamura Toru、Kimura Yuichi
    • Journal Title

      Frontiers in Physiology

      Volume: 14 Pages: 1-1

    • DOI

      10.3389/fphys.2023.1239219

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Proposed standards in Over the Counter Cuffless Blood Pressure Monitor2023

    • Author(s)
      Toshiyo Tamura, Ming Huang and Takumi Yoshimura
    • Organizer
      IEEE BHI 2023
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2023-04-13   Modified: 2024-12-25  

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