Functional Analysis of Homoeologous Genes in Hexaploid Wheat

• Project/Area Number: 23K13932
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 39010:Science in plant genetics and breeding-related
• Research Institution: Institute of Physical and Chemical Research
• Principal Investigator: 江副 晃洋 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 基礎科学特別研究員 (70913945)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2023)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2027: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000); Fiscal Year 2026: ¥390,000 (Direct Cost: ¥300,000、Indirect Cost: ¥90,000); Fiscal Year 2025: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000); Fiscal Year 2024: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000); Fiscal Year 2023: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
• Keywords: Evolution / Polyploidization / Functionalization

Outline of Research at the Start

シングルトン遺伝子は、倍数体の各ゲノムに一つだけ存在する遺伝子である。シングルトン遺伝子は特徴的な機能を持つ傾向があるため、多くのモデル生物ではシングルトン遺伝子の機能解析が進められてきた。しかし、異質六倍体コムギのシングルトン遺伝子は、他のゲノムに存在する「シングルトン同祖遺伝子」と冗長性があるため、効率的な機能解析手法の適用が困難である。本プロジェクトでは、シングルトン同祖遺伝子の性質から冗長性を検出する予測モデルを開発し、シングルトン同祖遺伝子の機能解析を行う。